-
题名新疆野苹果NAC基因分析及抗腐烂病基因筛选
被引量：3
- 1
-
-
作者
周童
李小双
刘晓洁
丁雨
文雪静
张道远
-
机构
中国科学院新疆生态与地理研究所·荒漠与绿洲生态国家重点实验室
石河子大学生命科学学院
中国科学院吐鲁番沙漠植物园
中国科学院大学
-
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第8期1111-1121,共11页
-
基金
中国科学院西部之光项目(2016-QNXZ-B-17)
国家重点研发计划(2016YFC0501505)。
-
文摘
【目的】探明新疆野苹果(Malus sieversii)中NAC基因资源,筛选潜在的抗腐烂病NAC基因。【方法】以模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)的NAC蛋白为种子构建隐马可夫模型,从新疆野苹果转录组数据库中鉴定NAC转录因子,利用Protparam及qRT-PCR等手段对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、系统进化及腐烂病菌侵染后的表达谱进行分析。【结果】从新疆野苹果中鉴定到165个NAC基因,根据蛋白系统进化关系分为12个亚组,且MsNACs在各亚组间分布不均。蛋白理化性质分析结果表明,MsNACs大多属酸性,且多为亲水性蛋白。保守基序分析结果表明,大多数MsNAC转录因子拥有由7个保守基序组成的完整NAC结构域,少数存在亚结构域的缺失。膜结合域分析结果表明,有18个MsNACs蛋白具有膜结合域,且大多定位于细胞核,少数定位于内质网、线粒体等其他细胞器。表达分析结果表明,34个MsNACs在腐烂病菌侵染后差异表达,可根据表达模式分为A、B、C三个亚簇,其中MsNAC073和MsNAC102表达变化剧烈,分别在5 dpi下调近6倍和上调近140倍。【结论】基于新疆野苹果转录组数据,首次对MsNAC家族基因进行鉴定、分类和表达量分析,为新疆野苹果抗病响应关键NAC基因的功能研究奠定了基础,也为其他物种中抗病基因的筛选提供了参考。
-
关键词
新疆野苹果
NAC转录因子
苹果腐烂病
抗病基因
-
Keywords
Malus sieversii
NAC transcriptional factor
Apple tree Cytospora canker(Cytospora mali)
Resistance genes
-
分类号
S661.1
[农业科学—果树学]
-
