RNA干扰技术在鱼类中的研究进展 被引量：8

1

作者 韩林强 李胜杰 +1 位作者 于凌云 白俊杰 《南方水产》 2009年第3期67-73,共7页

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是真核生物体内利用双链RNA(double strand RNA,dsRNA)诱导同源靶基因的mRNA特异性降解,从而导致转录后基因沉默(posttranscriptional gene silencing,PTGS)的现象。RNAi主要通过核酸酶Dicer切割dsRNA生... RNA干扰(RNA interference,RNAi)是真核生物体内利用双链RNA(double strand RNA,dsRNA)诱导同源靶基因的mRNA特异性降解,从而导致转录后基因沉默(posttranscriptional gene silencing,PTGS)的现象。RNAi主要通过核酸酶Dicer切割dsRNA生成21～23nt的小干扰RNA(small interference RNA,siRNA),继而由siRNA识别并靶向降解同源靶基因mRNA,从而抑制靶基因的蛋白表达。文章综述了RNA干扰技术的原理、siR-NA的制备及在鱼类中的研究进展。 展开更多

关键词 RNA干扰 基因沉默 鱼类

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鱼类标志技术的研究进展 被引量：3

2

作者 李胜杰 白俊杰 《现代农业科技》 2008年第20期224-226,共3页

鱼类标志技术在鱼类遗传育种和引种驯化中得到广泛应用,同时它也是一种研究鱼类分布、种群密度、洄游和鱼类资源等的重要方法。综述了鱼类标志技术的种类、优缺点及研究应用等,以期推动鱼类标志技术的发展。

关键词 鱼类 标志技术 研究进展

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大口黑鲈早期生长发育规律的研究 被引量：27

3

作者 何小燕 白俊杰 +2 位作者 樊佳佳 李胜杰 刘小林 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期23-29,共7页

为了研究大口黑鲈Micropterus salmodies早期生长的发育规律,选用8个全同胞家系的大口黑鲈,每月从每个家系中随机选取30～40尾,对其体重和体长进行测量。运用Gompertz、Logistic和Von Bertalanffy3种非线性模型对大口黑鲈体重和体长的... 为了研究大口黑鲈Micropterus salmodies早期生长的发育规律,选用8个全同胞家系的大口黑鲈,每月从每个家系中随机选取30～40尾,对其体重和体长进行测量。运用Gompertz、Logistic和Von Bertalanffy3种非线性模型对大口黑鲈体重和体长的生长进行非线性曲线拟合分析,同时利用幂函数方法对大口黑鲈体重与体长的生长关系进行分析。结果表明:3种非线性模型均能较好的模拟大口黑鲈体重和体长的生长,而Logistic模型拟合效果更佳;进一步分析体重和体长的最佳拟合参数,发现体重和体长的拐点月龄分别为5.77月龄和4.95月龄,拐点处体重和拐点处体长分别为146.35 g、13.75 cm;幂函数方程能很好地拟合大口黑鲈体重和体长之间的关系,其方程为W=0.076L2.650(R2=0.998)。研究结果可为大口黑鲈养殖中的饲养管理和品种选育提供参考。 展开更多

关键词 大口黑鲈 生长规律 生长曲线拟合

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微卫星标记对中国引进加州鲈养殖群体遗传多样性的分析 被引量：27

4

作者 梁素娴 孙效文 +1 位作者 白俊杰 高俊生 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期694-700,共7页

为了解我国引进加州鲈养殖群体的种群遗传结构和种质资源现状,本文发展了加州鲈的微卫星标记。用磁珠富集法获得加州鲈微卫星标记267个,设计并合成了85对微卫星引物对加州鲈的基因组进行遗传多样性分析,从中筛选出18对并从网上查询获得... 为了解我国引进加州鲈养殖群体的种群遗传结构和种质资源现状,本文发展了加州鲈的微卫星标记。用磁珠富集法获得加州鲈微卫星标记267个,设计并合成了85对微卫星引物对加州鲈的基因组进行遗传多样性分析,从中筛选出18对并从网上查询获得3对共21对引物对加州鲈的基因组DNA进行扩增。PCR扩增产物在8%的聚丙烯酰胺凝胶中分离,硝酸银染色,经紫外成像后对电泳条带进行统计分析。计算得到三个群体的平均等位基因数分别为2.3、2.3和2.1;多态信息含量(PIC)为0.0906—0.7480;平均杂合度观测值分别为0.384、0.396和0.356;杂合度期望值为0.375、0.403和0.368。统计结果初步表明3个不同群体平均杂合度处于中等偏低水平,遗传多样性不高。 展开更多

关键词 加州鲈 微卫星 多态性 DNA

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转基因水生动物的应用研究 被引量：6

5

作者 叶星 王海英 +2 位作者 简清 白俊杰 劳海华 《广东海洋大学学报》 CAS 2007年第1期95-100,共6页

1966年Lin首次报道了将外源基因注入小鼠卵中的显微注射方法。1982年诞生了首例转基因动物——转基因小鼠。1984和1985年转基因虹鳟和鲫鱼研究获得成功。经过二十多年来的努力，转基因水生动物尤其是转基因鱼的研究有了长足的发展。转... 1966年Lin首次报道了将外源基因注入小鼠卵中的显微注射方法。1982年诞生了首例转基因动物——转基因小鼠。1984和1985年转基因虹鳟和鲫鱼研究获得成功。经过二十多年来的努力，转基因水生动物尤其是转基因鱼的研究有了长足的发展。转基因水生动物研究可分为基础研究及应用研究两方面。基础研究方面，与哺乳类相比鱼类产卵量大、胚胎经基因转移操作后不需放回母体内培育，且携带的与人类相关的病原体较少，因此硬骨鱼类成为脊椎动物生物学研究的模型动物，通过转基因以研究基因的结构与功能、基因的表达调控、发育生物学、生理学、遗传学等。应用研究方面，通过转基因技术培育经济性状得到改善的水生动物新品种，以提高其生长速度和饲料转化率，改善品质，控制繁殖或性别表型，增强对病原体的抗性、对环境因子的耐受性或生存能力等；通过转基因使水生动物作为生物反应器表达生产重要药物或生物活性物质；通过转基因改变观赏鱼的表型提高其观赏价值等。有学者预测鱼类将会是首先进行商业性应用的转基因动物，也有学者预测转基因鱼进入市场有望在我国首先实现。笔者对转基因水生动物应用研究方面的进展及存在问题作一综述。 展开更多

关键词 转基因 水生动物 技术 应用 存在问题

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草鱼MyoD基因原核表达研究 被引量：2

6

作者 王立新 白俊杰 +4 位作者 叶星 罗建仁 陈宏 简清 劳海华 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2006年第10期6-10,共5页

采用PCR方法对草鱼MyoD基因开放阅读框进行了改造扩增,构建了草鱼MyoD基因的原核表达载体pBV 220-M yoD,并进行了初步的原核表达研究。结果表明,构建的原核表达载体pBV 220-M yoD含有草鱼My-oD基因完整的开放阅读框;该原核表达载体表达... 采用PCR方法对草鱼MyoD基因开放阅读框进行了改造扩增,构建了草鱼MyoD基因的原核表达载体pBV 220-M yoD,并进行了初步的原核表达研究。结果表明,构建的原核表达载体pBV 220-M yoD含有草鱼My-oD基因完整的开放阅读框;该原核表达载体表达产物的相对分子质量为34 ku,其表达产物占全菌蛋白的10.8%,表达量较低。 展开更多

关键词 草鱼 MyoD基因 原核表达

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大口黑鲈hepcidin真核表达载体构建及表达的初步研究 被引量：1

7

作者 李胜杰 白俊杰 +3 位作者 刘碧莲 叶星 于凌云 全迎春 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2009年第2期71-75,共5页

将大口黑鲈(Micropterus salmoides)抗菌肽hepcidin cDNA定向插入真核表达载体pPICZαA,通过SacI酶切线性化重组表达质粒pPICZαA-hepcidin,电转化毕赤酵母P.pastoris GS115,PCR扩增筛选,甲醇诱导表达等进行了hepcidin真核表达工程菌株... 将大口黑鲈(Micropterus salmoides)抗菌肽hepcidin cDNA定向插入真核表达载体pPICZαA,通过SacI酶切线性化重组表达质粒pPICZαA-hepcidin,电转化毕赤酵母P.pastoris GS115,PCR扩增筛选,甲醇诱导表达等进行了hepcidin真核表达工程菌株的构建及诱导表达。结果显示:hepcidin cDNA成功插入表达载体pPICZαA,并整合到酵母基因组中;经甲醇诱导,RT-PCR检测显示hepcidin cDNA在酵母细胞中成功转录。 展开更多

关键词 大口黑鲈(Micropterus salmoides) 抗菌肽 HEPCIDIN 毕赤酵母 真核表达

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基于线粒体D-loop区探讨我国养殖大口黑鲈的分类地位和遗传变异 被引量：19

8

作者 李胜杰 白俊杰 +2 位作者 叶星 简清 宋红梅 《海洋渔业》 CSCD 2008年第4期291-296,共6页

对大口黑鲈国内养殖种群(G)和北方亚种(N)、佛罗里达亚种(F)两个野生种群共23个个体的线粒体DNA D-loop区序列进行分析,探讨国内养殖大口黑鲈(Micropterus salmoides)的分类地位和遗传变异。D-loop区序列分析结果表明,共检测到73个变异... 对大口黑鲈国内养殖种群(G)和北方亚种(N)、佛罗里达亚种(F)两个野生种群共23个个体的线粒体DNA D-loop区序列进行分析,探讨国内养殖大口黑鲈(Micropterus salmoides)的分类地位和遗传变异。D-loop区序列分析结果表明,共检测到73个变异位点,总变异率为9.0%。三群体间没有共享单倍型,群体G的5个个体含2种单倍型,群体N的11个个体含9种单倍型,群体F中每个个体均为一种单倍型。对三个群体间的遗传距离分析表明,养殖群体与北方亚种野生群体的遗传距离为0.009,与佛罗里达亚种野生群体的遗传距离为0.053,表明国内养殖的大口黑鲈在分类上属于北方亚种,分子系统进化树的进一步分析结果与其一致。群体N、F和G的核苷酸多样性指数(π)依次为0.008 2,0.013和0.000 5,单倍型多样性指数(h)分别为0.946,1.000和0.400,显示出养殖大口黑鲈群体的遗传多样性相比国外野生群体有明显下降,有必要开展大口黑鲈的遗传改良研究,提高其种质质量。 展开更多

关键词 大口黑鲈 D-LOOP 分类地位 遗传多样性

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三个不同养殖群体金鱼遗传多样性的RAPD分析 被引量：9

9

作者 牟希东 白俊杰 +3 位作者 汪学杰 叶星 胡隐昌 罗建仁 《海洋渔业》 CSCD 2007年第1期20-24,共5页

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）方法对金鱼3个不同地区养殖群体一天津塘沽（TJ）、江苏苏州（JS）及福建福州（FZ）群体各20ind的DNA多态性进行了分析。在事先优化的反应条件下，所使用的100个随机引物中，有14个引物扩增出清晰稳定的... 采用随机扩增多态性DNA（RAPD）方法对金鱼3个不同地区养殖群体一天津塘沽（TJ）、江苏苏州（JS）及福建福州（FZ）群体各20ind的DNA多态性进行了分析。在事先优化的反应条件下，所使用的100个随机引物中，有14个引物扩增出清晰稳定的片段，共计103条，大小在200～2500bp，其中多态性片段27条。金鱼总的DNA多态位点百分率为26．21％。数据分析结果显示，3个金鱼群体内遗传多样性偏低，遗传相似度为0．9519～0．9785。金鱼3个群体总的Nei基因多样性指数为0．1061，Shannon信息指数为0．1547。金鱼3个群体间平均遗传距离为0．0375，基因分化系数Gst为0．243，表明3个养殖群体间产生了一定程度的遗传分化。UPGMA法和NJ法的聚类分析显示，两者结果一致。TJ群体和JS群体优先聚类，再与FZ群体聚类。 展开更多

关键词 金鱼 遗传多样性 基因分化

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大口黑鲈选育群体遗传多样性的AFLP分析 被引量：12

10

作者 卢建峰 白俊杰 +1 位作者 李胜杰 李镕 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2010年第3期3-7,共5页

采用AFLP技术对大口黑鲈(Micropterus salmoides)F3、F4代选育群体的遗传结构进行分析,并计算2个选育群体和一个对照养殖群体的遗传多态度、遗传距离及分化系数。结果显示,8对AFLP引物共扩增到262条带,其中多态性条带有80条,每对引物检... 采用AFLP技术对大口黑鲈(Micropterus salmoides)F3、F4代选育群体的遗传结构进行分析,并计算2个选育群体和一个对照养殖群体的遗传多态度、遗传距离及分化系数。结果显示,8对AFLP引物共扩增到262条带,其中多态性条带有80条,每对引物检测到的多态性条带在5～13之间。F3、F4代选育群体和对照养殖群体的多态性位点比例分别为29.36%、29.20%、30.29%。Shannon多样性指数分别为0.2017,0.1955,0.2042。结果表明,选育群体相较于对照养殖群体多态位点比例和遗传多态度均有所下降。群体间的遗传变异平均为0.0752,由此可见,92.48%的遗传变异来自于群体内,而只有7.52%的遗传变异来自于群体间,这初步显示了大口黑鲈在遗传上的稳定性,群体尚具有一定的选育潜力,可继续进行人工选育。 展开更多

关键词 大口黑鲈(Micropterus salmoides) AFLP 选育 遗传多样性

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大口黑鲈选育效果的初步分析 被引量：18

11

作者 李胜杰 白俊杰 +4 位作者 谢骏 陈焜慈 何小燕 汪洪永 崔荫强 《水产养殖》 CAS 2009年第10期10-13,共4页

通过选择培育获得大口黑鲈群体选育子三代,对其选育效果进行初步评价。实验数据分析表明,经过三代的选育,大口黑鲈2个选育组在体长、体高和体重上均大于对照组,且差异极显著(P<0.01),选育组1和2的日增重率分别比对照组提高了25.32%和... 通过选择培育获得大口黑鲈群体选育子三代,对其选育效果进行初步评价。实验数据分析表明,经过三代的选育,大口黑鲈2个选育组在体长、体高和体重上均大于对照组,且差异极显著(P<0.01),选育组1和2的日增重率分别比对照组提高了25.32%和23.42%,平均每代的选育效应分别为8.44%和7.81%,而体重变异系数分别是26.8%和20.2%,相比对照组分别降低了9.8%和21.1%。试验结果表明,大口黑鲈的选育效果明显,F3代的生长性能有了显著性的提高,个体之间的生长速度更加趋于一致,同时,F3代仍具有较大的选育潜力,可继续对其进行选育。该研究为进一步通过选择育种培育大口黑鲈优良品种(系)奠定了基础。 展开更多

关键词 大口黑鲈 选育 生长 选育效应

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转红色荧光蛋白基因唐鱼的繁育和养殖技术 被引量：1

12

作者 樊佳佳 白俊杰 +3 位作者 姜鹏 简清 夏仕玲 叶星 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期100-101,115,共3页

转红色荧光蛋白基因唐鱼(转基因唐鱼)为2003年中国水产科学研究院珠江水产研究所自主研发的转基因观赏鱼。结合养殖转基因唐鱼的经验,对转基因唐鱼水质条件、营养需求、人工繁殖、受精卵孵化、幼体培育以及日常管理等方面作了详细介绍,... 转红色荧光蛋白基因唐鱼(转基因唐鱼)为2003年中国水产科学研究院珠江水产研究所自主研发的转基因观赏鱼。结合养殖转基因唐鱼的经验,对转基因唐鱼水质条件、营养需求、人工繁殖、受精卵孵化、幼体培育以及日常管理等方面作了详细介绍,旨在为转基因唐鱼的人工繁育和大规模推广提供基础资料。 展开更多

关键词 红色荧光蛋白 唐鱼 人工繁殖 日常管理

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大口黑鲈生长性状的微卫星DNA标记筛选 被引量：30

13

作者 樊佳佳 白俊杰 +5 位作者 李小慧 何小平 何小燕 李胜杰 叶星 吴立新 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期515-522,共8页

本研究在人工养殖的大口黑鲈（Micropterus salmoides L．）群体中对40个微卫星位点进行扩增，运用卡方检验分析微卫星位点在极端大个体组和极端小个体组中的基因型分布差异，选择差异显著的16个微卫星位点对大口黑鲈随机群体进行基因... 本研究在人工养殖的大口黑鲈（Micropterus salmoides L．）群体中对40个微卫星位点进行扩增，运用卡方检验分析微卫星位点在极端大个体组和极端小个体组中的基因型分布差异，选择差异显著的16个微卫星位点对大口黑鲈随机群体进行基因型与性状的关联分析，同时分析群体的遗传多样性。结果表明：关联分析得到7个微卫星位点（JZL60、JZL67、JZL72、JZL124、MiSaTPW76、MiSaTPW117和MiSaTPW173）与体重、体长和体高显著或极显著相关（P〈0．05或P〈0．01），同时对差异显著的位点进行不同基因型间与生长性状的多重比较，找到了与体重、体长和体高性状相关的最有利基因型为JZL60位点的AA、JZL67位点的BB、JZL72位点的AC、MiSaTPW76位点的BB和MiSaTPW117位点的BC。应用这16个微卫星位点对随机群体进行遗传多样性分析，共检测到47个等位基因，平均等位基因2．938个，每个位点检测到的等位基因数为2-5个、群体的平均观测杂合度、平均期望杂合度和平均多态信息含量分别为0．515、0．500和0．445，表明该群体遗传多样性处于中等水平。 展开更多

关键词 大口黑鲈 微卫星 生长性状 关联分析 遗传多样性

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加州鲈肌肉生长抑制素(MSTN)cDNA的克隆和序列分析 被引量：15

14

作者 李胜杰 白俊杰 +2 位作者 叶星 劳海华 简清 《海洋渔业》 CSCD 2007年第1期13-19,共7页

肌肉生长抑制素是抑制肌肉生长和发育的生长调控因子。对运用RT—PCR和RACE技术从加州鲈成鱼肌肉总RNA中扩增得到的MSTNcDNA全序列进行了序列分析。结果表明，加州鲈MSTNcDNA全长为1626bp，其开放阅读框为1134bp，共编码377个氨基酸，... 肌肉生长抑制素是抑制肌肉生长和发育的生长调控因子。对运用RT—PCR和RACE技术从加州鲈成鱼肌肉总RNA中扩增得到的MSTNcDNA全序列进行了序列分析。结果表明，加州鲈MSTNcDNA全长为1626bp，其开放阅读框为1134bp，共编码377个氨基酸，前面的22个氨基酸为信号肽，中间有四个氨基酸（RARR）为蛋白水解加工位点；该基因总共有13个半胱氨酸残基，后面9个在蛋白水解加工位点之后的c端生物活性区，与其它脊椎动物比较，它们的位置完全一致，对该基因的结构和功能非常重要。与GenBank中已知的条纹狼鲈、金鲷、斑马鱼、虹鳟、斑点叉尾鲴、人、猪、鸡、鸽MSTN的ORF相比较，核苷酸序列同源性为63％-94．4％，氨基酸同源性为61．4％-96％，特别是在C端生物活性区氨基酸同源性为88．1％-100％，高度的保守性反映了该基因受到了高度的进化限制以及功能的重要性。加州鲈MSTN基因的克隆为研究该基因打靶和鱼类肌肉发育调控机理奠定了基础。 展开更多

关键词 加州鲈 MSTN 克隆 序列分析

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大口黑鲈家系早期形态性状的相关和主成分分析 被引量：13

15

作者 李镕 白俊杰 +1 位作者 李胜杰 叶星 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2011年第3期282-288,共7页

利用17个大口黑鲈（Micropterus salmoides）家系在4月龄和6月龄的生长数据,对大口黑鲈全长、体长、头长、尾柄长、体高和尾柄高6个性状进行相关分析和主成分分析。结果表明：6个形态性状之间均呈高表型正相关,其值在0.565-0.990之间;4... 利用17个大口黑鲈（Micropterus salmoides）家系在4月龄和6月龄的生长数据,对大口黑鲈全长、体长、头长、尾柄长、体高和尾柄高6个性状进行相关分析和主成分分析。结果表明：6个形态性状之间均呈高表型正相关,其值在0.565-0.990之间;4月龄和6月龄全长对形态性状的贡献率分别为92.29%和86.40%,可作为大口黑鲈形态性状的选择指标;4月龄全长/体高和尾柄长/尾柄高对体型的贡献率分别为65.94%和34.06%,6月龄全长/体高和尾柄长/尾柄高的贡献率分别为69.08%和30.92%,这两个指标均可作为大口黑鲈体型的选择标准。另外,采用方差分析对大口黑鲈各家系的全长、绝对增长率、生长指标和体型指数进行比较,结果表明家系S07D07的生长表现为最优。 展开更多

关键词 大口黑鲈 家系 形态性状 相关分析 主成分分析

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大口黑鲈溃疡综合征病毒TaqMan-MGB探针荧光定量PCR检测方法的建立 被引量：8

16

作者 马冬梅 白俊杰 +2 位作者 邓国成 李胜杰 张莉莉 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期99-102,共4页

根据大口黑鲈溃疡综合征病毒（Largemouth bass ulcerative syndrome virus,LBUSV）的甲基转移酶（MTase）基因核苷酸序列设计引物及TaqMan-MGB探针,优化荧光定量PCR反应条件和反应体系,建立了LBUSV的TaqMan-MGB探针荧光定量PCR检测方法... 根据大口黑鲈溃疡综合征病毒（Largemouth bass ulcerative syndrome virus,LBUSV）的甲基转移酶（MTase）基因核苷酸序列设计引物及TaqMan-MGB探针,优化荧光定量PCR反应条件和反应体系,建立了LBUSV的TaqMan-MGB探针荧光定量PCR检测方法.用含有MTase基因的质粒pDNA-MT系列稀释作为标准品模板,在荧光定量PCR仪上进行PCR反应,绘制标准曲线,斜率为-3.24,R2=0.999,呈现很好的线性关系,扩增效率1.04.灵敏度检测结果表明,PCR反应24个循环时可以检测到的质粒最小浓度是102拷贝数/μL.选用107、106、105、104拷贝数/μL 4个浓度梯度质粒做模板,变异系数在1.1%-3.4%范围内,说明该方法具有良好的重复性和稳定性.利用该方法可以准确地检测出感染LBUSV的病鱼,特异性强. 展开更多

关键词 大口黑鲈溃疡综合征病毒 TAQMAN-MGB探针 定量PCR 病毒检测

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红色荧光蛋白基因在转基因唐鱼中的表达 被引量：13

17

作者 陈敏 白俊杰 +1 位作者 姜鹏 叶星 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期59-63,共5页

在成功构建斑马鱼肌球蛋白轻链2启动子转红色荧光蛋白基因唐鱼Tanichthys albonubes可遗传品系的基础上,作者采用荧光显微镜观察和用RT-PCR技术对外源基因在唐鱼体内的表达情况进行检测。结果表明:红色荧光蛋白基因在F3代唐鱼体内的表... 在成功构建斑马鱼肌球蛋白轻链2启动子转红色荧光蛋白基因唐鱼Tanichthys albonubes可遗传品系的基础上,作者采用荧光显微镜观察和用RT-PCR技术对外源基因在唐鱼体内的表达情况进行检测。结果表明:红色荧光蛋白基因在F3代唐鱼体内的表达最早出现在受精后19 d,多数个体的表达集中在25~30日龄,最晚的表达个体出现在35日龄;红色荧光蛋白的表达主要分布于肌肉、心脏、肝脏、脾、鳃、鳔、肠和性腺,在肌肉、肝脏、鳃组织中的相对表达量较其它组织高,而在表皮和鳍条中没有检测到外源基因的表达。虽然红色荧光蛋白在转基因唐鱼后代出现表达迟缓、表达特异性改变的现象,但在外源基因后代中的遗传和表达在总体上还是稳定的,有望培育出转红色荧光蛋白基因唐鱼品系。 展开更多

关键词 转基因鱼 唐鱼 红色荧光蛋白 基因表达

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加州鲈生长激素和胰岛素样生长因子I cDNA的克隆及序列分析 被引量：8

18

作者 李胜杰 白俊杰 +2 位作者 叶星 劳海华 简清 《广东海洋大学学报》 CAS 2007年第3期1-5,共5页

GH-IGF-I轴是鱼体体内一个重要的内分泌生理轴,主要调控鱼体的生长发育。用RT-PCR方法从加州鲈脑垂体和肝脏组织中分别扩增出加州鲈GH和IGF-I cDNA,克隆到pMD19 T-Vector上进行序列测定和分析。结果表明:1)加州鲈GH cDNA开放阅读框长为6... GH-IGF-I轴是鱼体体内一个重要的内分泌生理轴,主要调控鱼体的生长发育。用RT-PCR方法从加州鲈脑垂体和肝脏组织中分别扩增出加州鲈GH和IGF-I cDNA,克隆到pMD19 T-Vector上进行序列测定和分析。结果表明:1)加州鲈GH cDNA开放阅读框长为615 bp,编码204个氨基酸,其中信号肽17个氨基酸,成熟肽187个氨基酸。成熟肽中有四个保守的半胱氨酸残基(分别位于69,177,193,202),可形成两对二硫键。加州鲈GH氨基酸序列与蓝太阳鱼、斜带石斑鱼、金头鲷、虹鳟、鲤鱼、斑马鱼相比较,同源性分别为100%、97%、94%、66%、56%、53%。2)加州鲈IGF-I cDNA开放阅读框长为561bp,编码包括信号肽和B、C、A、D、E五个区域的186个氨基酸,形成成熟肽时,信号肽和E区域被切除。成熟蛋白的氨基酸序列与GenBank中已知的河鲈、三角鲂、金头鲷、舌齿鲈、斑马鱼的相比较,结果发现四个区域的保守性有差异,A区和B区保守性较高,C区和D区保守性较差。加州鲈GH和IGF-I cDNA的获得为进一步研究鱼体GH-IGF-I轴对生长发育的调控机制奠定了基础。 展开更多

关键词 加州鲈 生长激素 胰岛素样生长因子I 克隆 序列分析

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大口黑鲈抗菌肽hepcidin cDNA序列和结构分析 被引量：10

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作者 白俊杰 刘碧莲 +2 位作者 劳海华 叶星 简清 《广东海洋大学学报》 CAS 2008年第1期1-5,共5页

以大口黑鲈为材料,提取肝脏总RNA,经RT-PCR扩增出hepcidin cDNA的开放阅读框（ORF）及3′端非编码区序列,应用5′RACE方法得到大口黑鲈hepcidin cDNA5′末端。将所获得的两个片段分别克隆到T载体后进行测序,并拼接成大口黑鲈hepcidin全... 以大口黑鲈为材料,提取肝脏总RNA,经RT-PCR扩增出hepcidin cDNA的开放阅读框（ORF）及3′端非编码区序列,应用5′RACE方法得到大口黑鲈hepcidin cDNA5′末端。将所获得的两个片段分别克隆到T载体后进行测序,并拼接成大口黑鲈hepcidin全长cDNA。序列分析表明：大口黑鲈hepcidin全长cDNA为564bp,含有一个258bp的ORF,编码86个氨基酸残基,由信号肽（24个残基）、前肽（42个残基）和成熟肽（20个残基）3部分组成hepcidin前体。在前肽部分具有前肽转化酶典型的RX（K/R）R基元,成熟肽部分含有8个保守的半胱氨酸残基,可形成四个链内二硫桥,使β-折叠结构保持稳定。大口黑鲈Hepcidin与其他鱼类的同源性在29.7%-90.5%间,尤其是信号肽区域,与鳜、尼罗罗非鱼、真鲷、花鲈、黑鯛、金眼狼鲈仅有2-3个氨基酸的差别。 展开更多

关键词 大口黑鲈 抗菌肽 HEPCIDIN CDNA克隆 序列分析

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草鱼GSTR基因外显子1、外显子2的SNPs筛选及其与生长性状的关联分析 被引量：6

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作者 刘小献 白俊杰 +3 位作者 徐磊 于凌云 樊佳佳 韩林强 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期753-758,共6页

根据草鱼EST数据库中的rho型谷胱甘肽硫转移酶基因cDNA序列设计引物,扩增预计存在的SNP位点。采用PCR产物测序法和PCR-RFLP法,在珠江水系草鱼养殖群体中筛选到2个SNP位点,分别位于外显子1和外显子2上,为C-T突变,且属于同义突变,统计了... 根据草鱼EST数据库中的rho型谷胱甘肽硫转移酶基因cDNA序列设计引物,扩增预计存在的SNP位点。采用PCR产物测序法和PCR-RFLP法,在珠江水系草鱼养殖群体中筛选到2个SNP位点,分别位于外显子1和外显子2上,为C-T突变,且属于同义突变,统计了多态位点在群体中的分布:C+129T位点CC型占0.69%,TC型占8.75%,TT型占80.56%;C+192T位点CC型占25.4%,TC型占48.6%,TT型占26.1%。利用一般线性模型将SNPs与草鱼6个生长性状进行关联分析,结果表明,C+129T位点TT型个体6个生长性状均值比TC型高(P>0.05);C+192T位点TT型个体体质量均值高于TC型和CC型个体(P<0.05)。双倍型关联分析表明D1型个体的体质量均值明显高于D3型和D6型(P<0.05),因而可以考虑将GSTR基因作为影响草鱼体质量等生长性状的候选基因,应用于草鱼分子辅助育种。 展开更多

关键词 草鱼 SNPS 谷胱甘肽硫转移酶 rho型谷胱甘肽硫转移酶基因 多态性 生长

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