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海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析
被引量:
12
1
作者
王元
周俊芳
+4 位作者
韦信贤
马荣荣
赵姝
李新苍
房文红
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期198-203,共6页
运用Miseq高通量测序技术,分析凡纳滨对虾虾苗及其在海水和淡水2种养殖条件下生长到体长9~10 cm时的肠道和鳃的菌群结构。结果显示:虾苗、肠道和鳃样品在门水平上菌群均以厚壁菌门和变形菌门为主,但丰度差异较大;在属水平上,虾苗菌群以...
运用Miseq高通量测序技术,分析凡纳滨对虾虾苗及其在海水和淡水2种养殖条件下生长到体长9~10 cm时的肠道和鳃的菌群结构。结果显示:虾苗、肠道和鳃样品在门水平上菌群均以厚壁菌门和变形菌门为主,但丰度差异较大;在属水平上,虾苗菌群以乳球菌属(36.1%)、未成功分属的γ–变形菌纲的菌株(25.5%)、芽孢杆菌属(13.5%)、Solibacillus(7.9%)、假单胞菌属(5.0%)和节杆菌属(2.5%)为主,鳃的菌群以乳球菌属、芽孢杆菌属、Solibacillus、假单胞菌属和节杆菌属为主,肠道菌群在海水养殖中的以发光杆菌属(22.9%)、弧菌属(18.2%)、乳球菌属(13.3%)、纤维弧菌属(8.0%)、希瓦氏菌属(5.5%)和芽孢杆菌属(5.4%)为主,而在淡水养殖中的以希瓦氏菌属(57.4%)、乳球菌属(18.8%)和芽孢杆菌属(6.3%)为主,弧菌丰度小于0.1%。养殖条件对凡纳滨对虾鳃中菌群结构影响较小,但对肠道菌群结构影响较大。
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关键词
凡纳滨对虾
肠道
鳃
海水养殖
淡水养殖
菌群结构
高通量测序
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职称材料
题名
海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析
被引量:
12
1
作者
王元
周俊芳
韦信贤
马荣荣
赵姝
李新苍
房文红
机构
中国水产科学研究院东海水产研究所/农业部东海渔业资源开发利用重点实验室
广西
水产
科学研究院
上海海洋大学
水产
与生命学院
出处
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期198-203,共6页
基金
上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2014)第3–4号)
上海市现代虾类产业技术体系专项(沪农科产字[2014]第5号)
文摘
运用Miseq高通量测序技术,分析凡纳滨对虾虾苗及其在海水和淡水2种养殖条件下生长到体长9~10 cm时的肠道和鳃的菌群结构。结果显示:虾苗、肠道和鳃样品在门水平上菌群均以厚壁菌门和变形菌门为主,但丰度差异较大;在属水平上,虾苗菌群以乳球菌属(36.1%)、未成功分属的γ–变形菌纲的菌株(25.5%)、芽孢杆菌属(13.5%)、Solibacillus(7.9%)、假单胞菌属(5.0%)和节杆菌属(2.5%)为主,鳃的菌群以乳球菌属、芽孢杆菌属、Solibacillus、假单胞菌属和节杆菌属为主,肠道菌群在海水养殖中的以发光杆菌属(22.9%)、弧菌属(18.2%)、乳球菌属(13.3%)、纤维弧菌属(8.0%)、希瓦氏菌属(5.5%)和芽孢杆菌属(5.4%)为主,而在淡水养殖中的以希瓦氏菌属(57.4%)、乳球菌属(18.8%)和芽孢杆菌属(6.3%)为主,弧菌丰度小于0.1%。养殖条件对凡纳滨对虾鳃中菌群结构影响较小,但对肠道菌群结构影响较大。
关键词
凡纳滨对虾
肠道
鳃
海水养殖
淡水养殖
菌群结构
高通量测序
Keywords
Litopenaeus vannamei
intestine
gill
mariculture
freshwater aquaculture
microbial community structure
high–throughput sequencing
分类号
S917.1 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析
王元
周俊芳
韦信贤
马荣荣
赵姝
李新苍
房文红
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018
12
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