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红鳍东方鲀两个群体的遗传结构及与经济性状的相关性分析
被引量:
14
1
作者
万玉美
王蕾
+3 位作者
谭照君
赵海涛
李恒德
孙效文
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2011年第5期9-16,共8页
本文利用21对多态性微卫星标记对河北省红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)良种场引进的日本群体和选育的秦皇岛群体进行了遗传结构分析。日本与秦皇岛两个群体的有效等位基因数分别为3.3697和2.8593,期望杂合度分别是0.6516和0.6073,多态...
本文利用21对多态性微卫星标记对河北省红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)良种场引进的日本群体和选育的秦皇岛群体进行了遗传结构分析。日本与秦皇岛两个群体的有效等位基因数分别为3.3697和2.8593,期望杂合度分别是0.6516和0.6073,多态信息含量分别是0.6009和0.5509。研究结果表明这两个群体遗传多样性较高,多态信息含量丰富,具有较大的遗传改良和育种潜力。同时,本文通过对21个微卫星座位与日本群体的体长、体重和体高三个经济性状进行最小二乘方差分析,得到6个与经济性状显著相关的微卫星标记,f161、f273与体重显著相关(P<0.05),f170、f501与体长显著相关(P<0.05),而f53、f331与体高显著相关(P<0.05)。对同一标记不同基因型间进行多重比较,找到与4种性状相关的基因型。
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关键词
红鳍东方鲀(Takifugu
rubripes)
微卫星
遗传结构
经济性状
相关性分析
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职称材料
基于牙鲆RNA-seq数据中SSR标记的信息分析
被引量:
15
2
作者
李超
侯吉伦
+4 位作者
王桂兴
张晓彦
刘永富
童爱萍
刘海金
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2015年第2期122-127,共6页
通过对牙鲆(Paralichthys olivaceus)进行转录组测序(RNA-seq),利用Micro SAtellite(MISA)软件对1~6个碱基重复、碱基数在10 bp以上的微卫星进行鉴定。结果表明,牙鲆转录组水平上,共发现42 183个SSR位点,分布在26 457条Unigene上...
通过对牙鲆(Paralichthys olivaceus)进行转录组测序(RNA-seq),利用Micro SAtellite(MISA)软件对1~6个碱基重复、碱基数在10 bp以上的微卫星进行鉴定。结果表明,牙鲆转录组水平上,共发现42 183个SSR位点,分布在26 457条Unigene上,发生频率为27.12%,平均密度为339个/Mbp。获得的SSR一共有216种重复基元,其中二核苷酸重复基元类型数量最多,共有17 570个,占所鉴定SSR总数的41.65%。同时用SPSS statistics 20.0软件对牙鲆转录组SSR的多态性进行了评估。
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关键词
牙鲆
转录组测序
SSR标记
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职称材料
题名
红鳍东方鲀两个群体的遗传结构及与经济性状的相关性分析
被引量:
14
1
作者
万玉美
王蕾
谭照君
赵海涛
李恒德
孙效文
机构
大连海洋大学生命
科学
与技术学院
中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心
中国
水产
科学研究院
黑龙江
水产
研究
所及农业部北方鱼类
生物
工程育种重点开放实验室
河北省
水产
研究
所
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2011年第5期9-16,共8页
基金
国家科技支撑计划(2006BAD13B09)
文摘
本文利用21对多态性微卫星标记对河北省红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)良种场引进的日本群体和选育的秦皇岛群体进行了遗传结构分析。日本与秦皇岛两个群体的有效等位基因数分别为3.3697和2.8593,期望杂合度分别是0.6516和0.6073,多态信息含量分别是0.6009和0.5509。研究结果表明这两个群体遗传多样性较高,多态信息含量丰富,具有较大的遗传改良和育种潜力。同时,本文通过对21个微卫星座位与日本群体的体长、体重和体高三个经济性状进行最小二乘方差分析,得到6个与经济性状显著相关的微卫星标记,f161、f273与体重显著相关(P<0.05),f170、f501与体长显著相关(P<0.05),而f53、f331与体高显著相关(P<0.05)。对同一标记不同基因型间进行多重比较,找到与4种性状相关的基因型。
关键词
红鳍东方鲀(Takifugu
rubripes)
微卫星
遗传结构
经济性状
相关性分析
Keywords
Takifugu rubripes
microsatellite
genetic structure
economic traits
correlation
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
基于牙鲆RNA-seq数据中SSR标记的信息分析
被引量:
15
2
作者
李超
侯吉伦
王桂兴
张晓彦
刘永富
童爱萍
刘海金
机构
上海海洋大学
水产
与生命学院
中国
水产
科学研究院
北戴河
中心
实验站
中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心
出处
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2015年第2期122-127,共6页
基金
国家863计划项目(2012AA10A408)
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-50-G02
CARS-50-Z03)
文摘
通过对牙鲆(Paralichthys olivaceus)进行转录组测序(RNA-seq),利用Micro SAtellite(MISA)软件对1~6个碱基重复、碱基数在10 bp以上的微卫星进行鉴定。结果表明,牙鲆转录组水平上,共发现42 183个SSR位点,分布在26 457条Unigene上,发生频率为27.12%,平均密度为339个/Mbp。获得的SSR一共有216种重复基元,其中二核苷酸重复基元类型数量最多,共有17 570个,占所鉴定SSR总数的41.65%。同时用SPSS statistics 20.0软件对牙鲆转录组SSR的多态性进行了评估。
关键词
牙鲆
转录组测序
SSR标记
Keywords
Paralichthys olivaceus
RNA-seq
SSR marker
分类号
S961.6 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
红鳍东方鲀两个群体的遗传结构及与经济性状的相关性分析
万玉美
王蕾
谭照君
赵海涛
李恒德
孙效文
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2011
14
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于牙鲆RNA-seq数据中SSR标记的信息分析
李超
侯吉伦
王桂兴
张晓彦
刘永富
童爱萍
刘海金
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2015
15
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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引证文献
统计分析
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