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铁皮石斛多糖与Toll样受体4互作机制的计算模拟
1
作者
崔萌菲
张悦
+8 位作者
张志宇
许慧敏
刘翠
成颖
李居行
刘欢欢
贺超
郭庆彬
刘岯
《食品研究与开发》
CAS
2024年第5期15-21,共7页
为研究铁皮石斛多糖(Dendrobium officinale polysaccharide,DOP)具有免疫活性片段的结构特征及与Toll样受体4(Toll⁃like receptor 4,TLR4)的相互作用机制,基于对TLR4结合腔的亲疏水性分析,将DOP寡糖的分为疏水片段筛选和亲水片段筛选,...
为研究铁皮石斛多糖(Dendrobium officinale polysaccharide,DOP)具有免疫活性片段的结构特征及与Toll样受体4(Toll⁃like receptor 4,TLR4)的相互作用机制,基于对TLR4结合腔的亲疏水性分析,将DOP寡糖的分为疏水片段筛选和亲水片段筛选,通过分子对接和分子动力学模拟,分析作用最强的DOP片段的结构特征及与TLR4的相互作用机制。结果表明,找到作用最强的DOP七糖片段,具有与经典底物脂多糖相似的结合模式,其中疏水性四糖片段结合在疏水结合腔,亲水性三糖片段结合在电正性区域。具有潜在免疫活性的铁皮石斛多糖可以由乙酰基修饰的疏水四糖片段和没有乙酰基修饰的亲水三糖片段组成,主要通过氢键和疏水作用与TLR4进行相互作用,发挥免疫活性。
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关键词
TOLL样受体4
铁皮石斛多糖
分子对接
分子动力学模拟
互作机制
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职称材料
题名
铁皮石斛多糖与Toll样受体4互作机制的计算模拟
1
作者
崔萌菲
张悦
张志宇
许慧敏
刘翠
成颖
李居行
刘欢欢
贺超
郭庆彬
刘岯
机构
天津
科技大学食品
科学
与工程
学院
天津
科技大学
生物
工程
学院
中国科学院
天津
工业
生物技术
研究所
低碳制造工程
生物
学重点实验室
生物
设计
中心
天津
益膳康
生物
科技有限公司
中国科学院天津工业生物技术研究所人工合成淀粉研究中心
出处
《食品研究与开发》
CAS
2024年第5期15-21,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(32072173)
国家重点研发计划(2018YFA0901400)。
文摘
为研究铁皮石斛多糖(Dendrobium officinale polysaccharide,DOP)具有免疫活性片段的结构特征及与Toll样受体4(Toll⁃like receptor 4,TLR4)的相互作用机制,基于对TLR4结合腔的亲疏水性分析,将DOP寡糖的分为疏水片段筛选和亲水片段筛选,通过分子对接和分子动力学模拟,分析作用最强的DOP片段的结构特征及与TLR4的相互作用机制。结果表明,找到作用最强的DOP七糖片段,具有与经典底物脂多糖相似的结合模式,其中疏水性四糖片段结合在疏水结合腔,亲水性三糖片段结合在电正性区域。具有潜在免疫活性的铁皮石斛多糖可以由乙酰基修饰的疏水四糖片段和没有乙酰基修饰的亲水三糖片段组成,主要通过氢键和疏水作用与TLR4进行相互作用,发挥免疫活性。
关键词
TOLL样受体4
铁皮石斛多糖
分子对接
分子动力学模拟
互作机制
Keywords
toll⁃like receptor 4(TLR4)
Dendrobium officinale polysaccharide(DOP)
molecular docking
molecular dynamics simulation
interaction mechanism
分类号
TS201.2 [轻工技术与工程—食品科学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
铁皮石斛多糖与Toll样受体4互作机制的计算模拟
崔萌菲
张悦
张志宇
许慧敏
刘翠
成颖
李居行
刘欢欢
贺超
郭庆彬
刘岯
《食品研究与开发》
CAS
2024
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