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一个新的水稻TE的克隆及其与CACTA转座子结构的比较(英文)
1
作者
田平芳
王国栋
+2 位作者
李群
李德葆
何祖华
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第2期133-140,共8页
对水稻受稻瘟病菌诱导的新因子 Rim2的基因组结构进行了研究 .以 Rim2 c DNA片段作探针 ,筛选水稻 BAC文库并对其亚克隆 ,获得了一个基因组 DNA克隆 Rim2 - 5 6 9.序列分析表明 ,Rim2 - 5 6 9序列具备 Class 2转座子的基本结构特征 .它...
对水稻受稻瘟病菌诱导的新因子 Rim2的基因组结构进行了研究 .以 Rim2 c DNA片段作探针 ,筛选水稻 BAC文库并对其亚克隆 ,获得了一个基因组 DNA克隆 Rim2 - 5 6 9.序列分析表明 ,Rim2 - 5 6 9序列具备 Class 2转座子的基本结构特征 .它两端具有完整的末端颠倒重复 (TIRs) ,若干正向和反向的亚末端重复 (STRs) ,以及插入位点 3bp的同向重复 .它 TIRs上的保守序列 CACTG有别于以往报道的 CACTA转座子 .该因子包含一个开读框 ,其预测蛋白与 CACTA转座子编码的 TNP2、TNPD等转座酶有低程度的同源性 .该因子没有能够编码类似 TNP1/ TNPA的 DNA结合蛋白的开读框 .Southern杂交显示 ,Rim2因子在多个不同起源的水稻品种上广泛存在 ,连同检索结果 ,证明该家族具有很多拷贝 .上述特点表明 ,该因子属于一个与 CACTA转座子有一定差异的新的转座子大家族 .
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关键词
水稻
TE
克隆
CACTA转座子
基因组
稻瘟病菌
Rim2因子
分子结构
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职称材料
题名
一个新的水稻TE的克隆及其与CACTA转座子结构的比较(英文)
1
作者
田平芳
王国栋
李群
李德葆
何祖华
机构
浙江大学生物技术
研究所
中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所sharf和植物分子遗传国家重点实验室
出处
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第2期133-140,共8页
基金
This study was funded by NSFC (30 12 5 0 30
90 2 0 80 10 ) and CAS project (KSCXZ- SW- 30 1)
文摘
对水稻受稻瘟病菌诱导的新因子 Rim2的基因组结构进行了研究 .以 Rim2 c DNA片段作探针 ,筛选水稻 BAC文库并对其亚克隆 ,获得了一个基因组 DNA克隆 Rim2 - 5 6 9.序列分析表明 ,Rim2 - 5 6 9序列具备 Class 2转座子的基本结构特征 .它两端具有完整的末端颠倒重复 (TIRs) ,若干正向和反向的亚末端重复 (STRs) ,以及插入位点 3bp的同向重复 .它 TIRs上的保守序列 CACTG有别于以往报道的 CACTA转座子 .该因子包含一个开读框 ,其预测蛋白与 CACTA转座子编码的 TNP2、TNPD等转座酶有低程度的同源性 .该因子没有能够编码类似 TNP1/ TNPA的 DNA结合蛋白的开读框 .Southern杂交显示 ,Rim2因子在多个不同起源的水稻品种上广泛存在 ,连同检索结果 ,证明该家族具有很多拷贝 .上述特点表明 ,该因子属于一个与 CACTA转座子有一定差异的新的转座子大家族 .
关键词
水稻
TE
克隆
CACTA转座子
基因组
稻瘟病菌
Rim2因子
分子结构
Keywords
rice
Rim2 element
genomic sequence
molecular structure
分类号
S511.03 [农业科学—作物学]
Q74 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一个新的水稻TE的克隆及其与CACTA转座子结构的比较(英文)
田平芳
王国栋
李群
李德葆
何祖华
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004
0
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