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斑节对虾2种高血糖激素家族基因的基因组序列分析和表达研究
被引量:
3
1
作者
吴勉之
杨丽诗
+4 位作者
周发林
黄建华
姜松
杨其彬
江世贵
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期27-36,共10页
在斑节对虾(Penaeus monodon)体内新发现了2种高血糖激素(crustacean hyperglycemic hormone,CHH)家族基因Pm CHH和Pm HHLPP。基因组分析结果显示,其均具有CHH-Ⅰ型基因基本的"信号肽-CPRPKR/ER/RR-成熟肽"结构,且与已报道的C...
在斑节对虾(Penaeus monodon)体内新发现了2种高血糖激素(crustacean hyperglycemic hormone,CHH)家族基因Pm CHH和Pm HHLPP。基因组分析结果显示,其均具有CHH-Ⅰ型基因基本的"信号肽-CPRPKR/ER/RR-成熟肽"结构,且与已报道的CHHs基因的基因组结构相似;聚类分析结果显示,尽管Pm CHH和Pm HHLPP与多个CHHs基因序列相似性超过50%(最高达99%),但与其聚为一支的基因均不是CHH-Ⅰ型基因;生物信息学分析结果显示,Pm CHH和Pm HHLPP的转录起始位点"A"及其核心启动子区域分别位于开放阅读框(ORF)上游的99 bp和190 bp,同时在预测其空间结构后发现,两者的三维结构中均含有4个α螺旋构型;组织表达结果显示,2个基因均在肠中有较高的表达量,而Pm CHH在鳃、Pm HHLPP在眼柄中表达量也较高,但在肝胰腺和肌肉中表达量较低;幼体发育阶段表达结果显示,2个基因在无节幼体Ⅲ~Ⅳ期、溞状幼体Ⅰ期和糠虾幼体期表达量均有较大波动,与代谢强度呈弱相关关系。根据其一级结构的特征和相关表达情况,可推测Pm CHH和Pm HHLPP均为CHHs家族基因。
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关键词
斑节对虾
甲壳动物高血糖激素
基因组结构
表达分析
幼体发育
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题名
斑节对虾2种高血糖激素家族基因的基因组序列分析和表达研究
被引量:
3
1
作者
吴勉之
杨丽诗
周发林
黄建华
姜松
杨其彬
江世贵
机构
中国
水产
科学研究院
南海
水产
研究所
农业部
南海
渔业资源开发利用重点实验室
上海海洋大学
水产
与生命学院
中国水产科学研究院南海水产研究所深圳试验基地农业部斑节对虾遗传育种中心
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期27-36,共10页
基金
现代农业(虾蟹)产业技术体系建设专项(CARS-48)
广东省海洋渔业科技攻关与研发项目(A201701A01)
+1 种基金
广东省科技创新青年拔尖人才项目(2015TQ01N583)
深圳市战略性新兴产业发展专项(201711161366)
文摘
在斑节对虾(Penaeus monodon)体内新发现了2种高血糖激素(crustacean hyperglycemic hormone,CHH)家族基因Pm CHH和Pm HHLPP。基因组分析结果显示,其均具有CHH-Ⅰ型基因基本的"信号肽-CPRPKR/ER/RR-成熟肽"结构,且与已报道的CHHs基因的基因组结构相似;聚类分析结果显示,尽管Pm CHH和Pm HHLPP与多个CHHs基因序列相似性超过50%(最高达99%),但与其聚为一支的基因均不是CHH-Ⅰ型基因;生物信息学分析结果显示,Pm CHH和Pm HHLPP的转录起始位点"A"及其核心启动子区域分别位于开放阅读框(ORF)上游的99 bp和190 bp,同时在预测其空间结构后发现,两者的三维结构中均含有4个α螺旋构型;组织表达结果显示,2个基因均在肠中有较高的表达量,而Pm CHH在鳃、Pm HHLPP在眼柄中表达量也较高,但在肝胰腺和肌肉中表达量较低;幼体发育阶段表达结果显示,2个基因在无节幼体Ⅲ~Ⅳ期、溞状幼体Ⅰ期和糠虾幼体期表达量均有较大波动,与代谢强度呈弱相关关系。根据其一级结构的特征和相关表达情况,可推测Pm CHH和Pm HHLPP均为CHHs家族基因。
关键词
斑节对虾
甲壳动物高血糖激素
基因组结构
表达分析
幼体发育
Keywords
Penaeus monodon
Crustacean hyperglycemic hormone
genome
expression analysis
larval development
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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作者
出处
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被引量
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1
斑节对虾2种高血糖激素家族基因的基因组序列分析和表达研究
吴勉之
杨丽诗
周发林
黄建华
姜松
杨其彬
江世贵
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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