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土壤宏病毒组的研究方法与进展
被引量:
3
1
作者
祁慧鹓
郑晓璇
+6 位作者
孙明明
王金锋
马迎飞
朱冬
王风贺
蒋新
叶茂
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期568-577,共10页
土壤是病毒遗传多样性的储存库,但由于土壤自身特性及技术手段的限制,基于传统培养方法对土壤病毒的研究及功能认知存在局限性。宏病毒组学技术能直接从土壤环境样品中获取病毒基因组,随后通过高通量测序、拼接组装、ORF预测,最终可对...
土壤是病毒遗传多样性的储存库,但由于土壤自身特性及技术手段的限制,基于传统培养方法对土壤病毒的研究及功能认知存在局限性。宏病毒组学技术能直接从土壤环境样品中获取病毒基因组,随后通过高通量测序、拼接组装、ORF预测,最终可对病毒基因进行功能注释,极大地丰富了对土壤病毒功能的认识。本文在阐释土壤病毒DNA提取、测序与病毒判别、功能基因注释等研究方法的基础上,重点探讨了单株噬菌体基因组,及近年来国内外土壤与极端陆地环境中宏病毒组研究进展。并对土壤宏病毒基因组研究的前沿和发展趋势进行了总结,强调了土壤病毒研究的整体化、技术流程规范化以及病毒资源库完善化的重要性。
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关键词
土壤病毒
噬菌体
宏病毒组
功能基因
注释
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职称材料
新型功能蛋白BST2研究进展
被引量:
1
2
作者
王瑞红
史国利
+2 位作者
程浩
范炜
路浩
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2014年第2期81-84,共4页
BST2是一种新发现的免疫应答因子,对囊膜病毒具有天然免疫作用。二聚体化的BST2一端固定于细胞的细胞膜上,另一端与病毒相结合,这种结构上的特点是其阻止病毒出细胞膜的关键。研究显示,病毒在与BST2的对峙中产生了抑制作用,例如Nef、Env...
BST2是一种新发现的免疫应答因子,对囊膜病毒具有天然免疫作用。二聚体化的BST2一端固定于细胞的细胞膜上,另一端与病毒相结合,这种结构上的特点是其阻止病毒出细胞膜的关键。研究显示,病毒在与BST2的对峙中产生了抑制作用,例如Nef、Env、Vpu、nsP1和K5等蛋白都具有对BST2的拮抗功能。而近期也发现BST2还具有许多新的功能,尤其是协助人巨细胞病毒(HCMV)入侵细胞,更是引起了广泛关注。论文结合国际上最新的BST2研究进展,从结构特点、功能特点、拮抗机制和应用前景等方面进行了深入探讨。
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关键词
BST2
病毒
抑制
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职称材料
人食管鳞癌中CCNYL1启动子区甲基化研究
3
作者
沈笑
韩旭
+2 位作者
李先锋
詹启敏
童彤
《中国医药导报》
CAS
2016年第15期4-8,F0003,共6页
目的筛选在食管鳞状细胞癌(ESCC)发病过程中异常甲基化基因,为治疗提供潜在靶点。方法采用简化的、具有代表性的DNA甲基化测序(RRBS)及基因表达谱芯片分析7例ESCC患者癌组织及其癌旁DNA甲基化水平和m RNA表达水平。将甲基化差异基因及...
目的筛选在食管鳞状细胞癌(ESCC)发病过程中异常甲基化基因,为治疗提供潜在靶点。方法采用简化的、具有代表性的DNA甲基化测序(RRBS)及基因表达谱芯片分析7例ESCC患者癌组织及其癌旁DNA甲基化水平和m RNA表达水平。将甲基化差异基因及表达差异基因用DAVID工具进行功能富集分析,筛出甲基化与表达负相关基因。对候选基因进行硫化测序PCR(BSP)验证获得DMR序列,采用QUMA分析软件对17对癌和癌旁甲基化差异测序结果进行分析,并对其DMR单个Cp G位点的甲基化水平进行统计学分析。最后采用实时定量PCR(RT-PCR)检测候选基因表达水平。结果 RRBS测序得到癌和癌旁差异甲基化区基因共5268个,其中689个差异甲基化区位于Promoter及CDS上。这些富集得到15条显著信号通路,包括Notch信号通路、Wnt信号通路及黏着斑信号通路等肿瘤中常见信号通路。结合7例ESCC组织表达谱芯片,筛选出启动子区高甲基化且表达降低基因Cyclin Y-like 1(CCNYL1),在17对ESCC组织中用BSP验证,CCNYL1基因DMR处Cp G位点13、Cp G位点16、Cp G位点17、Cp G位点18和Cp G位点19呈现高甲基化。此外,在10对冰冻ESCC组织中进行RT-PCR检测,结果与RRBS测序和表达谱芯片一致,在ESCC中CCNYL1基因启动子区甲基化水平整体高于癌旁组织,并且表达水平低于癌旁组织。结论 CCNYL1基因甲基化水平可能作为ESCC生物标志物。
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关键词
DNA甲基化
差异甲基化区
食管鳞状细胞癌
CCNYL1
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职称材料
应激性心肌病亚型及发病机制新认识
被引量:
10
4
作者
房加雄
齐跃
+6 位作者
于慧春
田泽君
刘子泉
吕琪
胡远兵
王杰思
李贺
《中华老年心脑血管病杂志》
CAS
2016年第3期317-320,共4页
应激性心肌病是较常见的急性心血管病事件,心理、躯体应激、疾病、药物等多种病因均可诱发。早在古时圣经时代、古罗马时期,20世纪40及60年代,学者就已用伤心综合征、“悲伤心脏”描述心理应激与死亡关系,到80年代初Cebelin等报道...
应激性心肌病是较常见的急性心血管病事件,心理、躯体应激、疾病、药物等多种病因均可诱发。早在古时圣经时代、古罗马时期,20世纪40及60年代,学者就已用伤心综合征、“悲伤心脏”描述心理应激与死亡关系,到80年代初Cebelin等报道了无冠心病突然死亡的应激性心肌病病例。该病发病时左心室收缩常呈现特征性章鱼瓶形态,90年代日本学者Sato等首先用章鱼瓶心肌病描述本病典型特征。
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关键词
心肌疾病
Takotsubo心肌病
急性冠状动脉综合征
心肌梗死
肌钙蛋白
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职称材料
题名
土壤宏病毒组的研究方法与进展
被引量:
3
1
作者
祁慧鹓
郑晓璇
孙明明
王金锋
马迎飞
朱冬
王风贺
蒋新
叶茂
机构
中国科学院
南京土壤
研究
所
中国科学院
大学
南京农业大学资源与环境
科学
学院
中国科学院北京生命科学研究院
中国科学院
深圳先进技术
研究院
中国科学院
生态环境
研究
中心
南京师范大学环境
学院
出处
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期568-577,共10页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFC1803100)
中国科协青年人才托举工程(2018QNRC001)
国家自然科学基金面上项目(41771350)资助。
文摘
土壤是病毒遗传多样性的储存库,但由于土壤自身特性及技术手段的限制,基于传统培养方法对土壤病毒的研究及功能认知存在局限性。宏病毒组学技术能直接从土壤环境样品中获取病毒基因组,随后通过高通量测序、拼接组装、ORF预测,最终可对病毒基因进行功能注释,极大地丰富了对土壤病毒功能的认识。本文在阐释土壤病毒DNA提取、测序与病毒判别、功能基因注释等研究方法的基础上,重点探讨了单株噬菌体基因组,及近年来国内外土壤与极端陆地环境中宏病毒组研究进展。并对土壤宏病毒基因组研究的前沿和发展趋势进行了总结,强调了土壤病毒研究的整体化、技术流程规范化以及病毒资源库完善化的重要性。
关键词
土壤病毒
噬菌体
宏病毒组
功能基因
注释
Keywords
Soil virus
Phage
Viral metagenome
Functional gene
Annotation
分类号
S154.3 [农业科学—土壤学]
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职称材料
题名
新型功能蛋白BST2研究进展
被引量:
1
2
作者
王瑞红
史国利
程浩
范炜
路浩
机构
河北省动物卫生监督所
日本浜松医科大学
中国科学院北京生命科学研究院
中国科学院
前沿
科学
与教育局
出处
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2014年第2期81-84,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31101818)
文摘
BST2是一种新发现的免疫应答因子,对囊膜病毒具有天然免疫作用。二聚体化的BST2一端固定于细胞的细胞膜上,另一端与病毒相结合,这种结构上的特点是其阻止病毒出细胞膜的关键。研究显示,病毒在与BST2的对峙中产生了抑制作用,例如Nef、Env、Vpu、nsP1和K5等蛋白都具有对BST2的拮抗功能。而近期也发现BST2还具有许多新的功能,尤其是协助人巨细胞病毒(HCMV)入侵细胞,更是引起了广泛关注。论文结合国际上最新的BST2研究进展,从结构特点、功能特点、拮抗机制和应用前景等方面进行了深入探讨。
关键词
BST2
病毒
抑制
Keywords
bone marrow stromal-cell antigen 2 virus
inhibition
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
人食管鳞癌中CCNYL1启动子区甲基化研究
3
作者
沈笑
韩旭
李先锋
詹启敏
童彤
机构
国家癌症中心
北京
协和医
学院
中国
医学
科学院
肿瘤医院
中国科学院北京生命科学研究院
出处
《中国医药导报》
CAS
2016年第15期4-8,F0003,共6页
基金
国家重大科学研究计划项目(2013CB910703)
文摘
目的筛选在食管鳞状细胞癌(ESCC)发病过程中异常甲基化基因,为治疗提供潜在靶点。方法采用简化的、具有代表性的DNA甲基化测序(RRBS)及基因表达谱芯片分析7例ESCC患者癌组织及其癌旁DNA甲基化水平和m RNA表达水平。将甲基化差异基因及表达差异基因用DAVID工具进行功能富集分析,筛出甲基化与表达负相关基因。对候选基因进行硫化测序PCR(BSP)验证获得DMR序列,采用QUMA分析软件对17对癌和癌旁甲基化差异测序结果进行分析,并对其DMR单个Cp G位点的甲基化水平进行统计学分析。最后采用实时定量PCR(RT-PCR)检测候选基因表达水平。结果 RRBS测序得到癌和癌旁差异甲基化区基因共5268个,其中689个差异甲基化区位于Promoter及CDS上。这些富集得到15条显著信号通路,包括Notch信号通路、Wnt信号通路及黏着斑信号通路等肿瘤中常见信号通路。结合7例ESCC组织表达谱芯片,筛选出启动子区高甲基化且表达降低基因Cyclin Y-like 1(CCNYL1),在17对ESCC组织中用BSP验证,CCNYL1基因DMR处Cp G位点13、Cp G位点16、Cp G位点17、Cp G位点18和Cp G位点19呈现高甲基化。此外,在10对冰冻ESCC组织中进行RT-PCR检测,结果与RRBS测序和表达谱芯片一致,在ESCC中CCNYL1基因启动子区甲基化水平整体高于癌旁组织,并且表达水平低于癌旁组织。结论 CCNYL1基因甲基化水平可能作为ESCC生物标志物。
关键词
DNA甲基化
差异甲基化区
食管鳞状细胞癌
CCNYL1
Keywords
DNA methylation
Differentially methylated regions
Esophageal squamous cell carcinoma
CCNYL1
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
应激性心肌病亚型及发病机制新认识
被引量:
10
4
作者
房加雄
齐跃
于慧春
田泽君
刘子泉
吕琪
胡远兵
王杰思
李贺
机构
武警后勤
学院
附属医院老年病科
天津市西青医院老年病科
河北医科大学第二附属医院心内科
武警部队救援医学
研究
所
武警成都医院神经内科
中国科学院北京生命科学研究院
心理
研究
所
出处
《中华老年心脑血管病杂志》
CAS
2016年第3期317-320,共4页
基金
天津市卫生局科技基金项目(2013KZ132)
武警后勤学院附属医院科研基金项目(FYM201412)
文摘
应激性心肌病是较常见的急性心血管病事件,心理、躯体应激、疾病、药物等多种病因均可诱发。早在古时圣经时代、古罗马时期,20世纪40及60年代,学者就已用伤心综合征、“悲伤心脏”描述心理应激与死亡关系,到80年代初Cebelin等报道了无冠心病突然死亡的应激性心肌病病例。该病发病时左心室收缩常呈现特征性章鱼瓶形态,90年代日本学者Sato等首先用章鱼瓶心肌病描述本病典型特征。
关键词
心肌疾病
Takotsubo心肌病
急性冠状动脉综合征
心肌梗死
肌钙蛋白
分类号
R542.2 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
土壤宏病毒组的研究方法与进展
祁慧鹓
郑晓璇
孙明明
王金锋
马迎飞
朱冬
王风贺
蒋新
叶茂
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
新型功能蛋白BST2研究进展
王瑞红
史国利
程浩
范炜
路浩
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2014
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
人食管鳞癌中CCNYL1启动子区甲基化研究
沈笑
韩旭
李先锋
詹启敏
童彤
《中国医药导报》
CAS
2016
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
应激性心肌病亚型及发病机制新认识
房加雄
齐跃
于慧春
田泽君
刘子泉
吕琪
胡远兵
王杰思
李贺
《中华老年心脑血管病杂志》
CAS
2016
10
在线阅读
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职称材料
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