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Shotgun方法在正常人泪液蛋白质组学分析中的应用
1
作者
项敏泓
张兴儒
+3 位作者
李青松
庄凤君
李玲
孙安国
《眼科新进展》
CAS
北大核心
2011年第2期105-107,112,共4页
目的探讨Shotgun方法用于分析泪液蛋白质组,完善正常人泪液蛋白质表达谱。方法收集正常8人(8眼)泪液混合后用于分析,所有人泪液标本均根据自愿的原则,采用毛细管从每眼收集15μL泪液,用Shotgun方法检测泪液蛋白质:分别行溶液内酶解、反...
目的探讨Shotgun方法用于分析泪液蛋白质组,完善正常人泪液蛋白质表达谱。方法收集正常8人(8眼)泪液混合后用于分析,所有人泪液标本均根据自愿的原则,采用毛细管从每眼收集15μL泪液,用Shotgun方法检测泪液蛋白质:分别行溶液内酶解、反向高效液相色谱分离、电喷雾离子化质谱,所得数据搜索IPI人类蛋白库,并按照IPI号对蛋白进行GOA功能分类。结果正常人泪液中共有352个蛋白质,高可信度蛋白质为73个,包括已知的高丰度蛋白质和泪液特异性蛋白质。参与生理过程和细胞过程的蛋白质占到泪液蛋白质总量的83.5%。鉴定出的蛋白质主要分布于细胞质中,已知最多的蛋白质为具有结合功能的泪液蛋白质。结论 Shotgun方法可有效分离和分析泪液蛋白质,该研究完善了成年人正常泪液蛋白质表达谱。
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关键词
泪液
蛋白质组
Shotgun方法
液相色谱
质谱分析
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职称材料
题名
Shotgun方法在正常人泪液蛋白质组学分析中的应用
1
作者
项敏泓
张兴儒
李青松
庄凤君
李玲
孙安国
机构
上海
中医药大学附属普陀医院眼科
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所蛋白质研究分析中心
出处
《眼科新进展》
CAS
北大核心
2011年第2期105-107,112,共4页
基金
上海市卫生局中医药科研项目(编号:2008Q006)~~
文摘
目的探讨Shotgun方法用于分析泪液蛋白质组,完善正常人泪液蛋白质表达谱。方法收集正常8人(8眼)泪液混合后用于分析,所有人泪液标本均根据自愿的原则,采用毛细管从每眼收集15μL泪液,用Shotgun方法检测泪液蛋白质:分别行溶液内酶解、反向高效液相色谱分离、电喷雾离子化质谱,所得数据搜索IPI人类蛋白库,并按照IPI号对蛋白进行GOA功能分类。结果正常人泪液中共有352个蛋白质,高可信度蛋白质为73个,包括已知的高丰度蛋白质和泪液特异性蛋白质。参与生理过程和细胞过程的蛋白质占到泪液蛋白质总量的83.5%。鉴定出的蛋白质主要分布于细胞质中,已知最多的蛋白质为具有结合功能的泪液蛋白质。结论 Shotgun方法可有效分离和分析泪液蛋白质,该研究完善了成年人正常泪液蛋白质表达谱。
关键词
泪液
蛋白质组
Shotgun方法
液相色谱
质谱分析
Keywords
tear
proteome
Shotgun strategy
liquid chromatography
mass spectrometry
分类号
R777.2 [医药卫生—眼科]
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作者
出处
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1
Shotgun方法在正常人泪液蛋白质组学分析中的应用
项敏泓
张兴儒
李青松
庄凤君
李玲
孙安国
《眼科新进展》
CAS
北大核心
2011
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