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一株新型海洋噬藻体QB2的分离、基因组学分析及生物地理分布
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作者 苏畅 崔丹华 +6 位作者 周洪艳 王天聪 王褚晓 陈鑫 邵红兵 郭萃 汪岷 《海洋与湖沼》 北大核心 2025年第2期380-392,共13页
在南海海盆区分离得到一株侵染海洋聚球藻的噬藻体QB2,分析表明其基因组全长为171898bp,GC含量为41.49%。在噬藻体QB2基因组中检测到212个开放阅读框(ORFs)和7个tRNA基因。所预测到的ORFs根据功能可分为病毒粒子结构模块、DNA复制与调... 在南海海盆区分离得到一株侵染海洋聚球藻的噬藻体QB2,分析表明其基因组全长为171898bp,GC含量为41.49%。在噬藻体QB2基因组中检测到212个开放阅读框(ORFs)和7个tRNA基因。所预测到的ORFs根据功能可分为病毒粒子结构模块、DNA复制与调控模块、包装模块和辅助代谢功能模块。其携带有与光合作用、碳代谢、磷代谢、能量获取和应激调节等相关的20个辅助代谢基因,可能在调控噬藻体侵染过程中宿主的能量代谢方面发挥关键作用。系统发育分析表明噬藻体QB2与Kyanoviridae科Tefnutvirus属成员亲缘关系密切,且与该属成员S-IOM18的核苷酸同一性为80.3%,表明噬藻体QB2可被归类为Tefnutvirus属的新物种。噬藻体QB2的同源基因的生物地理分布分析表明,其主要分布在温热带海洋浅层区、温热带海洋中层区以及北极海区。本研究丰富了蓝藻噬藻体的基因组数据库,为进一步研究噬藻体的系统发育及其与宿主的相互作用提供了基础数据。 展开更多
关键词 噬藻体 聚球藻 基因组分析 辅助代谢基因 生物地理分布
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Hypoxia Exercise Mediates The miR-27/PPARγ Pathway to Improve Lipid Metabolism in Obese Ratsat Target Genes and Protein Levels
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作者 KONG Wei SHAO Jie +4 位作者 ZHAI Teng CHENG Qian HAN Fang-Zheng QU Yi ZHU Lei 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第6期1386-1400,共15页
Objective To explore the sequential effects of hypoxic exercising on miR-27/PPARγand lipid metabolism targetgene and protein expression levels in the obesity rats’liver.Methods 13-week-old male diet-induced obesity ... Objective To explore the sequential effects of hypoxic exercising on miR-27/PPARγand lipid metabolism targetgene and protein expression levels in the obesity rats’liver.Methods 13-week-old male diet-induced obesity rats were randomlydivided into three groups(n=10):normal oxygen concentration quiet group(N),hypoxia quiet group(H),hypoxic exercise group(HE).Exercise training on the horizontal animal treadmill for 1 h/d,5 d/week for a total of 4 week,and the intensity of horizontaltreadmill training was 20 m/min(hypoxic concentration was 13.6%).Comparison of the weights of perirenal fat and epididymal fat in rats across different groups and calculation of Lee’s index based on body weight and body length of rats in each group were done.And the serum concentrations of total cholesterol(TC),triglyceride(TG),low density lipoprotein cholesterol(LDL-C),high-densitylipoprotein cholesterol(HDL-C)levels were detected.RT-PCR and Western Blot were used to detect the levels of miR-27,PPARγ,CYP7A1 and CD36.Results Hypoxic exercise decreased the expression levels of miR-27 in the obese rats’liver,however,theexpression level of PPARγwas gradually increased.The expression levels of miR-27 in HE group were significantly lower than Ngroup(P<0.05).The expression levels of PPARγmRNA in N group were significantly lower than H group(P<0.05),especially lowerthan HE group(P<0.01).The protein expression of PPARγprotein in N group was significantly lower than that other groups(P<0.01).The expression of lipid metabolism-related genes and proteins increased in the obese rats’liver.The expression of CYP7A1mRNA in N group was significantly lower than H group(P<0.05),especially lower than HE group(P<0.01).The expression ofCYP7A1 protein in the obese rats’liver in N group was extremely lower than H group and HE group(P<0.01).The proteinexpression of CD36 in N group was significantly lower than that in HE group(P<0.05).Hypoxia exercise improved the relatedphysiological and biochemical indexes of lipid metabolism disorder.The perirenal fat weight of obese rats in HE group wasextremely lower than N group and H group(P<0.01),and the perirenal fat weight in N group was significantly higher than H group(P<0.05).The epididymal fat weight in N group was significantly higher than H group(P<0.05),and extremely higher than HEgroup(P<0.01).The Lee’s index in HE group was extremely lower than N group and H group(P<0.01).The serum concentration ofTC in obese rats in HE group was extremely lower than N group and H group(P<0.01).The serum concentration of TG in HE groupwas extremely lower than N group and H group(P<0.01).The serum concentration of LDL-C in N group was extremely higher thanHE group(P<0.01).The serum concentration of HDL-C in N group was extremely lower than H group(P<0.01).Conclusion Hypoxiaand hypoxia exercise may negatively regulate the levels of PPARγby inhibiting miR-27 in the obese rats’liver,thereby affecting theexpression of downstream target genes CYP7A1 and CD36,and promoting cholesterol,fatty acid oxidation and HDL-C transport inthe liver,and ultimately the lipid levels in obese rats were improved.The effect of hypoxia exercise on improving blood lipid isbetter than simple hypoxia intervention. 展开更多
关键词 hypoxia exercise miR-27 peroxisome proliferators-activated receptor gamma obese rat
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基于近红外光谱与深度学习的紫菜水分无损检测 被引量:6
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作者 张雯雯 胡亚东 +5 位作者 孙文珂 潘明轩 沈照鹏 周兴虎 钱津 王鹏 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2024年第21期190-197,共8页
为探索近红外光谱结合深度学习网络对紫菜水分定量检测的可行性,本研究检测并收集了479组干条斑紫菜的光谱数据和水分含量数据,分别使用四种方法对其中的光谱数据进行了预处理,并在全波段下建立了四种传统定量水分预测模型和一种卷积神... 为探索近红外光谱结合深度学习网络对紫菜水分定量检测的可行性,本研究检测并收集了479组干条斑紫菜的光谱数据和水分含量数据,分别使用四种方法对其中的光谱数据进行了预处理,并在全波段下建立了四种传统定量水分预测模型和一种卷积神经网络(Convolution Neural Networks,CNN)深度学习水分预测模型。对比五种模型预测结果后发现,在S-G平滑结合二阶导数的预处理方法下所建立的CNN模型预测效果最佳,其预测均方根误差(Root-Mean-Square Error of Prediction,RMSEP)值为0.456,预测集决定系数(Coefficient of Determination of Prediction,R_(p)^(2))值为0.990,优化后,该模型的RMSEP值降至0.342,R_(p)^(2)值可以达到0.994(>0.8),同时,外部验证相对误差(Ratio of Performance to Deviation for Validation,RPD)值达6.155(>3),证明了模型实际应用于农业和食品工业的可能性。该CNN模型能够快速、准确、无损地预测条斑紫菜的水分含量,提高了紫菜水分检测的效率和准确性,为相关干制水产品的质量控制提供了重要的参考依据。 展开更多
关键词 条斑紫菜 水分含量 近红外光谱 深度学习 卷积神经网络
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文献计量学分析养殖业废水处理技术研究现状 被引量:1
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作者 赵泽津 熊久强 《工业水处理》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期69-77,共9页
为全面分析并总结养殖业废水处理技术研究的现状,利用文献计量学方法,对近10 a来CNKI和Web of Science(WoS)核心合集数据库中与养殖业废水处理技术相关的文献进行筛选整理,分别获得1043篇和233篇有效文献样本。通过CiteSpace和VOSviewe... 为全面分析并总结养殖业废水处理技术研究的现状,利用文献计量学方法,对近10 a来CNKI和Web of Science(WoS)核心合集数据库中与养殖业废水处理技术相关的文献进行筛选整理,分别获得1043篇和233篇有效文献样本。通过CiteSpace和VOSviewer软件对文献样本的发文年份、国家、作者和研究机构以及关键词等方面进行可视化分析,研究结果表明:中国在养殖废水处理技术领域的研究占据主导地位,热度远高于其他国家。国内外研究该领域的核心学科均为环境类,但农业、工程类及生物、化学等学科也对该领域的发展做出一定贡献,这种跨学科性质促进了处理技术的更新和创新,有助于处理复杂的污染物。但目前该领域尚未形成紧密的全球合作网络,未来跨机构合作潜力大。近10 a来,该领域研究已向高效、无二次污染的新型处理方向转变,有效处理的污染物种类不断增多,并对可持续性和资源、能源回收更加重视。 展开更多
关键词 文献计量学 可视化分析 养殖业 废水处理技术
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降尿酸活性发酵乳杆菌F40-4在酸乳发酵中的应用
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作者 吴宇 曹佳媛 +2 位作者 刘伊索 刘银雪 易华西 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第17期168-173,共6页
高尿酸血症是嘌呤代谢紊乱、血尿酸浓度持续增高引起组织损伤的一种异质性疾病,严重的情况下有可能引发痛风等症状,益生菌具有潜在的缓解或治疗作用。该研究的目的是探究前期筛选得到的1株具有降尿酸活性的发酵乳杆菌(Lactobacillus fer... 高尿酸血症是嘌呤代谢紊乱、血尿酸浓度持续增高引起组织损伤的一种异质性疾病,严重的情况下有可能引发痛风等症状,益生菌具有潜在的缓解或治疗作用。该研究的目的是探究前期筛选得到的1株具有降尿酸活性的发酵乳杆菌(Lactobacillus fermentum)F40-4在酸乳发酵中的应用潜力。结果显示,L.fermentum F40-4对酸乳发酵剂主体菌株嗜热链球菌和保加利亚乳杆菌的生长没有显著影响;与对照组相比,L.fermentum F40-4对发酵过程中酸乳的pH、酸度指标影响不大,L.fermentum F40-4和发酵剂1∶1接种发酵可延缓酸乳在冷藏过程中的pH下降进程并减少乳清析出;风味分析结果表明,L.fermentum F40-4酸乳的挥发性风味化合物更加丰富,主要含有酯类、醛类、醇类、酮类、酸类、烃类,其中酯类和醛类含量最高。该研究表明,L.fermentum F40-4可作为辅助发酵菌株用于酸乳的发酵,为进一步开发具有降尿酸功效的益生菌酸乳提供了理论依据。 展开更多
关键词 发酵乳杆菌 酸乳 辅助发酵剂 发酵
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消毒剂对重组Ⅲ型人源化胶原蛋白促细胞黏附活性的影响 被引量:1
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作者 李怡桐 孙艳艳 +3 位作者 乔绍俊 侯丽莉 李熳琴 于玉凤 《日用化学工业(中英文)》 CAS 北大核心 2023年第7期789-795,共7页
通过CCK8实验探究75%乙醇、碘伏、葡萄糖酸洗必泰、苯扎氯铵、苯扎溴铵对细胞的毒性以及对重组Ⅲ型人源化胶原蛋白(rhColⅢ)促细胞的黏附活性的影响,预测消毒剂的使用在面部填充时对胶原蛋白活性的影响,为临床应用提供指导。结果显示:... 通过CCK8实验探究75%乙醇、碘伏、葡萄糖酸洗必泰、苯扎氯铵、苯扎溴铵对细胞的毒性以及对重组Ⅲ型人源化胶原蛋白(rhColⅢ)促细胞的黏附活性的影响,预测消毒剂的使用在面部填充时对胶原蛋白活性的影响,为临床应用提供指导。结果显示:各消毒剂对NIH/3T3小鼠胚胎成纤维细胞和HFB人皮肤成纤维细胞均表现出细胞毒性,比较结果为:葡萄糖酸洗必泰<苯扎氯铵、苯扎溴铵<75%乙醇、碘伏,该结果也间接提示75%乙醇、碘伏消毒效果较佳;将各消毒剂原液稀释100倍后,其对rhColⅢ促细胞黏附活性影响比较为:葡萄糖酸洗必泰、苯扎氯铵<75%乙醇<碘伏、苯扎溴铵。碘伏和苯扎溴铵工作液直接接触rhColⅢ均显著降低其促细胞黏附活性,碘伏、葡萄糖酸洗必泰、苯扎溴铵工作液直接接触rhColⅢ可导致其发生聚集。 展开更多
关键词 重组人源化胶原蛋白 填充 消毒剂 细胞毒性 细胞黏附活性
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