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江西新岗山森林昆虫种内遗传距离研究
被引量:
2
1
作者
马奉
周青松
+8 位作者
曹焕喜
陈婧婷
王明强
谢婷婷
杨娟娟
陶双伦
张峰
罗阿蓉
朱朝东
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023年第4期1027-1037,共11页
DNA条形码目前广泛用于昆虫多样性研究。本研究采用DNA条形码(即线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因COI 5′端),通过比较所获分子分类操作单元(Molecular operational taxonomic units,MOTU)的种内遗传距离,探究DNA条形码在亚热带森林(位...
DNA条形码目前广泛用于昆虫多样性研究。本研究采用DNA条形码(即线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因COI 5′端),通过比较所获分子分类操作单元(Molecular operational taxonomic units,MOTU)的种内遗传距离,探究DNA条形码在亚热带森林(位于我国江西省新岗山)不同昆虫类群中的物种鉴定和界定效用。数据分析中结合数据库比对信息,采用jMOTU、ABGD、bPTP、GMYC这4种物种界定方法获得MOTU,从而开展种内遗传距离分析。本研究共挑选出479个昆虫样本,获得475条COI序列,经NCBI、BOLD在线数据库比对属于6个目,与形态初步划分一致;物种界定分析获得288个MOTU,其中鳞翅目最多,达85个,膜翅目、双翅目、半翅目、鞘翅目次之,分别为80、74、21和20个,直翅目最少,仅8个。膜翅目和双翅目的种内遗传距离均值及标准偏差较大(膜翅目:0.89%±0.87%;双翅目:0.73%±0.58%),鳞翅目的最小(0.28%±0.20%)。研究表明:不同昆虫类群的种内遗传距离虽然整体在一定范围,但仍然存在一定的差异,因此不能笼统地依靠遗传距离的距离阈值进行物种划分;现有数据库需要补充足够的昆虫物种信息,才能提升物种鉴定效率。本研究丰富了亚热带森林昆虫分子数据库,同时也为进一步探索基于分子分类学开展昆虫多样性研究提供了基础数据和参考。
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关键词
DNA条形码
种内遗传距离
物种界定
昆虫
亚热带森林
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职称材料
题名
江西新岗山森林昆虫种内遗传距离研究
被引量:
2
1
作者
马奉
周青松
曹焕喜
陈婧婷
王明强
谢婷婷
杨娟娟
陶双伦
张峰
罗阿蓉
朱朝东
机构
吉首大学生物
资源
与环境
科学
学院
中国科学院动物研究所
动物
进化与系统学(院)重点实验室
中国科学院动物研究所国家动物标本资源库
中国科学院
大学生命
科学
学院
中国科学院
成都生物
研究所
山地生态恢复与生物
资源
利用重点实验室与生态恢复生物多样性保护四川省重点实验室
南京农业大学植物保护
学院
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023年第4期1027-1037,共11页
基金
国家自然科学基金(32070465)
国家优秀青年科学基金(32122016)
+2 种基金
科技部基础资源调查专项(2018FY100400)
中国科学院战略性先导科技专项(B类)(XDB31030400)
吉首大学研究生科研创新项目(JGY202168)。
文摘
DNA条形码目前广泛用于昆虫多样性研究。本研究采用DNA条形码(即线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因COI 5′端),通过比较所获分子分类操作单元(Molecular operational taxonomic units,MOTU)的种内遗传距离,探究DNA条形码在亚热带森林(位于我国江西省新岗山)不同昆虫类群中的物种鉴定和界定效用。数据分析中结合数据库比对信息,采用jMOTU、ABGD、bPTP、GMYC这4种物种界定方法获得MOTU,从而开展种内遗传距离分析。本研究共挑选出479个昆虫样本,获得475条COI序列,经NCBI、BOLD在线数据库比对属于6个目,与形态初步划分一致;物种界定分析获得288个MOTU,其中鳞翅目最多,达85个,膜翅目、双翅目、半翅目、鞘翅目次之,分别为80、74、21和20个,直翅目最少,仅8个。膜翅目和双翅目的种内遗传距离均值及标准偏差较大(膜翅目:0.89%±0.87%;双翅目:0.73%±0.58%),鳞翅目的最小(0.28%±0.20%)。研究表明:不同昆虫类群的种内遗传距离虽然整体在一定范围,但仍然存在一定的差异,因此不能笼统地依靠遗传距离的距离阈值进行物种划分;现有数据库需要补充足够的昆虫物种信息,才能提升物种鉴定效率。本研究丰富了亚热带森林昆虫分子数据库,同时也为进一步探索基于分子分类学开展昆虫多样性研究提供了基础数据和参考。
关键词
DNA条形码
种内遗传距离
物种界定
昆虫
亚热带森林
Keywords
DNA barcoding
intraspecific genetic distance
species delimitation
insect
subtropical forest
分类号
Q968.1 [生物学—昆虫学]
Q9653 [生物学—昆虫学]
S433 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江西新岗山森林昆虫种内遗传距离研究
马奉
周青松
曹焕喜
陈婧婷
王明强
谢婷婷
杨娟娟
陶双伦
张峰
罗阿蓉
朱朝东
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023
2
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