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土壤宏病毒组的研究方法与进展 被引量:3
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作者 祁慧鹓 郑晓璇 +6 位作者 孙明明 王金锋 马迎飞 朱冬 王风贺 蒋新 叶茂 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期568-577,共10页
土壤是病毒遗传多样性的储存库,但由于土壤自身特性及技术手段的限制,基于传统培养方法对土壤病毒的研究及功能认知存在局限性。宏病毒组学技术能直接从土壤环境样品中获取病毒基因组,随后通过高通量测序、拼接组装、ORF预测,最终可对... 土壤是病毒遗传多样性的储存库,但由于土壤自身特性及技术手段的限制,基于传统培养方法对土壤病毒的研究及功能认知存在局限性。宏病毒组学技术能直接从土壤环境样品中获取病毒基因组,随后通过高通量测序、拼接组装、ORF预测,最终可对病毒基因进行功能注释,极大地丰富了对土壤病毒功能的认识。本文在阐释土壤病毒DNA提取、测序与病毒判别、功能基因注释等研究方法的基础上,重点探讨了单株噬菌体基因组,及近年来国内外土壤与极端陆地环境中宏病毒组研究进展。并对土壤宏病毒基因组研究的前沿和发展趋势进行了总结,强调了土壤病毒研究的整体化、技术流程规范化以及病毒资源库完善化的重要性。 展开更多
关键词 土壤病毒 噬菌体 宏病毒组 功能基因 注释
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新型功能蛋白BST2研究进展 被引量:1
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作者 王瑞红 史国利 +2 位作者 程浩 范炜 路浩 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2014年第2期81-84,共4页
BST2是一种新发现的免疫应答因子,对囊膜病毒具有天然免疫作用。二聚体化的BST2一端固定于细胞的细胞膜上,另一端与病毒相结合,这种结构上的特点是其阻止病毒出细胞膜的关键。研究显示,病毒在与BST2的对峙中产生了抑制作用,例如Nef、Env... BST2是一种新发现的免疫应答因子,对囊膜病毒具有天然免疫作用。二聚体化的BST2一端固定于细胞的细胞膜上,另一端与病毒相结合,这种结构上的特点是其阻止病毒出细胞膜的关键。研究显示,病毒在与BST2的对峙中产生了抑制作用,例如Nef、Env、Vpu、nsP1和K5等蛋白都具有对BST2的拮抗功能。而近期也发现BST2还具有许多新的功能,尤其是协助人巨细胞病毒(HCMV)入侵细胞,更是引起了广泛关注。论文结合国际上最新的BST2研究进展,从结构特点、功能特点、拮抗机制和应用前景等方面进行了深入探讨。 展开更多
关键词 BST2 病毒 抑制
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人食管鳞癌中CCNYL1启动子区甲基化研究
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作者 沈笑 韩旭 +2 位作者 李先锋 詹启敏 童彤 《中国医药导报》 CAS 2016年第15期4-8,F0003,共6页
目的筛选在食管鳞状细胞癌(ESCC)发病过程中异常甲基化基因,为治疗提供潜在靶点。方法采用简化的、具有代表性的DNA甲基化测序(RRBS)及基因表达谱芯片分析7例ESCC患者癌组织及其癌旁DNA甲基化水平和m RNA表达水平。将甲基化差异基因及... 目的筛选在食管鳞状细胞癌(ESCC)发病过程中异常甲基化基因,为治疗提供潜在靶点。方法采用简化的、具有代表性的DNA甲基化测序(RRBS)及基因表达谱芯片分析7例ESCC患者癌组织及其癌旁DNA甲基化水平和m RNA表达水平。将甲基化差异基因及表达差异基因用DAVID工具进行功能富集分析,筛出甲基化与表达负相关基因。对候选基因进行硫化测序PCR(BSP)验证获得DMR序列,采用QUMA分析软件对17对癌和癌旁甲基化差异测序结果进行分析,并对其DMR单个Cp G位点的甲基化水平进行统计学分析。最后采用实时定量PCR(RT-PCR)检测候选基因表达水平。结果 RRBS测序得到癌和癌旁差异甲基化区基因共5268个,其中689个差异甲基化区位于Promoter及CDS上。这些富集得到15条显著信号通路,包括Notch信号通路、Wnt信号通路及黏着斑信号通路等肿瘤中常见信号通路。结合7例ESCC组织表达谱芯片,筛选出启动子区高甲基化且表达降低基因Cyclin Y-like 1(CCNYL1),在17对ESCC组织中用BSP验证,CCNYL1基因DMR处Cp G位点13、Cp G位点16、Cp G位点17、Cp G位点18和Cp G位点19呈现高甲基化。此外,在10对冰冻ESCC组织中进行RT-PCR检测,结果与RRBS测序和表达谱芯片一致,在ESCC中CCNYL1基因启动子区甲基化水平整体高于癌旁组织,并且表达水平低于癌旁组织。结论 CCNYL1基因甲基化水平可能作为ESCC生物标志物。 展开更多
关键词 DNA甲基化 差异甲基化区 食管鳞状细胞癌 CCNYL1
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应激性心肌病亚型及发病机制新认识 被引量:10
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作者 房加雄 齐跃 +6 位作者 于慧春 田泽君 刘子泉 吕琪 胡远兵 王杰思 李贺 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 2016年第3期317-320,共4页
应激性心肌病是较常见的急性心血管病事件,心理、躯体应激、疾病、药物等多种病因均可诱发。早在古时圣经时代、古罗马时期,20世纪40及60年代,学者就已用伤心综合征、“悲伤心脏”描述心理应激与死亡关系,到80年代初Cebelin等报道... 应激性心肌病是较常见的急性心血管病事件,心理、躯体应激、疾病、药物等多种病因均可诱发。早在古时圣经时代、古罗马时期,20世纪40及60年代,学者就已用伤心综合征、“悲伤心脏”描述心理应激与死亡关系,到80年代初Cebelin等报道了无冠心病突然死亡的应激性心肌病病例。该病发病时左心室收缩常呈现特征性章鱼瓶形态,90年代日本学者Sato等首先用章鱼瓶心肌病描述本病典型特征。 展开更多
关键词 心肌疾病 Takotsubo心肌病 急性冠状动脉综合征 心肌梗死 肌钙蛋白
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