鱼类中鳞被发育的研究进展及展望 被引量：1

1

作者 蒋丽 张保勇 +2 位作者 李恒德 徐鹏 孙效文 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第34期21032-21033,共2页

综述了鳞被类型和研究进展,对将来了解鳞被的发生及形态建成的分子机制,同时对于理解上皮-间质细胞之间的互作具有非常重要的理论意义。

关键词 鳞被 发育 模式形成

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雌核发育三倍体方正银鲫研究进展 被引量：3

2

作者 贾智英 孙效文 《水产学杂志》 CAS 2006年第1期84-89,共6页

方正银鲫（Carassius auratus auratus L. ）产于黑龙江省方正县双风水库，属鲫鱼的一个地理种群。它与日本和东欧银鲫一样，是一个天然雌核发育种群，因而所产生的后代与母本相似。沈俊宝等用鲤鱼精子与方正银鲫受精时没出现杂交个体... 方正银鲫（Carassius auratus auratus L. ）产于黑龙江省方正县双风水库，属鲫鱼的一个地理种群。它与日本和东欧银鲫一样，是一个天然雌核发育种群，因而所产生的后代与母本相似。沈俊宝等用鲤鱼精子与方正银鲫受精时没出现杂交个体，蒋一珪等用照射处理的草鱼精液受精的鲫鱼后代也与母本相似。与日本银鲫和东欧银鲫不同的是，在自然群体中方正银鲫雄鱼约占15％。由于方正银鲫较二倍体鲫鱼具有生长速度快的特点，因而它已成为我国重要的养殖鱼类。本文综述了方正银鲫研究成果，特别是对其特定遗传特性如性别决定等作了详细论述。 展开更多

关键词 银鲫 雌核发育 三倍体

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鲤鱼微卫星标记与体重、体长和体高性状的相关分析 被引量：48

3

作者 张义凤 张研 +2 位作者 鲁翠云 曹顶臣 孙效文 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期613-619,共7页

利用47个鲤鱼微卫星标记,对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系自交F2代的92个个体基因组DNA进行检测,得到162个等位基因,各座位等位基因数2～6个,片段长度100～444bp,有效等位基因数1.3069～4.2288,杂合度0.2361～0.7677,位点多态信息含量0.536... 利用47个鲤鱼微卫星标记,对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系自交F2代的92个个体基因组DNA进行检测,得到162个等位基因,各座位等位基因数2～6个,片段长度100～444bp,有效等位基因数1.3069～4.2288,杂合度0.2361～0.7677,位点多态信息含量0.5368。利用统计软件SPSS的GLM程序对47个微卫星标记与鲤鱼体重、体长和体高相关性进行了分析,结果表明HLJ695、HLJ716、HLJ739、HLJ759、HLJ774、K16与体重、体长和体高相关,HLJ776与体高相关。对同一标记不同基因型间进行多重比较,找到与3种性状相关的基因型。 展开更多

关键词 鲤鱼 微卫星 体重 体长 体高 相关分析

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黄颡鱼(Pelteobagrus eupogon)不同生态地理分布群体遗传多样性的微卫星分析 被引量：38

4

作者 李大宇 殷倩茜 +2 位作者 侯宁 孙效文 梁利群 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期460-469,共10页

利用40个黄颡鱼微卫星分子标记对吉林省月亮湖野生黄颡鱼(YL,30尾)、四川野生黄颡鱼(SC,30尾)、黑龙江省哈尔滨市松花江段黄颡鱼(SH,18尾)、湖北省荆州市长湖野生黄颡鱼子代(YY,30尾)及其亲本(QQ,30尾)、天津市换新国家级原良种场黄颡鱼... 利用40个黄颡鱼微卫星分子标记对吉林省月亮湖野生黄颡鱼(YL,30尾)、四川野生黄颡鱼(SC,30尾)、黑龙江省哈尔滨市松花江段黄颡鱼(SH,18尾)、湖北省荆州市长湖野生黄颡鱼子代(YY,30尾)及其亲本(QQ,30尾)、天津市换新国家级原良种场黄颡鱼1号(TJ,30尾)6个黄颡鱼群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,x2检验估计Hardy-Weinberg平衡,采用近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化及其来源。同时,使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA进化树。6个群体共检测到5042个扩增片段,长度在150—650bp,40个基因座扩增出等位基因数从1—8个不等,共计143个等位基因,平均每个基因座扩增得到3.575个等位基因。结果显示:(1)6个黄颡鱼群体的多态性指标均适中,PIC在0.00—0.79之间,平均值为0.40、0.37、0.35、0.39、0.35和0.19,有效等位基因数(Ae)1.00—5.44个不等,平均有效等位基因数依次为2.05、2.30、1.93、2.07、1.93和1.47,无偏期望杂合度(He)在0.00—0.83之间,平均值为0.45、0.46、0.36、0.46、0.41和0.23;(2)遗传相似系数YY与QQ遗传相似度最高(0.9947),TJ与SC遗传相似系数最低(0.4846),聚类结果与地理分布呈一定相关性。 展开更多

关键词 黄颡鱼 遗传多样性 分子标记 微卫星

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鲤鱼(Cyprinus carpioL．)头长、眼径、眼间距QTL的定位 被引量：20

5

作者 刘继红 张研 +5 位作者 常玉梅 梁利群 鲁翠云 张晓峰 徐美佳 孙效文 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期508-514,共7页

用265个AFLP标记、127个微卫星分子标记、37个EST-SSR标记和16个RAPD标记对大头鲤/荷包红鲤抗寒品系的F2雌核发育群体44个个体进行基因型检测,构建鲤鱼遗传连锁图谱。利用软件WinQTLCart2.5采用复合区间作图法对头长、眼径、眼间距3个... 用265个AFLP标记、127个微卫星分子标记、37个EST-SSR标记和16个RAPD标记对大头鲤/荷包红鲤抗寒品系的F2雌核发育群体44个个体进行基因型检测,构建鲤鱼遗传连锁图谱。利用软件WinQTLCart2.5采用复合区间作图法对头长、眼径、眼间距3个性状进行了QTL分析。结果显示,共检测到5个与头长性状相关的QTL,分别定位于鲤鱼连锁图谱的LG2(qHS-2-1)、LG3(qHS-3-1)、LG40(qHS-40-1)和LG4(qHS-4-2和qHS-4-3)上。其中qHS-40-1拥有最大的LOD值,为7.94,可解释的表型变异为34.29%。qHS-4-2的LOD值最小,为5.03,可解释的表型变异为11.52%。5个与头长性状相关的QTL加性效应值均为负值。检测到两个与眼径性状相关的QTL,分别定位于鲤鱼连锁图谱的LG39连锁群(qED-39-1)和LG40连锁群(qED-40-1)上,其中qED-40-1的LOD值比较大,为2.76,其加性效应值为负值,可以解释5.62%的表型变异;qED-39-1的LOD值为2.72,加性效应值为正值,可以解释9.77%的表型变异。检测到两个与眼间距性状相关的QTL,分别定位到鲤鱼连锁图谱的LG20连锁群(qEC-20-1)和LG28连锁群(qEC-28-1)上。其中qEC-20-1的LOD值比较大,为3.77,加性效应值为正值,可以解释8.29%的表型变异;qEC-28-1的LOD值为2.79,对应的加性效应值为负值,可以解释8.88%的表型变异。 展开更多

关键词 鲤鱼 头长 眼径 眼间距 QTL

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红鳍东方鲀两个群体的遗传结构及与经济性状的相关性分析 被引量：14

6

作者 万玉美 王蕾 +3 位作者 谭照君 赵海涛 李恒德 孙效文 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2011年第5期9-16,共8页

本文利用21对多态性微卫星标记对河北省红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)良种场引进的日本群体和选育的秦皇岛群体进行了遗传结构分析。日本与秦皇岛两个群体的有效等位基因数分别为3.3697和2.8593,期望杂合度分别是0.6516和0.6073,多态... 本文利用21对多态性微卫星标记对河北省红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)良种场引进的日本群体和选育的秦皇岛群体进行了遗传结构分析。日本与秦皇岛两个群体的有效等位基因数分别为3.3697和2.8593,期望杂合度分别是0.6516和0.6073,多态信息含量分别是0.6009和0.5509。研究结果表明这两个群体遗传多样性较高,多态信息含量丰富,具有较大的遗传改良和育种潜力。同时,本文通过对21个微卫星座位与日本群体的体长、体重和体高三个经济性状进行最小二乘方差分析,得到6个与经济性状显著相关的微卫星标记,f161、f273与体重显著相关(P<0.05),f170、f501与体长显著相关(P<0.05),而f53、f331与体高显著相关(P<0.05)。对同一标记不同基因型间进行多重比较,找到与4种性状相关的基因型。 展开更多

关键词 红鳍东方鲀(Takifugu rubripes) 微卫星 遗传结构 经济性状 相关性分析

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牙鲆微卫星分子标记与生长性状的相关性分析 被引量：22

7

作者 王桂兴 刘永新 +1 位作者 孙效文 刘海金 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期77-84,共8页

研究利用30对牙鲆微卫星标记,对牙鲆雌核发育家系91个个体基因组DNA进行检测,在30对微卫星标记中,共检测到124个等位基因。其中,各座位的等位基因数3～8个,等位基因片段大小为80～170bp,平均有效等位基因数3.257。其中poli11座位的等位... 研究利用30对牙鲆微卫星标记,对牙鲆雌核发育家系91个个体基因组DNA进行检测,在30对微卫星标记中,共检测到124个等位基因。其中,各座位的等位基因数3～8个,等位基因片段大小为80～170bp,平均有效等位基因数3.257。其中poli11座位的等位基因数目最多为8。平均多态信息含量为0.6197,平均杂合度为0.6672。利用SAS8.2中的一般线性模型(GLM)对30个微卫星标记与牙鲆的生长性状进行连锁显著性检验。发现在30个微卫星座位中,有8个座位分别与体重、体长、体高显著相关。其中,poli6TUF位点与体重相关;poli30TUF、poli107TUF、poli108TUF、poli116TUF、poli123TUF、poli130TUF6个座位与体长显著相关;poli145TUF与体重、体长显著相关,而与体高相关性不显著。poli9-8TUF与体重、体长、体高3个性状均显著相关(P<0.05)。将基因型与生长性状进行Duncan多重比较,找到4种与生长性状相关的基因型。 展开更多

关键词 牙鲆 微卫星 生长性状 基因型 相关性分析

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鲤鱼(Cyprinus carpio L.)体重和体长QTL的定位 被引量：9

8

作者 刘继红 张研 +5 位作者 常玉梅 梁利群 张晓峰 鲁翠云 徐美佳 孙效文 《广东海洋大学学报》 CAS 2009年第4期19-25,共7页

利用265个AFLP标记、127个微卫星分子标记、37个EST-SSR标记和16个RAPD标记(共445个标记)对大头鲤/荷包红鲤抗寒品系的F2代雌核发育群体44个个体进行基因型检测,构建鲤鱼(Cyprinus carpio L.)遗传连锁图谱;利用软件WinQTLCart2.5采用复... 利用265个AFLP标记、127个微卫星分子标记、37个EST-SSR标记和16个RAPD标记(共445个标记)对大头鲤/荷包红鲤抗寒品系的F2代雌核发育群体44个个体进行基因型检测,构建鲤鱼(Cyprinus carpio L.)遗传连锁图谱;利用软件WinQTLCart2.5采用复合区间作图法对体重和体长两个性状进行了QTL定位分析。结果共检测到与两个与体重性状相关的QTL,分别定位到LG24连锁群(qBWh-24-1)和LG20连锁群(qBWh-20-1)上,可解释的表型变异分别为7.98%和20.05%;检测到两个与体长性状相关的QTL,分别位于LG2连锁群(qFS-2-1)和LG20连锁群(qFS-20-1),可解释的表型变异分别为5.69%和12.69%,4个QTL的加性效应均为负值。 展开更多

关键词 鲤鱼 体长 体重 QTL

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微卫星标记对红鳍东方鲀繁殖的指导应用及遗传分析 被引量：13

9

作者 谷晶晶 朱迎军 +1 位作者 孟雪松 孙效文 《水产科学》 CAS 北大核心 2010年第9期527-531,共5页

利用已有设计的20个具有多态性的微卫星标记对16尾红鳍东方鲀亲鱼(10尾♂,6尾♀)的有效等位基因数、观望杂合度、期望杂合度、多态信息含量、遗传相似性系数、遗传距离等进行了检测。据此设计了10对亲鱼配组,获得10个子代家系。其中母本... 利用已有设计的20个具有多态性的微卫星标记对16尾红鳍东方鲀亲鱼(10尾♂,6尾♀)的有效等位基因数、观望杂合度、期望杂合度、多态信息含量、遗传相似性系数、遗传距离等进行了检测。据此设计了10对亲鱼配组,获得10个子代家系。其中母本中16和8号的平均有效等位基因数和平均期望杂合度较其他亲本高,将其分别与3个父本配组,其他则参照遗传距离进行配组。于次年,对F110个家系的体质量、体长均值进行了比对,发现16♀与11♂配组得到的子代体质量、体长均值为最大。8♀和10♂配组得到的子代体质量、体长均值最小。结果表明,红鳍东方鲀子代杂种优势与亲本个体差异有关。 展开更多

关键词 红鳍东方鲀 繁殖配组 遗传距离 微卫星

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大菱鲆微卫星标记的分离及其多态性位点检测 被引量：9

10

作者 顾颖 郭忠宝 +3 位作者 谷晶晶 毛瑞鑫 鲁翠云 孙效文 《大连水产学院学报》 CSCD 北大核心 2009年第4期366-370,共5页

以生物素标记的（CA）12为探针进行杂交，借助磁珠筛选出含微卫星的Mbo I酶切片段，构建了大菱鲆Scophthalmus maximus微卫星富集文库，用同位素γ-^23P标记的探针（CA）12进行二次筛选，获得1600个阳性克隆，占59．3％。测序347个序列... 以生物素标记的（CA）12为探针进行杂交，借助磁珠筛选出含微卫星的Mbo I酶切片段，构建了大菱鲆Scophthalmus maximus微卫星富集文库，用同位素γ-^23P标记的探针（CA）12进行二次筛选，获得1600个阳性克隆，占59．3％。测序347个序列，得到335个（96．54％）含有微卫星序列的克隆，其中含有微卫星座位378个。完美型的微卫星序列有236个（62．4％），非完美型的有121个（32．0％），复合型的有21个（5．6％），从所得序列中分离和鉴定了32对微卫星标记。利用31尾大菱鲆养殖个体评价微卫星位点，分析表明，10个位点具有多态性。不同位点等位基因数目为3～11不等，期望杂合度（He）和多态信息含量（PIC）变动范围分别为0．5061—0．8995和0．4133～0．8742。本研究中开发的微卫星多态性较高，将为大菱鲆养殖品系的优化、遗传多样性的检测及遗传图谱的构建等打下基础。 展开更多

关键词 大菱鲆 微卫星 多态性 磁珠

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虾夷扇贝遗传结构及微卫星标记与经济性状相关分析 被引量：6

11

作者 张立冬 王蕾 高悦勉 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期115-122,共8页

选用30个多态性微卫星分子标记对大连大长山(96个)、大连獐子岛(96个)及日本青森县陆奥湾(96个)3个地区虾夷扇贝养殖群体(Patinopecten yessoensis)进行遗传多样性分析。结果显示,30个基因座共检测到198个等位基因(Na),平均等位基因数为... 选用30个多态性微卫星分子标记对大连大长山(96个)、大连獐子岛(96个)及日本青森县陆奥湾(96个)3个地区虾夷扇贝养殖群体(Patinopecten yessoensis)进行遗传多样性分析。结果显示,30个基因座共检测到198个等位基因(Na),平均等位基因数为6.63个,每个座位检测到的等位基因数为3-12,有效等位基因数(Ne)每个位点平均为4.70个,观测杂合度(Ho)平均值0.58,期望杂合度(He)的平均值为0.75,30个位点的平均多态信息含量为0.703,说明3个地区虾夷扇贝群体遗传多样性水平较高。运用统计软件SPSS11.5对30个微卫星标记与大长山群体生长性状相关性进行了分析。结果表明,位点DQ221714和FJ262378与壳长、壳高、壳宽和鲜重显著相关(P<0.05)位点;位点FJ262372与壳宽、软体部重和闭壳肌重显著相关;位点FJ262369与软体部重及闭壳肌重显著相关。对差异显著的位点进行不同基因型间的多重比较,找到了与虾夷扇贝生长性状相关的基因型,进一步将所得显著性标记对大长山虾夷扇贝个体最大的17个和个体最小的13个基因组DNA进行检测,验证其准确性。结果表明,位点DQ221714在两组虾夷扇贝中存在特异性条带,可作为QTL定位候选标记。 展开更多

关键词 虾夷扇贝 微卫星 分子标记 遗传多样性 相关分析

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红鳍东方鲀F1代混养群体的基因型鉴定及QTL分析 被引量：9

12

作者 刘秀云 康大海 +1 位作者 孙效文 孟雪松 《水产科学》 CAS 北大核心 2008年第12期641-644,共4页

利用微卫星标记的方法,分别对3个家系红鳍东方鲀的基因型进行鉴定,并通过此方法对3个家系混养后的混合群体进行区分,利用区分的结果与混合群体的生长性状指标进行QTL分析,结果为F0041中的基因型153/150,标记F0254中的基因型325/335,标记... 利用微卫星标记的方法,分别对3个家系红鳍东方鲀的基因型进行鉴定,并通过此方法对3个家系混养后的混合群体进行区分,利用区分的结果与混合群体的生长性状指标进行QTL分析,结果为F0041中的基因型153/150,标记F0254中的基因型325/335,标记F0220中的基因型175/189,标记F0254中的基因型325/335与河鲀的体长、体质量表型值正相关,标记F0041基因型153/143,F0151标记中的250/250基因型,标记F0157中的基因型167/198,标记F0220中的基因型175/205与河鲀的体长、体质量表型值负相关。以期采用此方法能够为今后的亲子鉴定、个体识别及家系识别提供理论基础。 展开更多

关键词 红鳍东方鲀 群体 基因型 QTL

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荧光原位杂交概述 被引量：3

13

作者 耿波 梁利群 孙效文 《水产学杂志》 CAS 2004年第2期89-92,共4页

关键词 荧光原位杂交 探针 染色体

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