期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
2
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
插入序列共同区家族元件结构特征、参与捕获的耐药基因及启动子预测
1
作者
杜逸瑶
宿哲弟
+5 位作者
王娟
袁敏
刘志国
邱小彤
徐帅
李振军
《动物医学进展》
北大核心
2025年第11期10-16,共7页
为了预测分析插入序列共同区(insertion sequence common region,IS CR)元件为耐药基因提供启动子的情况,汇总分析当前已发现的IS CR家族元件的序列特征及参与捕获耐药基因。纳入IS 91家族的3个经典成员IS 801、IS 1294、IS 91以及17个...
为了预测分析插入序列共同区(insertion sequence common region,IS CR)元件为耐药基因提供启动子的情况,汇总分析当前已发现的IS CR家族元件的序列特征及参与捕获耐药基因。纳入IS 91家族的3个经典成员IS 801、IS 1294、IS 91以及17个已有公开序列的IS CR元件标准序列用于分析。用MEGA X构建基于氨基酸序列的进化树并比对保守氨基酸,分析转座酶保守结构域氨基酸变化。文献汇总IS CR元件ori IS端和ter IS端,分析其特征和保守碱基序列。从NCBI GenBank提取包含目标IS CR元件的序列,RAST在线基因组注释网站对每条序列进行粗注释,在Resfinder数据库核定序列中的耐药基因。分析IS CR元件下游紧邻耐药基因的基因间区,使用CLC Genomics Workbench 8手工提取耐药基因上游200 bp序列,提交至启动子预测网站BPROM做进一步分析。聚类分析表明,IS CR 28和IS CR 20是与IS 91家族成员遗传进化距离最近的成员。IS CR元件的ori IS端序列具有保守性,ter IS端除内部存在反向互补序列外,无显著的保守碱基特征。IS CR家族元件至少参与捕获了20种耐药基因,其中8种情况IS CR元件右臂可能为耐药基因的表达提供启动子。结果表明,IS CR元件不仅参与耐药基因的捕获和转移,还可能为多种耐药基因的表达提供启动子,是区别于IS 26的重要特征,也是除IS 26以外参与耐药基因转移最为活跃的单个插入元件家族,需予以高度关注。
展开更多
关键词
IS
CR元件
IS
91家族元件
可移动元件
在线阅读
下载PDF
职称材料
一种羊种布鲁氏菌复方新诺明耐药株荧光定量PCR检测方法的建立
2
作者
杨晓雯
宁文晴
+3 位作者
周师众
袁雅琴
侯雪新
丁家波
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第3期1465-1472,共8页
近年来,世界范围内已分离获得布鲁氏菌复方新诺明耐药株,快速检测样品中是否含有耐药株有助于指导临床用药。目前国内外尚无布鲁氏菌复方新诺明耐药株的快速检测方法。本研究旨在建立一种羊种布鲁氏菌复方新诺明耐受株的快速检测方法。...
近年来,世界范围内已分离获得布鲁氏菌复方新诺明耐药株,快速检测样品中是否含有耐药株有助于指导临床用药。目前国内外尚无布鲁氏菌复方新诺明耐药株的快速检测方法。本研究旨在建立一种羊种布鲁氏菌复方新诺明耐受株的快速检测方法。基于前期的研究筛选最小抑菌浓度较高的我国羊种布鲁氏菌分离株,利用基因组测序分析全基因组SNPs并筛选SNPs位点,利用MGB探针建立荧光定量检测羊种布鲁氏菌复方新诺明耐药株。研究发现,羊种布鲁氏菌2型标准株可作为耐药株分析的参考株,且64个SNPs和InDels为耐药株特有;12个突变位点可用于建立耐药株快速检测方法;利用染色体1中2014308位点的A/G多态性建立荧光定量检测方法特异性良好,最低能检测2×10^(1)CFU菌量,可用于临床样品是否含有复方新诺明耐药株的检测。本研究建立了一种羊种布鲁氏菌复方新诺明耐药株的荧光定量检测方法,为我国布病耐药株的防控提供科学依据,同时也为临床用药提供参考。
展开更多
关键词
羊种布鲁氏菌
复方新诺明
全基因组SNPs
MGB探针
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
插入序列共同区家族元件结构特征、参与捕获的耐药基因及启动子预测
1
作者
杜逸瑶
宿哲弟
王娟
袁敏
刘志国
邱小彤
徐帅
李振军
机构
山西医科大学医学科学院
山西医科大学公共卫生学院流行病学教研室
西北农林科技大学动物医学院
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室
中国疾病预防控制中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2025年第11期10-16,共7页
基金
国家自然科学基金项目(L2124006)。
文摘
为了预测分析插入序列共同区(insertion sequence common region,IS CR)元件为耐药基因提供启动子的情况,汇总分析当前已发现的IS CR家族元件的序列特征及参与捕获耐药基因。纳入IS 91家族的3个经典成员IS 801、IS 1294、IS 91以及17个已有公开序列的IS CR元件标准序列用于分析。用MEGA X构建基于氨基酸序列的进化树并比对保守氨基酸,分析转座酶保守结构域氨基酸变化。文献汇总IS CR元件ori IS端和ter IS端,分析其特征和保守碱基序列。从NCBI GenBank提取包含目标IS CR元件的序列,RAST在线基因组注释网站对每条序列进行粗注释,在Resfinder数据库核定序列中的耐药基因。分析IS CR元件下游紧邻耐药基因的基因间区,使用CLC Genomics Workbench 8手工提取耐药基因上游200 bp序列,提交至启动子预测网站BPROM做进一步分析。聚类分析表明,IS CR 28和IS CR 20是与IS 91家族成员遗传进化距离最近的成员。IS CR元件的ori IS端序列具有保守性,ter IS端除内部存在反向互补序列外,无显著的保守碱基特征。IS CR家族元件至少参与捕获了20种耐药基因,其中8种情况IS CR元件右臂可能为耐药基因的表达提供启动子。结果表明,IS CR元件不仅参与耐药基因的捕获和转移,还可能为多种耐药基因的表达提供启动子,是区别于IS 26的重要特征,也是除IS 26以外参与耐药基因转移最为活跃的单个插入元件家族,需予以高度关注。
关键词
IS
CR元件
IS
91家族元件
可移动元件
Keywords
IS CR element
IS 91 family element
Mobile element
分类号
S853.7 [农业科学—临床兽医学]
S859.1 [农业科学—临床兽医学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
一种羊种布鲁氏菌复方新诺明耐药株荧光定量PCR检测方法的建立
2
作者
杨晓雯
宁文晴
周师众
袁雅琴
侯雪新
丁家波
机构
中国
农业科学院北京畜牧兽医研究所农业农村部动物生物安全风险
预警
及
防控
重点
实验室
(北方)
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室
山东农业大学动物医学院
扬州大学兽医学院禽类
预防
医学教育部
重点
实验室
出处
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第3期1465-1472,共8页
基金
北京市自然科学基金项目(7222120)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2023-YWF-ZYSQ-09)
+2 种基金
中国农业科学院科技创新工程重大科研任务(CAAS-ZDRW202410)
中国农业科学院科技创新工程科学中心重点任务(CAAS-CSLPDCP-202403)
中国农业科学院科技创新工程(ASTIP)(ASTIP-IAS-15)
文摘
近年来,世界范围内已分离获得布鲁氏菌复方新诺明耐药株,快速检测样品中是否含有耐药株有助于指导临床用药。目前国内外尚无布鲁氏菌复方新诺明耐药株的快速检测方法。本研究旨在建立一种羊种布鲁氏菌复方新诺明耐受株的快速检测方法。基于前期的研究筛选最小抑菌浓度较高的我国羊种布鲁氏菌分离株,利用基因组测序分析全基因组SNPs并筛选SNPs位点,利用MGB探针建立荧光定量检测羊种布鲁氏菌复方新诺明耐药株。研究发现,羊种布鲁氏菌2型标准株可作为耐药株分析的参考株,且64个SNPs和InDels为耐药株特有;12个突变位点可用于建立耐药株快速检测方法;利用染色体1中2014308位点的A/G多态性建立荧光定量检测方法特异性良好,最低能检测2×10^(1)CFU菌量,可用于临床样品是否含有复方新诺明耐药株的检测。本研究建立了一种羊种布鲁氏菌复方新诺明耐药株的荧光定量检测方法,为我国布病耐药株的防控提供科学依据,同时也为临床用药提供参考。
关键词
羊种布鲁氏菌
复方新诺明
全基因组SNPs
MGB探针
Keywords
Brucella melitensis
trimethoprim-sulfamethoxazole
whole genome SNPs
MGB modified probe
分类号
S852.614 [农业科学—基础兽医学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
插入序列共同区家族元件结构特征、参与捕获的耐药基因及启动子预测
杜逸瑶
宿哲弟
王娟
袁敏
刘志国
邱小彤
徐帅
李振军
《动物医学进展》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
一种羊种布鲁氏菌复方新诺明耐药株荧光定量PCR检测方法的建立
杨晓雯
宁文晴
周师众
袁雅琴
侯雪新
丁家波
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
