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一株新型海洋噬藻体QB2的分离、基因组学分析及生物地理分布
1
作者 苏畅 崔丹华 +6 位作者 周洪艳 王天聪 王褚晓 陈鑫 邵红兵 郭萃 汪岷 《海洋与湖沼》 北大核心 2025年第2期380-392,共13页
在南海海盆区分离得到一株侵染海洋聚球藻的噬藻体QB2,分析表明其基因组全长为171898bp,GC含量为41.49%。在噬藻体QB2基因组中检测到212个开放阅读框(ORFs)和7个tRNA基因。所预测到的ORFs根据功能可分为病毒粒子结构模块、DNA复制与调... 在南海海盆区分离得到一株侵染海洋聚球藻的噬藻体QB2,分析表明其基因组全长为171898bp,GC含量为41.49%。在噬藻体QB2基因组中检测到212个开放阅读框(ORFs)和7个tRNA基因。所预测到的ORFs根据功能可分为病毒粒子结构模块、DNA复制与调控模块、包装模块和辅助代谢功能模块。其携带有与光合作用、碳代谢、磷代谢、能量获取和应激调节等相关的20个辅助代谢基因,可能在调控噬藻体侵染过程中宿主的能量代谢方面发挥关键作用。系统发育分析表明噬藻体QB2与Kyanoviridae科Tefnutvirus属成员亲缘关系密切,且与该属成员S-IOM18的核苷酸同一性为80.3%,表明噬藻体QB2可被归类为Tefnutvirus属的新物种。噬藻体QB2的同源基因的生物地理分布分析表明,其主要分布在温热带海洋浅层区、温热带海洋中层区以及北极海区。本研究丰富了蓝藻噬藻体的基因组数据库,为进一步研究噬藻体的系统发育及其与宿主的相互作用提供了基础数据。 展开更多
关键词 噬藻体 聚球藻 基因组分析 辅助代谢基因 生物地理分布
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青岛潮间带海洋线虫群落结构和功能性状及其对沉积环境因子的响应
2
作者 孙宏斌 刘晓收 《生态学报》 北大核心 2025年第20期10164-10177,共14页
为揭示海洋线虫群落结构和功能性状对潮间带沉积环境因子的响应敏感性,于2024年3月在青岛三个不同底质类型的潮间带(泥质、砂质和泥砂混合质)进行了海洋线虫和环境因子样品现场采集。共鉴定出海洋线虫145种,隶属于80属,27科,7目,2纲。... 为揭示海洋线虫群落结构和功能性状对潮间带沉积环境因子的响应敏感性,于2024年3月在青岛三个不同底质类型的潮间带(泥质、砂质和泥砂混合质)进行了海洋线虫和环境因子样品现场采集。共鉴定出海洋线虫145种,隶属于80属,27科,7目,2纲。沉积物氧化还原水平对线虫分布具有显著影响,氧化层线虫丰度极显著高于还原层(P<0.001),随着沉积物深度的增加线虫群落多样性和功能多样性显著下降(P<0.05)。冗余分析(RDA)显示,环境因子对线虫群落水平的影响共有40.62%的解释度,其中RDA1轴的解释度为24.2%;环境因子对线虫功能性状组成的影响共有86.96%的解释度,其中RDA1轴的解释度为71.44%。在基于分类水平的RDA分析中,RDA1轴上载荷较高的环境因子为沉积物含水量、总氮和脱镁叶绿酸含量;在基于功能性状的RDA分析中,RDA1轴上载荷最高的环境因子为沉积物氧化还原电位水平。偏最小二乘路径模型分析结果显示,外生变量中氧化还原电位水平在驱动线虫功能性状结构的改变上占据核心作用,总效应最强(-0.25),而中值粒径的总效应微弱(0.013);功能性状变异的环境解释率(0.67)和总效应绝对值(0.78)都显著高于群落结构。研究结果表明,在潮间带环境中,海洋线虫功能性状比群落结构对沉积物的环境变化更敏感,这种敏感性主要体现在氧化还原电位上。 展开更多
关键词 自由生活海洋线虫 功能性状 群落结构 潮间带 氧化还原电位
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广西北海红树林湿地小型底栖动物群落结构与时空分布
3
作者 马千惠 张鹤露 +2 位作者 陈光程 欧丹云 刘晓收 《海洋学报》 北大核心 2025年第5期99-111,共13页
为研究广西北海红树林湿地小型底栖动物的群落特征,于2021年1月(冬季)和7月(夏季),在广西北海红树林湿地设置3个断面共9个站位,进行小型底栖动物及环境因子的定量采样。结果表明,冬、夏季小型底栖动物的平均丰度分别为(2617.17±973... 为研究广西北海红树林湿地小型底栖动物的群落特征,于2021年1月(冬季)和7月(夏季),在广西北海红树林湿地设置3个断面共9个站位,进行小型底栖动物及环境因子的定量采样。结果表明,冬、夏季小型底栖动物的平均丰度分别为(2617.17±973.13)ind./(10 cm^(2))和(1173.69±535.75)ind./(10 cm^(2))。红树林断面小型底栖动物平均丰度最高,为(2398.23±1502.71)ind./(10 cm^(2)),光滩断面最低,为(1539.55±731.04)ind./(10 cm^(2)),养殖断面为(1748.50±469.20)ind./(10 cm^(2))。冬季小型底栖动物的平均生物量(干重,后同)为(3686.93±1096.40)μg/(10 cm^(2)),夏季平均生物量为(2258.18±1019.48)μg/(10 cm^(2))。光滩断面小型底栖动物的平均生物量最高,为(3650.13±1188.95)μg/(10 cm^(2))。养殖断面最低,为(2272.32±531.48)μg/(10 cm^(2))。红树林断面为(2995.21±1499.03)μg/(10 cm^(2))。各季节及各断面均鉴定出10个小型底栖动物类群,海洋线虫均为最优势类群。光滩断面小型底栖动物群落最为独特,体现在其小型底栖动物的丰度最低而生物量最高,在类群组成上均匀性也更高,整体群落结构较其余两个断面差异更大。这与光滩断面独特的环境特征有关,尤其是较大的沉积物颗粒、较高的温度和较低含水量的影响,且整体环境状况最佳。根据N/C比值的评价结果,研究区域环境状况整体良好。 展开更多
关键词 小型底栖动物 群落结构 时空分布 红树林 广西北海
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