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题名25株艰难梭菌多位点序列分型
被引量：5
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作者
严其容
李文革
许文荣
程颖
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机构
江苏大学基础医学与医学技术学院
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所医院感染室
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出处
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期183-186,共4页
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基金
国家自然科学基金(81101218)
中国疾病预防控制中心青年基金课题(2011A101)
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文摘
目的比较两种对艰难梭菌多位点序列分型(MLST)的方案并探讨不同来源艰难梭菌之间的关系。方法选取来自不同人群的25株艰难梭菌,分别用Lemee方案(aroE,ddl,dutA,tpi,recA,gmk,sodA管家基因)和David方案(adk,atpA,dxr,glyA,recA,soda,tpi管家基因)进行多位点序列分型,用START系统及Bionumerics软件分析这些位点及等位基因谱的特征。结果位点分析结果表明,Lemee方案中有2株菌的ddl位点为无效位点,其余的6个管家基因有3～5个等位基因,等位基因之间有3～11个多态性位点。非同义突变/同义突变(dN/dS)为0.000 0～0.261 1;David方案中的7个管家基因有3～5个等位基因,等位基因之间有2～9个多态性位点。dN/dS为0.000 0～0.280 6。等位基因图谱特征结果表明,Lemee方案出现了13个ST型别(ST1/2/3/6/7/13/31/39/48/A/B/C/D),ST6(5)为优势型别;David方案共出现11个ST型别(ST2/3/15/35/37/54/55/92/99/102/117),其中ST54(6),ST37(5)为优势型别。来源于成人和婴幼儿的菌株并未形成各自特异的序列型。结论对于艰难梭菌多位点序列分型,David的方案更可取,ST与宿主人群的来源没有明显的相关性。
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关键词
艰难梭菌
分子分型
多位点序列分型
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Keywords
Clostridium difficile
molecular typing
multilocus sequence typing
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分类号
R446.5
[医药卫生—诊断学]
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