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题名基于稳定同位素标记的蛋白质组学定量方法研究进展
被引量：12
- 1
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作者
周愿
单亦初
张丽华
张玉奎
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机构
中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析化学重点实验室国家色谱研究分析中心
中国科学院大学
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出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期496-502,共7页
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基金
国家重大科学计划"蛋白质定量新方法及相关技术研究"项目(2012CB910604)
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文摘
定量蛋白质组学已经成为后基因时代的重要研究方向之一。目前该领域的研究主要采用无标记定量方法和稳定同位素标记定量法。其中,基于稳定同位素标记的蛋白质组定量方法发展非常迅速,已为生命科学研究提供了重要的技术支撑。本文分析了基于稳定同位素标记的蛋白质组学定量方法,包括相对定量方法和绝对定量方法,并对其发展进行了展望。
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关键词
定量蛋白质组学
稳定同位素标记
相对定量
绝对定量
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Keywords
quantitative proteomics
stable isotope labeling
relative quantitative
absolute quantitative
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分类号
O658
[理学—分析化学]
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题名选择性反应监测技术在蛋白质组学研究中的进展及应用
被引量：2
- 2
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作者
单亦初
张丽华
张玉奎
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机构
中国科学院大连化学物理研究所 中国科学院分离分析化学重点实验室 国家色谱研究分析中心
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出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期330-335,共6页
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基金
国家重大科学计划“蛋白质定量新方法及相关技术研究”项目(2012CB910604)
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文摘
选择性反应监测(SRM)技术作为一种重要的定向蛋白质分析技术,通过选择性检测特定母离子和子离子来排除非目标组分的干扰,增强了检测灵敏度和定量准确度,具有选择性高、重复性好、灵敏度高、动态范围宽等优点,已被广泛应用于定量蛋白质组学研究,在生命科学领域发挥着至关重要的作用。本文从分析通量、检测灵敏度、定量方法以及相关软件资源4个方面,对近期SRM技术的研究进展进行了综述。然后,对SRM技术在蛋白质组学研究包括生物标志物验证、蛋白质翻译后修饰研究、生物工程以及信号通路分析等领域中的应用进行了概述。最后,本文对SRM技术的应用以及发展前景进行了展望。
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关键词
选择性反应监测
蛋白质组
定量
综述
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Keywords
selective reaction monitoring（SRM）
proteomics
quantification
review
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分类号
O658
[理学—分析化学]
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题名集成化蛋白质组定量分析平台的构建及应用
被引量：1
- 3
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作者
周愿
张珅
袁辉明
张丽华
张玉奎
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机构
中国科学院大连化学物理研究所 中国科学院分离分析化学重点实验室 国家色谱研究分析中心
中国科学院大学
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出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期355-360,共6页
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基金
国家重大科学研究计划(2012CB910604)
国家重大科学仪器设备开发专项(2012YQ120044-2)
国家自然科学基金项目(21190043)
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文摘
为提高蛋白质组定量分析的准确度、通量和自动化程度,构建了由微升级混合离子交换色谱、亲水型固定化酶反应器(hIMER)和纳升级反相色谱-电喷雾串级质谱(nanoRPLC-ESI-MS/MS)组成的集成化蛋白质定量分析平台。该平台实现了二甲基化标记蛋白质样品在线分离、酶解、肽段分离鉴定和定量分析。采用质量比为1∶1的轻、重标记的蛋白质样品考察该平台的定量性能,发现蛋白质水平二甲基化标记效率为90%;蛋白质经hIMER在线酶解10 min产生的漏切及酶解产物在hIMER柱上的非特异性吸附对定量准确度的影响较小,所有定量到的重/轻标记的蛋白质质量比的平均值为1.01。最后将该平台应用于小鼠腹水型肝癌淋巴道高、低转移细胞系差异蛋白质的分析,发现了12种蛋白质在高转移细胞系中低表达,15种蛋白质在高转移细胞系中高表达。以上结果证明了该平台可以实现高准确度和高通量的蛋白质组定量分析。
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关键词
集成化蛋白质组定量分析平台
蛋白质标记
定量蛋白质组学
亲水型固定化酶反应器
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Keywords
integrated proteome quantification platform
protein labeling
quantitative pro-teomics
hydrophilic immobilized enzymatic reactor（hIMER）
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分类号
O658
[理学—分析化学]
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题名蛋白质甲基化修饰的蛋白质组学分析方法新进展
被引量：3
- 4
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作者
王科云
叶明亮
邹汉法
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机构
中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析化学重点实验室国家色谱研究分析中心
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出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期1161-1167,共7页
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基金
基金委杰出青年基金(21525524)
国家重点研发计划(2016YFA0501402)~~
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文摘
蛋白质的甲基化修饰是一类重要的翻译后修饰。但与磷酸化、糖基化和泛素化等翻译后修饰相比,甲基化修饰的蛋白质组学分析方法开发还是一个较新的研究领域。近几年,由于甲基化修饰在表观遗传调控中的重要作用,这一修饰类型得到了越来越多的关注,相关的分析技术和分析方法也取得了较多进展。其中,基于质谱的蛋白质组学分析方法在甲基化修饰中发挥着关键的作用,实现了这一甲基化修饰的高通量分析。该综述将从甲基化修饰的分离富集、假阳性率控制以及定量蛋白质组学等方面对一些蛋白质甲基化修饰的分析技术和方法的最新进展进行介绍。
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关键词
蛋白质甲基化修饰
选择性富集
可信度控制
定量蛋白组学
综述
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Keywords
protein methylation
selective enrichment
confidence controlling
quantitative proteomics
review
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分类号
O658
[理学—分析化学]
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