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武汉市HIV-1相关基因序列分析及亚型分布
被引量：
8
1
作者
唐力
邢辉
+6 位作者
彭劲松
刘胜牙
王夏
周旺
郑华英
刘满清
鄢慧民
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第11期1071-1074,1078,共5页
目的研究武汉市HIV感染人群中的HIV毒株的亚型分布特点和流行规律。方法采集武汉市60名已被确认为HIV-1感染者的抗凝全血样品,提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应方法(nested-PCR)扩增病毒膜蛋白env基因的C2-V5区及gag基因的部分区段,对...
目的研究武汉市HIV感染人群中的HIV毒株的亚型分布特点和流行规律。方法采集武汉市60名已被确认为HIV-1感染者的抗凝全血样品,提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应方法(nested-PCR)扩增病毒膜蛋白env基因的C2-V5区及gag基因的部分区段,对PCR纯化产物直接测序,并应用GCG软件对序列进行分析。结果通过PCR扩增得到60份样品的结果,其中env基因序列45份、gag基因序列52份。依据env和gag区基因序列,与HIV-1各个亚型国际参考株比较,通过系统进化分析,最后确定武汉市样品分属5个亚型,分别为HIV-1B亚型中的泰国B(B’)亚型32份,流行重组型CRF07-BC12份,流行重组型CRF01-AE9份,A亚型1份和C亚型6份。结论武汉市存在多种HIV-1亚型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略。
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关键词
艾滋病病毒
基因亚型
套式聚合酶链反应
分子流行病学
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职称材料
题名
武汉市HIV-1相关基因序列分析及亚型分布
被引量：
8
1
作者
唐力
邢辉
彭劲松
刘胜牙
王夏
周旺
郑华英
刘满清
鄢慧民
机构
病毒学国家重点实验室
武汉市
疾病预防控制中心
中国疾病预防控制中心性病艾滋病疾病预防控制中心
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第11期1071-1074,1078,共5页
基金
国家973项目(2005CB522903)
文摘
目的研究武汉市HIV感染人群中的HIV毒株的亚型分布特点和流行规律。方法采集武汉市60名已被确认为HIV-1感染者的抗凝全血样品,提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应方法(nested-PCR)扩增病毒膜蛋白env基因的C2-V5区及gag基因的部分区段,对PCR纯化产物直接测序,并应用GCG软件对序列进行分析。结果通过PCR扩增得到60份样品的结果,其中env基因序列45份、gag基因序列52份。依据env和gag区基因序列,与HIV-1各个亚型国际参考株比较,通过系统进化分析,最后确定武汉市样品分属5个亚型,分别为HIV-1B亚型中的泰国B(B’)亚型32份,流行重组型CRF07-BC12份,流行重组型CRF01-AE9份,A亚型1份和C亚型6份。结论武汉市存在多种HIV-1亚型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略。
关键词
艾滋病病毒
基因亚型
套式聚合酶链反应
分子流行病学
Keywords
HIV,subtype,nested-PCR,molecular epidemiology
分类号
R373.9 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
武汉市HIV-1相关基因序列分析及亚型分布
唐力
邢辉
彭劲松
刘胜牙
王夏
周旺
郑华英
刘满清
鄢慧民
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
8
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