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中国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌分类修订中国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌分类修订
被引量:
1
1
作者
武揆
吴刚
杨祝良
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2020年第2期92-100,共9页
分布于我国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌(Leccinum rubrum)形态特异,具有潜在的食用价值。目前其物种界定仍不清晰,系统位置也未得到分子证据的支持。结合分子系统发育分析和形态观察,表明红疣柄牛肝菌应归属黄肉牛肝菌属。因此,...
分布于我国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌(Leccinum rubrum)形态特异,具有潜在的食用价值。目前其物种界定仍不清晰,系统位置也未得到分子证据的支持。结合分子系统发育分析和形态观察,表明红疣柄牛肝菌应归属黄肉牛肝菌属。因此,笔者提出了一个物种新组合:红黄肉牛肝菌Butyriboletus rubrus。另外经形态比对研究发现,日本研究者曾经发表的Boletus kermesinus其实为红黄肉牛肝菌的一个异名。
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关键词
牛肝菌科
多基因分子系统发育分析
形态
食用菌
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职称材料
基于转录组的疏花软紫草低拷贝核基因引物开发
被引量:
2
2
作者
付义
何承忠
+1 位作者
巨苗苗
田斌
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016年第3期86-90,共5页
基于高通量的转录组测序,为大量并快速的开发分子标记提供契机。本研究对紫草科植物疏花软紫草进行转录组测序,共得到92 042 086条reads,从疏花软紫草158 446个Unigene中搜索到332个低拷贝核基因。为进行多态性验证,从中随机挑选30个设...
基于高通量的转录组测序,为大量并快速的开发分子标记提供契机。本研究对紫草科植物疏花软紫草进行转录组测序,共得到92 042 086条reads,从疏花软紫草158 446个Unigene中搜索到332个低拷贝核基因。为进行多态性验证,从中随机挑选30个设计引物,并对3个疏花软紫草种群共9个个体进行PCR扩增,结果发现其中16对引物能够扩增出单一稳定的目的条带,从中随机挑选7个片段进行群体测序并计算DNA多态性。结果表明,7对引物的多态性位点平均值为6.57,单倍型平均值为5.14,单倍型多态性(HD)在0.389~0.944之间,核苷酸多态性(Pi)为0.001 48~0.017 23。通过转录组测序技术开发的低拷贝核基因有较高的多态性,且可以有效地运用于群体遗传学和谱系地理学研究中。另外,这些低拷贝核基因能够被运用于软紫草属植物系统发育重建以及物种形成等研究工作中。
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关键词
疏花软紫草
转录组
低拷贝核基因
引物
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职称材料
题名
中国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌分类修订中国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌分类修订
被引量:
1
1
作者
武揆
吴刚
杨祝良
机构
中国科学院昆明植物研究所
云南省真菌
多样性
与绿色发展
重点
实验室
中国科学院
大学
出处
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2020年第2期92-100,共9页
基金
中国科学院国际合作局对外合作重点项目(151853KYSB20170026)
云南“万人计划”青年拔尖人才项目
+3 种基金
国家自然科学基金面上项目(31970015)
云南省基础研究计划项目(2017FB023)
中国科学院青年创新促进会项目(2017436)
生态环境部“生物多样性调查与评估”项目(2019-2023)。
文摘
分布于我国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌(Leccinum rubrum)形态特异,具有潜在的食用价值。目前其物种界定仍不清晰,系统位置也未得到分子证据的支持。结合分子系统发育分析和形态观察,表明红疣柄牛肝菌应归属黄肉牛肝菌属。因此,笔者提出了一个物种新组合:红黄肉牛肝菌Butyriboletus rubrus。另外经形态比对研究发现,日本研究者曾经发表的Boletus kermesinus其实为红黄肉牛肝菌的一个异名。
关键词
牛肝菌科
多基因分子系统发育分析
形态
食用菌
Keywords
Boletaceae
multi-gene molecular phylogeny
morphology
edible mushroom
分类号
TS219 [轻工技术与工程—粮食、油脂及植物蛋白工程]
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职称材料
题名
基于转录组的疏花软紫草低拷贝核基因引物开发
被引量:
2
2
作者
付义
何承忠
巨苗苗
田斌
机构
西南林业大学云南省云南省高校林木遗传改良与繁育
重点
实验室
国家林业局西南地区
生物
多样性
保育
重点
实验室
中国科学院昆明植物研究所中国科学院东亚植物多样性与生物地理学重点实验室
出处
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016年第3期86-90,共5页
基金
云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室研究生开放基金(YNGB201507)资助
西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室开放基金资助
文摘
基于高通量的转录组测序,为大量并快速的开发分子标记提供契机。本研究对紫草科植物疏花软紫草进行转录组测序,共得到92 042 086条reads,从疏花软紫草158 446个Unigene中搜索到332个低拷贝核基因。为进行多态性验证,从中随机挑选30个设计引物,并对3个疏花软紫草种群共9个个体进行PCR扩增,结果发现其中16对引物能够扩增出单一稳定的目的条带,从中随机挑选7个片段进行群体测序并计算DNA多态性。结果表明,7对引物的多态性位点平均值为6.57,单倍型平均值为5.14,单倍型多态性(HD)在0.389~0.944之间,核苷酸多态性(Pi)为0.001 48~0.017 23。通过转录组测序技术开发的低拷贝核基因有较高的多态性,且可以有效地运用于群体遗传学和谱系地理学研究中。另外,这些低拷贝核基因能够被运用于软紫草属植物系统发育重建以及物种形成等研究工作中。
关键词
疏花软紫草
转录组
低拷贝核基因
引物
Keywords
Arnebia szechenyi, transcriptome, low-copy nuclear gene, primer
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌分类修订中国西南亚高山针叶林中的红疣柄牛肝菌分类修订
武揆
吴刚
杨祝良
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2020
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于转录组的疏花软紫草低拷贝核基因引物开发
付义
何承忠
巨苗苗
田斌
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016
2
在线阅读
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职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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