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柱式法和磁珠法提取原油脱氧核糖核酸
1
作者
熊驷骏
陶建强
+6 位作者
万云洋
胡春余
樊宝旭
杨元亮
徐朋朋
高志卫
赵国屏
《中国石油大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第4期224-230,共7页
直接提取原油脱氧核糖核酸(DNA)是分析原油微生物群落和多样性最基础、最重要的第一步。分别用柱式法(SE)和磁珠法(ME)提取12份原油样品的微生物基因组总DNA,并通过因美纳(Illumina)高通量测序进一步分析其微生物多样性和群落差异。结...
直接提取原油脱氧核糖核酸(DNA)是分析原油微生物群落和多样性最基础、最重要的第一步。分别用柱式法(SE)和磁珠法(ME)提取12份原油样品的微生物基因组总DNA,并通过因美纳(Illumina)高通量测序进一步分析其微生物多样性和群落差异。结果表明:SE的DNA质量浓度和纯度(A260/A280比值,其中A为吸光度)分别为20.17±31.83 ng/μL和1.01±0.63,ME的DNA质量浓度和纯度分别为11.14±17.27 ng/μL和1.29±0.20;SE检出30门和507属,ME检出38门和677属,其中未分类属和未培养属的相对含量分别为1.12%和0.20%(SE)、1.24%和1.10%(ME);两种方法均检测到专有属(SE专有65属,ME专有235属),SE检出油藏微生物如地杆菌属(Geobacter)等,ME检出疑似油藏微生物如黄杆菌属(Xanthobacter);两种方法在原油DNA提取方面各有优劣,SE提取质量浓度高并对油藏微生物有更好响应,ME检测微生物多样性能力略强,但两种方法在分类学水平上均有较强的偏向性。
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关键词
DNA提取
柱式法
磁珠法
微生物多样性
微生物群落
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职称材料
题名
柱式法和磁珠法提取原油脱氧核糖核酸
1
作者
熊驷骏
陶建强
万云洋
胡春余
樊宝旭
杨元亮
徐朋朋
高志卫
赵国屏
机构
中国石油大学
(
北京
)油气
资源与
工程全国重点实验室
中国石油大学
(
北京
)
地层
微生物
资源与
应用
研究
中心
中国石油大学
(
北京
)油气污染防治
北京
市重点实验室
中国石油大学
(
北京
)非常规油气科学技术
研究
院
中石化新疆新春
石油
开发有限责任公司
中国
科学院上海植物生理生态
研究
所
中国
科学院分子植物科学卓越创新
中心
合成
生物
学重点实验室
出处
《中国石油大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第4期224-230,共7页
基金
中国石油战略合作科技专项(ZLZX2020010805,ZLZX2020020405)
中国石油大学(北京)前瞻导向项目(ZX20190209)
+1 种基金
国家科技重大专项(2016ZX05050011,2016ZX05040002)
中国石油大学(北京)地层微生物资源与应用研究中心多学科联合创新创业实验室(第四批)项目。
文摘
直接提取原油脱氧核糖核酸(DNA)是分析原油微生物群落和多样性最基础、最重要的第一步。分别用柱式法(SE)和磁珠法(ME)提取12份原油样品的微生物基因组总DNA,并通过因美纳(Illumina)高通量测序进一步分析其微生物多样性和群落差异。结果表明:SE的DNA质量浓度和纯度(A260/A280比值,其中A为吸光度)分别为20.17±31.83 ng/μL和1.01±0.63,ME的DNA质量浓度和纯度分别为11.14±17.27 ng/μL和1.29±0.20;SE检出30门和507属,ME检出38门和677属,其中未分类属和未培养属的相对含量分别为1.12%和0.20%(SE)、1.24%和1.10%(ME);两种方法均检测到专有属(SE专有65属,ME专有235属),SE检出油藏微生物如地杆菌属(Geobacter)等,ME检出疑似油藏微生物如黄杆菌属(Xanthobacter);两种方法在原油DNA提取方面各有优劣,SE提取质量浓度高并对油藏微生物有更好响应,ME检测微生物多样性能力略强,但两种方法在分类学水平上均有较强的偏向性。
关键词
DNA提取
柱式法
磁珠法
微生物多样性
微生物群落
Keywords
DNA extraction
spincolumn based extraction method
magnetisable solid phase extraction method
microbial diversity
microbial community
分类号
Q503.23 [生物学—生物化学]
TE99 [石油与天然气工程—石油机械设备]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
柱式法和磁珠法提取原油脱氧核糖核酸
熊驷骏
陶建强
万云洋
胡春余
樊宝旭
杨元亮
徐朋朋
高志卫
赵国屏
《中国石油大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
0
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