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陆地植物系统发育研究的工作平台构建 被引量:1
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作者 孟珍 陈之端 +7 位作者 黎建辉 刘红梅 何星 林小光 张寿洲 李勇 胡良霖 周园春 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2010年第20期272-274,共3页
在讨论利用基因和基因组信息构建生命之树的历史推进、有效策略和方法的基础上,针对生命之树的建设进行业务流程和应用设计分析,构建面向陆地植物的系统发育平台。平台实现基因数据从国际数据库的自动获取、清洗与自测数据的提交、整理... 在讨论利用基因和基因组信息构建生命之树的历史推进、有效策略和方法的基础上,针对生命之树的建设进行业务流程和应用设计分析,构建面向陆地植物的系统发育平台。平台实现基因数据从国际数据库的自动获取、清洗与自测数据的提交、整理功能,给出系统树的流程化构建,整合数据抽提、多重序列比对、编辑清洗、分模型构树、组装评估、可视化编辑等系列分析算法和模型,经若干交互界面,得到系统树的自动生成、辅助实验决策。 展开更多
关键词 系统发育 生命之树 数据抽提 自动建树
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青锋水韭,中国水韭属一六倍体新物种 被引量:2
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作者 顾钰峰 向建英 +3 位作者 沈慧 赵国华 刘保东 严岳鸿 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期166-171,共6页
水韭属(Iso?tes)是一类世界广布的石松类植物,本文报道了在云南省发现的一个新的水韭属居群。该居群为六倍体群体,染色体数目为66条。利用扫描电镜对其进行孢子观察,发现其大孢子赤道面直径为470~500μm(平均480μm),近极面和远极面纹... 水韭属(Iso?tes)是一类世界广布的石松类植物,本文报道了在云南省发现的一个新的水韭属居群。该居群为六倍体群体,染色体数目为66条。利用扫描电镜对其进行孢子观察,发现其大孢子赤道面直径为470~500μm(平均480μm),近极面和远极面纹饰均为网格状,小孢子表面为棘刺状纹饰,与之前国内记载的六倍体物种东方水韭(Isoetes orientalis Hong Liu&Q. F. Wang)不同,基于叶绿体基因组数据重建的系统发育结构支持该物种是一个独立物种,最终将其确定为一个新物种,命名为青锋水韭(I. fengii Y. F. Gu&Y. H. Yan)。青锋水韭与二倍体云贵水韭(I. yunguiensis Q. F. Wang&W. C. Taylor)在叶和大孢子形态上较为相似,但后者的小孢子表面为瘤状突起且孢子囊为卵形;而与六倍体宽叶水韭(I. japonica A. Braun)的区别在于后者的小孢子表面光滑。青锋水韭目前仅在云南省紫溪山森林公园发现两个居群,且数目很少,根据IUCN红色名录评估标准,将青锋水韭评为极危(CR)等级。本文编制了中国已知水韭属物种的分种检索表,以期为本属物种的鉴定和保护工作提供参考。 展开更多
关键词 分类学 水韭科 濒危物种 染色体统计 青锋水韭
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基于BLAST的数据清洗与质量控制方案 被引量:1
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作者 刘奇 孟珍 +5 位作者 刘勇 董慧 林小光 杲艳平 周园春 黎建辉 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期73-75,共3页
研究基本局部比对搜索工具(BLAST)在陆地植物系统发育平台中的应用。数据清洗方面结合基于基因注释的数据抽提与基于BLAST的相似性比对抽提,提取过滤相关的序列信息,控制序列质量,并剔除原始基因注释错误的序列。自测序列质量控制方面... 研究基本局部比对搜索工具(BLAST)在陆地植物系统发育平台中的应用。数据清洗方面结合基于基因注释的数据抽提与基于BLAST的相似性比对抽提,提取过滤相关的序列信息,控制序列质量,并剔除原始基因注释错误的序列。自测序列质量控制方面结合基于blastn的打分比对和基于blastp的模板比对,报告序列整体质量,控制污染序列和假基因的入库。 展开更多
关键词 序列比对 数据清洗 基本局部比对搜索工具 陆地植物系统发育平台
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不同基肥配比对观赏向日葵生长发育的影响 被引量:1
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作者 戴耀良 邹纯清 谢锐星 《安徽农业科学》 CAS 2013年第4期1504-1505,1510,共3页
[目的]为了对观赏向日葵在南方的引种栽培提供技术参考。[方法]以从德国引进的6种观赏向日葵为材料,开展不同基肥(鸡粪、蘑菇肥、复合肥)施用对比试验,分析处理后向日葵植株生长量、生物量、花径、叶绿素含量。[结果]蘑菇肥处理对观赏... [目的]为了对观赏向日葵在南方的引种栽培提供技术参考。[方法]以从德国引进的6种观赏向日葵为材料,开展不同基肥(鸡粪、蘑菇肥、复合肥)施用对比试验,分析处理后向日葵植株生长量、生物量、花径、叶绿素含量。[结果]蘑菇肥处理对观赏向日葵生长量、花径、生物量都表现出较大的优势。[结论]蘑菇肥处理对观赏向日葵生长及效果最佳。 展开更多
关键词 观赏向日葵 基肥 生长指标 肥效
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一个测定呼吸速率装置的研究
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作者 刘伟丽 韦雪梅 +2 位作者 甘金佳 李志刚 李楠 《安徽农业科学》 CAS 2013年第6期2354-2354,共1页
[目的]为了设计可以测定植物整体或组织、器官呼吸作用的实验装置。[方法]改进LI-6400便携式测定系统的同化室,测定时将植株放入同化室内,通过测定单位时间内同化室内二氧化碳的增加量来定量测量呼吸作用。[结果]通过公式,可以计算整棵... [目的]为了设计可以测定植物整体或组织、器官呼吸作用的实验装置。[方法]改进LI-6400便携式测定系统的同化室,测定时将植株放入同化室内,通过测定单位时间内同化室内二氧化碳的增加量来定量测量呼吸作用。[结果]通过公式,可以计算整棵植株的呼吸速率。[结论]这个简便的装置可准确地测量整棵植株或组织、器官的呼吸速率。 展开更多
关键词 LI-6400 同化室 呼吸速率
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