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四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的多样性
被引量：
12
1
作者
张婷婷
苗娇娇
+4 位作者
强裕俊
李秀文
彭贤慧
张雯
韩娜
《中国感染控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期797-802,共6页
目的了解四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的分布情况及其多样性。方法利用生物信息学方法,对2 036份不同来源的微生态样本宏基因组测序数据进行四环素耐药基因的鉴定,研究四环素耐药基因在不同来源、不同国别、不...
目的了解四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的分布情况及其多样性。方法利用生物信息学方法,对2 036份不同来源的微生态样本宏基因组测序数据进行四环素耐药基因的鉴定,研究四环素耐药基因在不同来源、不同国别、不同人体部位的分布及耐药机制。结果2 036份样本中,四环素耐药基因检出率为44.70%(910份),其中人源样本检出率最高,达78.99%(880/1 114),其次是动物样本,检出率40.98%(25/61)。共检出28种四环素耐药基因,248份样本至少检出10种以上四环素耐药基因,在人源性样本中28种基因全部检出,动物源样本中检出6种基因。28种四环素类耐药基因中,包括10种编码核糖体保护蛋白基因,其中5种(tetQ、tet32、tet W、tetO、tet M)在50%以上的人源样本中检出,4种在动物源样本中检出率>16%。338份人源样本具有国别(中国、丹麦、西班牙、美国和日本)信息,耐药基因分析显示,tetO、tetQ和tet W 3种耐药基因在5个国家均有检出;来源于中国的样本均检出tet32、tet40、tetO、tetQ和tet W5种耐药基因,并匹配上24种四环素耐药基因型。在人体不同部位微生态四环素类耐药基因分布中,肠道中的耐药基因型分布最丰富,共有26种四环素耐药基因匹配到肠道样本中,其中tetQ、tet W、tetO、tet32、tet40 5种耐药基因型检出率>70%。结论在人体、动物微生态中存在着大量的、多样的四环素类耐药基因,公众健康和生态环境受到巨大威胁,需要引起高度重视。
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关键词
宏基因组学
四环素
耐药性
四环素耐药基因
细菌
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职称材料
题名
四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的多样性
被引量：
12
1
作者
张婷婷
苗娇娇
强裕俊
李秀文
彭贤慧
张雯
韩娜
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室传染病预防控制国家重点实验室
感染性
疾病
诊治协同创新
中心
出处
《中国感染控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期797-802,共6页
基金
“生物安全关键技术研发”重点专项(2018YFC1200100)
国家自然科学基金(81700016)
国家科技重大专项(2018ZX10305410、2018ZX10712001、2018ZX10733402)
文摘
目的了解四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的分布情况及其多样性。方法利用生物信息学方法,对2 036份不同来源的微生态样本宏基因组测序数据进行四环素耐药基因的鉴定,研究四环素耐药基因在不同来源、不同国别、不同人体部位的分布及耐药机制。结果2 036份样本中,四环素耐药基因检出率为44.70%(910份),其中人源样本检出率最高,达78.99%(880/1 114),其次是动物样本,检出率40.98%(25/61)。共检出28种四环素耐药基因,248份样本至少检出10种以上四环素耐药基因,在人源性样本中28种基因全部检出,动物源样本中检出6种基因。28种四环素类耐药基因中,包括10种编码核糖体保护蛋白基因,其中5种(tetQ、tet32、tet W、tetO、tet M)在50%以上的人源样本中检出,4种在动物源样本中检出率>16%。338份人源样本具有国别(中国、丹麦、西班牙、美国和日本)信息,耐药基因分析显示,tetO、tetQ和tet W 3种耐药基因在5个国家均有检出;来源于中国的样本均检出tet32、tet40、tetO、tetQ和tet W5种耐药基因,并匹配上24种四环素耐药基因型。在人体不同部位微生态四环素类耐药基因分布中,肠道中的耐药基因型分布最丰富,共有26种四环素耐药基因匹配到肠道样本中,其中tetQ、tet W、tetO、tet32、tet40 5种耐药基因型检出率>70%。结论在人体、动物微生态中存在着大量的、多样的四环素类耐药基因,公众健康和生态环境受到巨大威胁,需要引起高度重视。
关键词
宏基因组学
四环素
耐药性
四环素耐药基因
细菌
Keywords
metagenome
tetracycline
drug resistance
tetracycline resistance gene
bacteria
分类号
R978.1 [医药卫生—药品]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的多样性
张婷婷
苗娇娇
强裕俊
李秀文
彭贤慧
张雯
韩娜
《中国感染控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
12
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