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题名中国北方习见水母类的DNA条形码分析
被引量:20
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作者
程方平
王敏晓
王彦涛
张芳
李超伦
孙松
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机构
中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室中国科学院海洋研究所山东胶州湾海洋生态系统国家野外科学观测研究站
中国科学院研究生院
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出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期451-459,共9页
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基金
国家重点基础研究发展计划(973)项目,2011CB403601号
中国科学院知识创新工程重要方向项目群,KZCX2-YW-Q07号
+1 种基金
国家自然科学基金项目,41106133号
国家海洋公益性行业科研专项经费项目,201005018号
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文摘
本研究获得了中国北方近海习见水母类24个种共62条线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(mtCOI)序列,结合GenBank中具DNA条形码关键词的mtCOI序列,共比较了水母类mtCOI片段207条,水母mtCOI种内遗传差异在0%-7.4%之间,均值为0.9%(SD=0.014),其中约93%的个体种内差异小于4%;近源种间遗传差异在5.4%(Sarsia)到44.9%(Lensia)之间,均值为25.1%(SD=0.118),97%以上的个体种间遗传差异大于10%。绝大多数(98.8%)水母种类种内遗传差异小于种间遗传差异,条形码间隙明显。本研究涉及的中国北方习见水母种内遗传差异均显著小于种间遗传差异,结果表明以mtCOI作为DNA条形码可以实现对中国北方习见水母种类鉴定。利用DNA条形码序列分析,梳理了中国近海一些常见水母的分类地位。此外,对4种保存液保存方法的比较研究表明,90%乙醇、DMSO、RNA Safer和DNA Conserver4种保存液无法同时保存形态学特征和DNA序列,但DNA Conserver的效果相对较好。
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关键词
条形码间隙
种类鉴定
DNA条形码
水母
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Keywords
Barcode gap, Species identification, DNA barcoding, Medusa
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分类号
Q958
[生物学—动物学]
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