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陆稻过氧化氢酶基因(OsCATB-lh)的克隆及生物信息学分析
1
作者
邢淑莲
姚艳丽
+2 位作者
徐磊
胡小文
刘洋
《广东农业科学》
CAS
2015年第19期106-110,共5页
为深入了解陆稻过氧化氢酶(CAT)基因的序列特点和生物信息学信息,以粳型陆稻品种泸旱3号为材料,利用同源克隆技术成功获得1条陆稻CAT基因序列(Gen Bank登录号:KR133179)。该序列全长1 739 bp,其中编码区ORF全长1 479 bp,编码492个氨基...
为深入了解陆稻过氧化氢酶(CAT)基因的序列特点和生物信息学信息,以粳型陆稻品种泸旱3号为材料,利用同源克隆技术成功获得1条陆稻CAT基因序列(Gen Bank登录号:KR133179)。该序列全长1 739 bp,其中编码区ORF全长1 479 bp,编码492个氨基酸。生物信息学分析发现,此基因是位于水稻基因组第6号染色体的单拷贝基因。对其编码蛋白分析表明,其具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族。与水稻CAT基因序列(Os CATB)进行比较发现,Os CATB-lh与水稻Os CATB基因核苷酸序列一致性达到99%,存在6个核苷酸差异位点;与水稻Os CATB蛋白序列一致性为99%,有3个氨基酸变异位点。
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关键词
陆稻
过氧化氢酶
基因克隆
序列分析
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题名
陆稻过氧化氢酶基因(OsCATB-lh)的克隆及生物信息学分析
1
作者
邢淑莲
姚艳丽
徐磊
胡小文
刘洋
机构
中国热带农业科学院湛江实验站/中国热带农业科学院热带旱作农业研究中心
出处
《广东农业科学》
CAS
2015年第19期106-110,共5页
基金
中国热带农业科学院湛江实验站科研启动专项资金(zjky201304)
文摘
为深入了解陆稻过氧化氢酶(CAT)基因的序列特点和生物信息学信息,以粳型陆稻品种泸旱3号为材料,利用同源克隆技术成功获得1条陆稻CAT基因序列(Gen Bank登录号:KR133179)。该序列全长1 739 bp,其中编码区ORF全长1 479 bp,编码492个氨基酸。生物信息学分析发现,此基因是位于水稻基因组第6号染色体的单拷贝基因。对其编码蛋白分析表明,其具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族。与水稻CAT基因序列(Os CATB)进行比较发现,Os CATB-lh与水稻Os CATB基因核苷酸序列一致性达到99%,存在6个核苷酸差异位点;与水稻Os CATB蛋白序列一致性为99%,有3个氨基酸变异位点。
关键词
陆稻
过氧化氢酶
基因克隆
序列分析
Keywords
upland rice
catalase
gene clone
sequence analysis
分类号
S511.6 [农业科学—作物学]
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作者
出处
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1
陆稻过氧化氢酶基因(OsCATB-lh)的克隆及生物信息学分析
邢淑莲
姚艳丽
徐磊
胡小文
刘洋
《广东农业科学》
CAS
2015
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