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胃萎缩性炎症恶变过程中基因表达谱的变化
被引量：
5
1
作者
丁西平
毛玉娣
+2 位作者
汪朝靓
周欢
程前
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2019年第3期402-407,共6页
目的研究胃萎缩性炎恶变至胃癌过程中基因表达谱的变化。方法收集5例重度萎缩胃炎伴肠上皮化生组织和5例进展期胃癌组织进行基因芯片检测,筛选差异性表达的基因。通过生物信息学分析的方法对差异性表达的基因富集的生物过程、信号通路...
目的研究胃萎缩性炎恶变至胃癌过程中基因表达谱的变化。方法收集5例重度萎缩胃炎伴肠上皮化生组织和5例进展期胃癌组织进行基因芯片检测,筛选差异性表达的基因。通过生物信息学分析的方法对差异性表达的基因富集的生物过程、信号通路、基因编码蛋白之间相互关系进行分析。结果通过基因芯片检测,筛选出2 779个差异性表达的基因,并对变化最明显的前15个上调及前15个下调的基因进行总结,其中包括CPA2、HCAR3、BCL2A1、ITGAX等新发现的胃癌相关基因。此外,生物信息学分析显示了差异性表达基因所代表的生理意义,如炎症反应、细胞迁移、TNF信号通路、NF-kappa B信号通路、Toll样受体信号通路、趋化因子信号通路等。结论萎缩性胃炎恶变至胃癌过程中基因表达谱发生明显变化,并代表了相应的生理意义。
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关键词
炎症恶化
胃癌
萎缩性胃炎
基因表达谱
GO分析
KEGG信号通路
PPI网络分析
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职称材料
题名
胃萎缩性炎症恶变过程中基因表达谱的变化
被引量：
5
1
作者
丁西平
毛玉娣
汪朝靓
周欢
程前
机构
中国科学技术大学
附属
第一
医院
(
安徽省立医院
)
老年
消化
科
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2019年第3期402-407,共6页
基金
安徽省自然科学基金(编号:1808085MH304)
安徽省公益性技术应用研究联动计划项目(编号:1604f0804018)
文摘
目的研究胃萎缩性炎恶变至胃癌过程中基因表达谱的变化。方法收集5例重度萎缩胃炎伴肠上皮化生组织和5例进展期胃癌组织进行基因芯片检测,筛选差异性表达的基因。通过生物信息学分析的方法对差异性表达的基因富集的生物过程、信号通路、基因编码蛋白之间相互关系进行分析。结果通过基因芯片检测,筛选出2 779个差异性表达的基因,并对变化最明显的前15个上调及前15个下调的基因进行总结,其中包括CPA2、HCAR3、BCL2A1、ITGAX等新发现的胃癌相关基因。此外,生物信息学分析显示了差异性表达基因所代表的生理意义,如炎症反应、细胞迁移、TNF信号通路、NF-kappa B信号通路、Toll样受体信号通路、趋化因子信号通路等。结论萎缩性胃炎恶变至胃癌过程中基因表达谱发生明显变化,并代表了相应的生理意义。
关键词
炎症恶化
胃癌
萎缩性胃炎
基因表达谱
GO分析
KEGG信号通路
PPI网络分析
Keywords
inflammation malignant
gastric carcinoma
atrophic gastritis
gene expression profile
GO analysis
KEGG pathway
PPI network analysis
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
R573.32 [医药卫生—消化系统]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胃萎缩性炎症恶变过程中基因表达谱的变化
丁西平
毛玉娣
汪朝靓
周欢
程前
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2019
5
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