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题名荔枝果实酸性转化酶LcSAI生物信息学和表达分析
被引量：2
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作者
董晨
魏永赞
王弋
郑雪文
李伟才
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机构
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农村农业部热带果树生物学重点实验室
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出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期989-996,共8页
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基金
国家重点研发计划(2019YFD1000900)
中央级公益性科研院所基本科研业务专项(1630062021010)
+1 种基金
国家荔枝龙眼产业技术体系(CARS-32-20)
广东省自然科学基金(2018A030307012)。
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文摘
酸性转化酶作为蔗糖代谢中的关键酶,在还原糖积累型荔枝中表达及酶活性显著高于蔗糖积累型荔枝。为了全面了解酸性转化酶的生物学特征,该文通过运用生物信息学方法对荔枝果实酸性转化酶LcSAI基因的基本理化性质、蛋白二级结构、亲水性/疏水性、跨膜结构域、信号肽、磷酸化位点、保守结构域、系统进化进行系统的分析;利用qRT-PCR技术对LcSAI在‘妃子笑’不同组织和果实不同发育阶段进行表达分析。结果表明:(1)荔枝果实酸性转化酶为定位于液泡的亲水性不稳定蛋白,无信号肽,其蛋白的二级结构主要有无规则卷曲和延伸链构件,并散布于整个蛋白;(2)在N-端含有一个跨膜区,包含两个保守结构域,位于N-端的Pfam DUF3357结构域和Glyco_32结构域,属于糖基水解酶基因家族32超家族;(3)系统进化分析结果显示LcSAI与龙眼酸性转化酶基因同源,不同组织间LcSAI表达水平为雄花>根>嫩茎>种子>嫩叶>雌花>果皮>老叶,果实不同发育阶段LcSAI表达具有特异性。该研究为深入研究LcSAI果实酸性转化酶基因调控蔗糖代谢途径机理提供数据依据。
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关键词
荔枝
酸性转化酶
生物信息学
表达分析
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Keywords
Litchi chinensis
acid invertase
bioinformatics
expression analysis
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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