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基于COI基因的黄河河南-山东段鲤群体遗传结构分析
1
作者 薛向平 孙朝徽 +4 位作者 刘霞 惠筠 李学军 李秀启 司飞 《淡水渔业》 北大核心 2025年第2期43-52,共10页
为了解黄河河南-山东段黄河鲤(Cyprinus carpio haematopterus)野生和养殖群体的种质资源现状,本研究基于线粒体COI基因序列,对黄河河南-山东段的6个野生和2个养殖群体,共计204尾黄河鲤样本进行了遗传多样性分析。研究结果表明,204条长... 为了解黄河河南-山东段黄河鲤(Cyprinus carpio haematopterus)野生和养殖群体的种质资源现状,本研究基于线粒体COI基因序列,对黄河河南-山东段的6个野生和2个养殖群体,共计204尾黄河鲤样本进行了遗传多样性分析。研究结果表明,204条长度为628 bp的COI基因序列中,碱基A、T、C和G的平均含量分别为26.74%、27.41%、28.01%和17.84%,A+T的含量(54.15%)高于C+G的含量(45.85%),表现出明显的AT偏倚性。8个黄河鲤群体共检测到18个多态位点,定义了17个单倍型,Hap2、Hap4和Hap5出现频次最高,其中Hap4和Hap5为8个黄河鲤群体共有单倍型,分布于133个样本中,占总样本数的65.20%。核苷酸多样性(Pi)为0.00097~0.00254,单倍型多样性(Hd)为0.451~0.837,遗传多样性水平总体偏低,表现出高Hd低Pi。山东东阿(DE)群体的遗传多样性最高,其次为河南三门峡(SMX)群体、河南恼里(NL)群体,最低为河南养殖群体(HNYZ)群体。群体间Fst及遗传距离结果显示,黄河口(HHK)群体与其他群体间存在一定程度遗传分化,但不显著,HHK和DE群体的遗传距离最大,河南段柳园口(LYK)群体和河南养殖(HNYZ)群体的遗传距离最小;8个群体的分子方差分析(AMOVA)显示,变异主要来源于群体内,占总变异86.04%;中性检验和碱基错配分布结果分析表明,黄河鲤群体历史上可能经历过扩张或持续增长,当在环境、捕捞等外部压力减小的情况下种群可能实现快速补充,这为当前种群资源量匮乏形势下黄河鲤的种群资源恢复提供了良好信号。 展开更多
关键词 黄河鲤(Cyprinus carpio haematopterus) 线粒体COI基因 遗传多样性 群体遗传进化
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牙鲆mstn基因SNPs位点多态性与生长性状的关联分析
2
作者 李兵部 王桂兴 +9 位作者 张晓彦 刘玉峰 何忠伟 曹巍 任建功 任玉芹 张祎桐 伞利择 王玉芬 侯吉伦 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期119-128,共10页
为研究牙鲆(Paralichthys olivaceus)肌肉生长抑制基因(mstn)多态性,开发其分子辅助育种新标记,采用重测序方法对120尾牙鲆(3个双克隆杂交家系:60尾;3个雌核发育家系:60尾)的mstn基因进行单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism... 为研究牙鲆(Paralichthys olivaceus)肌肉生长抑制基因(mstn)多态性,开发其分子辅助育种新标记,采用重测序方法对120尾牙鲆(3个双克隆杂交家系:60尾;3个雌核发育家系:60尾)的mstn基因进行单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选,并对不同基因型个体的生长性状进行多重比较及SNP标记验证。结果显示,共检测到7个SNPs位点,均为颠换型突变;外显子区3个(Exonl 1:G2063A;Exonl 3:C3883T,C4009A),为同义突变;内含子区3个(Intron 1:A2444T;Intron 2:T3816C,A3832C);3'端非编码区1个(3'UTR:C4564A)。SNPs与生长性状关联分析结果表明,A3832C和C4564A标记位点与牙鲆体质量、体长、体高等生长性状显著相关(P<0.05),其中A3832C位点AA基因型和C4564A位点AC基因型在生长上表现出优势,A3832C位点CC和C4564A位点AA、CC基因型在生长上表现出劣势,其他5个SNPs位点对牙鲆生长性状影响不显著(P>0.05)。将A3832C和C4564A标记位点在牙鲆生长快速群体(F:60尾)和生长缓慢群体(S:60尾)中验证,验证结果与多重比对结果一致,表明2个SNPs位点具有较高的稳定性。综上所述,研究筛选出了牙鲆mstn基因中与生长性状显著相关的A3832C和C4564A两个标记位点,为牙鲆分子辅助育种提供了理论参考。 展开更多
关键词 牙鲆 肌肉生长抑制基因 单核苷酸多态性 生长性状
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不同光照周期对牙鲆幼鱼胃排空率的影响及其模型分析
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作者 徐岩 孙朝徽 +2 位作者 刘霞 任建功 司飞 《中国渔业质量与标准》 2024年第4期14-19,共6页
本研究探讨了4个光照周期对2种规格牙鲆(Paralichthys olivaceus)幼鱼饱食后胃肠内容物质量的变化特征,并确定了牙鲆幼鱼摄食的最佳光照周期和最佳投喂时间、最优胃排空率数学模型。结果显示,牙鲆幼鱼饱食后其瞬时胃排空率随时间先上升... 本研究探讨了4个光照周期对2种规格牙鲆(Paralichthys olivaceus)幼鱼饱食后胃肠内容物质量的变化特征,并确定了牙鲆幼鱼摄食的最佳光照周期和最佳投喂时间、最优胃排空率数学模型。结果显示,牙鲆幼鱼饱食后其瞬时胃排空率随时间先上升后趋于平缓,最后达到100%。70 d牙鲆幼鱼24L∶0D组胃含物湿重比最高,18L∶6D组次之,对照组最低;24L∶0D组胃排空速率最快,18L∶6D组次之,对照组最慢。100 d牙鲆幼鱼18L∶6D胃含物湿重比最高,12L∶12D组次之,24L∶0D组最低;18L∶6D组胃排空速率最快,24L∶0D组次之,对照组最慢。70 d和100 d牙鲆不同光照周期实验数据都能很好的拟合3种模型,但三者之间的相关系数(R^(2))存在明显差异;线性模型更适合70 d对照组、24L∶0D组和100 d 12L∶12D组;指数模型更适合70 d 12L∶12D组和18L∶6D组;平方根模型更适合100 d对照组、18L∶6D组、24L∶0D组。研究结果表明,光照周期对70 d、100 d牙鲆幼鱼摄食量产生显著影响,70 d、100 d牙鲆幼鱼光照周期应为18L∶6D,70 d在饱喂18.5 h、100 d在饱喂22.5 h后进行2次投喂。 展开更多
关键词 牙鲆 胃排空率 光照周期
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