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基于生物信息学分析子宫内膜异位症的潜在生物标志物和候选治疗药物
被引量：
2
1
作者
赵旭旭
赵卫东
+6 位作者
张璟鹤
陈峥峥
任萍萍
张影
葛丽
于明月
朱美玲
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2020年第12期1925-1930,1935,共7页
目的探究子宫内膜异位症中差异表达基因(DEGs)及其功能,筛选潜在的生物标志物和候选治疗药物。方法磁珠分选异位内膜和正常内膜组织中的基质细胞进行基因表达谱分析;结合GEO数据库中可获取的同平台同类芯片数据,利用limma软件包和经验...
目的探究子宫内膜异位症中差异表达基因(DEGs)及其功能,筛选潜在的生物标志物和候选治疗药物。方法磁珠分选异位内膜和正常内膜组织中的基质细胞进行基因表达谱分析;结合GEO数据库中可获取的同平台同类芯片数据,利用limma软件包和经验贝叶斯方法筛选DEGs,并进行GO和KEGG富集分析;查询STRING数据库,进行PPI互作网络分析,筛选核心致病基因;再检索CMAP数据库,筛得类药物小分子。结果869个基因在异位内膜中表达有显著差异,其中17个上调表达,852个下调表达;GO富集分析显示DEGs多调控受体配体活性、通道活性和被动跨膜转运蛋白活性等功能;KEGG富集分析发现DEGs多介导神经活性配体-受体相互作用通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用通路和IL-17信号通路等通路;PPI网络表明FPR2、SAA1、RLN3、CXCL8、FPR1、PF4、CCR7和CXCL5共8个基因是核心致病基因;经CMAP数据库分析认为硫代罗宁和氟硝利嗪可能具有治疗内异症的潜在价值。结论FPR2、SAA1、RLN3、CXCL8、FPR1、PF4、CCR7和CXCL5共8个基因是子宫内膜异位症潜在的生物标志物,硫代罗宁和氟硝利嗪是治疗子宫内膜异位症的候选药物。
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关键词
子宫内膜异位症
生物标志物
候选治疗药物
生物信息学
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职称材料
题名
基于生物信息学分析子宫内膜异位症的潜在生物标志物和候选治疗药物
被引量：
2
1
作者
赵旭旭
赵卫东
张璟鹤
陈峥峥
任萍萍
张影
葛丽
于明月
朱美玲
机构
安徽医科
大学
附属省立医院妇产科
中国科学技术大学
附属第一医院妇产科
中国科学技术大学生命科学与医学部免疫研究所和中国科学院天然免疫与慢性疾病重点实验室
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2020年第12期1925-1930,1935,共7页
基金
安徽省自然科学基金项目(编号:1708085MH184)
安徽省公益性研究联动计划项目(编号:1604f0804010)。
文摘
目的探究子宫内膜异位症中差异表达基因(DEGs)及其功能,筛选潜在的生物标志物和候选治疗药物。方法磁珠分选异位内膜和正常内膜组织中的基质细胞进行基因表达谱分析;结合GEO数据库中可获取的同平台同类芯片数据,利用limma软件包和经验贝叶斯方法筛选DEGs,并进行GO和KEGG富集分析;查询STRING数据库,进行PPI互作网络分析,筛选核心致病基因;再检索CMAP数据库,筛得类药物小分子。结果869个基因在异位内膜中表达有显著差异,其中17个上调表达,852个下调表达;GO富集分析显示DEGs多调控受体配体活性、通道活性和被动跨膜转运蛋白活性等功能;KEGG富集分析发现DEGs多介导神经活性配体-受体相互作用通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用通路和IL-17信号通路等通路;PPI网络表明FPR2、SAA1、RLN3、CXCL8、FPR1、PF4、CCR7和CXCL5共8个基因是核心致病基因;经CMAP数据库分析认为硫代罗宁和氟硝利嗪可能具有治疗内异症的潜在价值。结论FPR2、SAA1、RLN3、CXCL8、FPR1、PF4、CCR7和CXCL5共8个基因是子宫内膜异位症潜在的生物标志物,硫代罗宁和氟硝利嗪是治疗子宫内膜异位症的候选药物。
关键词
子宫内膜异位症
生物标志物
候选治疗药物
生物信息学
Keywords
endometriosis
biomarkers
candidate therapeutic drugs
bioinformatics
分类号
R711.71 [医药卫生—妇产科学]
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题名
作者
出处
发文年
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1
基于生物信息学分析子宫内膜异位症的潜在生物标志物和候选治疗药物
赵旭旭
赵卫东
张璟鹤
陈峥峥
任萍萍
张影
葛丽
于明月
朱美玲
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2020
2
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引证文献
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