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题名秋石斛DenTFL1基因的克隆与表达分析
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作者
莫顺金
李政锜
于晓云
陆顺教
廖易
易双双
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机构
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室/海南省热带作物资源遗传改良与创新重点实验室
海南省热带观赏植物种质资源创新利用工程技术研究中心
海南大学热带农林学院
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出处
《热带作物学报》
北大核心
2025年第4期798-806,共9页
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基金
海南省重大科技计划项目(No.ZDKJ2021015)
海南省自然科学基金项目(No.322QN395)
现代农业产业技术体系建设专项(No.CARS-23-G60)。
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文摘
TFL1基因属于磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein,PEBP)家族成员,与植物开花调控密切相关。为探究秋石斛中TFL1基因的功能,本研究基于花序发育转录组数据库克隆了1个秋石斛TFL1同源基因DenTFL1,并对其进行生物信息分析、蛋白结构和亚细胞定位预测以及表达模式的分析。结果表明:秋石斛DenTFL1基因cDNA全长522 bp,编码173个氨基酸;DenTFL1蛋白分子式为C_(870)H_(1354)N_(246)O_(249)S_(6),分子量为19.43 kDa,理论等电点(pI)为7.82,蛋白具有亲水性,结构稳定;DenTFL1蛋白不含有信号肽和跨膜结构域,预测该蛋白定位于细胞质,其二级结构以无规则卷曲为主,占比61.85%,还含有23.70%的延伸链,14.45%的α-螺旋,三维结构模型与二级结构基本一致。蛋白保守结构域分析结果显示,DenTFL1含有PEBP保守结构域。根据氨基酸序列比对和系统进化树分析发现,DenTFL1基因与金钗石斛、球花石斛中的同源基因亲缘关系较近且蛋白序列的一致性较高,进化较为保守。蛋白质互作网络预测结果显示,秋石斛DenTFL1蛋白主要与AT5G63440、LFY、SOC1、AGL24、AGL8等蛋白发生互作。实时定量PCR结果表明,DenTFL1基因在秋石斛不同生长发育阶段的各个组织部位均有表达,其中在幼苗和成熟株的茎以及花柄中的表达量最高,在幼苗的根以及中苗的叶片和根中的表达量则相对较低;在花序发育的不同阶段均有较高的表达量(除了长度为3.0 cm的花序之外),在发育后期的花苞和成熟花各轮花器官中高表达,而在发育早期的各轮花器官中的表达量相对较低。本研究为进一步揭示TFL1基因在秋石斛中花期调控提供一定的理论依据。
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关键词
秋石斛
DenTFL1
基因克隆
表达分析
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Keywords
Dendrobium hybrid
DenTFL1
gene cloning
expression analysis
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分类号
S682.31
[农业科学—观赏园艺]
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