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环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性研究
1
作者
李胜
靳娟
+7 位作者
何建
杨晓艳
柏吉祥
辛有全
张丽
张晓璐
杜文琪
李伟
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025年第6期592-596,共5页
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性分析,明确环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌分子特征,为该地区鼠疫菌的分子流行病学分析和溯源奠定基础。方法利用全基因组测序技术,获得环青海湖地区鼠疫自然疫源地84株代表性鼠疫菌株的全基因组序列...
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性分析,明确环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌分子特征,为该地区鼠疫菌的分子流行病学分析和溯源奠定基础。方法利用全基因组测序技术,获得环青海湖地区鼠疫自然疫源地84株代表性鼠疫菌株的全基因组序列,以NCBI数据库中的鼠疫菌及假结核耶尔森菌IP32953的全基因组序列为参考,比对2298个SNP位点并进行分析。结果1957—2020年,环青海湖地区鼠疫疫源地分离的84株代表性鼠疫菌株分为1.IN2和3.ANT1两个分支,其中1.IN2分支作为该地区鼠疫菌的特征种群遍及所有疫情流行年代;鼠疫菌SNP地区分布显示除乌兰县外其余5个县的鼠疫菌均位于1.IN2分支中;不同宿主SNP分布显示,除分离自喜马拉雅旱獭和狗体内的2株鼠疫菌位于3.ANT1分支外,其余均位于1.IN2分支中。结论环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌的SNP种群结构较为单一,基于鼠疫菌基因组单核苷酸多态性分析,可以为该地区鼠疫疫情的溯源和防控措施的制定提供科学依据。
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关键词
环青海湖地区
鼠疫疫源地
鼠疫菌
单核苷酸多态性
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职称材料
梁河家鼠鼠疫疫源地鼠疫噬菌体的分离及其流行病学意义
被引量：
10
2
作者
张海鹏
钟佑宏
+5 位作者
段存娟
郭牧
段彪
李伟
王鹏
吴鹤松
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期589-592,共4页
目的调查梁河县家鼠鼠疫疫源地宿主动物中是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2017年采集梁河家鼠鼠疫疫源地4个曾流行过鼠疫乡镇的鼠类标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离鼠疫噬菌体,同时挑取部分噬菌体进...
目的调查梁河县家鼠鼠疫疫源地宿主动物中是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2017年采集梁河家鼠鼠疫疫源地4个曾流行过鼠疫乡镇的鼠类标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离鼠疫噬菌体,同时挑取部分噬菌体进行电镜扫描。结果共获得338份标本(黄胸鼠234只,臭鼩鼱43只,其余61只),分离到29株鼠疫噬菌体,总分离率为8.58%(29/338),其中19株分离自黄胸鼠,分离率为8.12%(19/234),8株分离自臭鼩鼱,分离率为18.6%(8/43);4个乡镇全部有分离到鼠疫噬菌体,其中遮岛镇分离率最高为16.13%(5/31);初次分离这些鼠疫噬菌体时,其噬斑在双层平板上表现为大(直径≥2.0 mm)、中(≥1.0 mm,≤2.0 mm)及小(≤1.0 mm)3种噬斑;2株有代表性噬菌体皆为肌尾病毒科噬菌体。结论梁河家鼠鼠疫疫源地中普遍存在鼠疫噬菌体,黄胸鼠是主要的携带宿主,所分鼠疫噬菌体为肌尾病毒科噬菌体且具有多态性,值得进一步研究。
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关键词
鼠疫噬菌体
鼠疫疫源地
流行病学
梁河县
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职称材料
题名
环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性研究
1
作者
李胜
靳娟
何建
杨晓艳
柏吉祥
辛有全
张丽
张晓璐
杜文琪
李伟
机构
青海大学医学院公共卫生系
青海省地方病
预防
控制所
鼠疫
菌专业实验
室
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室
出处
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025年第6期592-596,共5页
基金
国家自然科学基金(No.82260401)
青海省科技厅基础研究计划(No.2024-ZJ-712)。
文摘
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性分析,明确环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌分子特征,为该地区鼠疫菌的分子流行病学分析和溯源奠定基础。方法利用全基因组测序技术,获得环青海湖地区鼠疫自然疫源地84株代表性鼠疫菌株的全基因组序列,以NCBI数据库中的鼠疫菌及假结核耶尔森菌IP32953的全基因组序列为参考,比对2298个SNP位点并进行分析。结果1957—2020年,环青海湖地区鼠疫疫源地分离的84株代表性鼠疫菌株分为1.IN2和3.ANT1两个分支,其中1.IN2分支作为该地区鼠疫菌的特征种群遍及所有疫情流行年代;鼠疫菌SNP地区分布显示除乌兰县外其余5个县的鼠疫菌均位于1.IN2分支中;不同宿主SNP分布显示,除分离自喜马拉雅旱獭和狗体内的2株鼠疫菌位于3.ANT1分支外,其余均位于1.IN2分支中。结论环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌的SNP种群结构较为单一,基于鼠疫菌基因组单核苷酸多态性分析,可以为该地区鼠疫疫情的溯源和防控措施的制定提供科学依据。
关键词
环青海湖地区
鼠疫疫源地
鼠疫菌
单核苷酸多态性
Keywords
Qinghai Lake region
natural plague foci
Yersinia pestis
single nucleotide polymorphism(SNP)
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
梁河家鼠鼠疫疫源地鼠疫噬菌体的分离及其流行病学意义
被引量：
10
2
作者
张海鹏
钟佑宏
段存娟
郭牧
段彪
李伟
王鹏
吴鹤松
机构
云南省地方病防治所/云南省自然疫源性
疾病
防控
技术重点实验
室
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期589-592,共4页
基金
国家自然科学基金(No.31660043,No.81560545)
徐建国院士工作站(No.2018IC155)。
文摘
目的调查梁河县家鼠鼠疫疫源地宿主动物中是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2017年采集梁河家鼠鼠疫疫源地4个曾流行过鼠疫乡镇的鼠类标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离鼠疫噬菌体,同时挑取部分噬菌体进行电镜扫描。结果共获得338份标本(黄胸鼠234只,臭鼩鼱43只,其余61只),分离到29株鼠疫噬菌体,总分离率为8.58%(29/338),其中19株分离自黄胸鼠,分离率为8.12%(19/234),8株分离自臭鼩鼱,分离率为18.6%(8/43);4个乡镇全部有分离到鼠疫噬菌体,其中遮岛镇分离率最高为16.13%(5/31);初次分离这些鼠疫噬菌体时,其噬斑在双层平板上表现为大(直径≥2.0 mm)、中(≥1.0 mm,≤2.0 mm)及小(≤1.0 mm)3种噬斑;2株有代表性噬菌体皆为肌尾病毒科噬菌体。结论梁河家鼠鼠疫疫源地中普遍存在鼠疫噬菌体,黄胸鼠是主要的携带宿主,所分鼠疫噬菌体为肌尾病毒科噬菌体且具有多态性,值得进一步研究。
关键词
鼠疫噬菌体
鼠疫疫源地
流行病学
梁河县
Keywords
Yersinia pestis phage
plague foci
epidemiology
Lianghe County
分类号
R378.61 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性研究
李胜
靳娟
何建
杨晓艳
柏吉祥
辛有全
张丽
张晓璐
杜文琪
李伟
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
梁河家鼠鼠疫疫源地鼠疫噬菌体的分离及其流行病学意义
张海鹏
钟佑宏
段存娟
郭牧
段彪
李伟
王鹏
吴鹤松
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
10
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