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镜鲤体长性状的QTL定位分析
被引量：
9
1
作者
张天奇
张晓峰
+5 位作者
谭照君
曹柱
王宣朋
李文升
储志远
孙效文
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第11期1245-1250,共6页
以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交F2群体的68个个体为材料,利用553个分子标记（217个SSR和336个SNP标记）对其进行基因型检测,运用JoinMap4.0软件包对遗传连锁图谱进行构建。利用MapQTL5.0区间作图法（Interval mapping）进行QTL检...
以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交F2群体的68个个体为材料,利用553个分子标记（217个SSR和336个SNP标记）对其进行基因型检测,运用JoinMap4.0软件包对遗传连锁图谱进行构建。利用MapQTL5.0区间作图法（Interval mapping）进行QTL检测,通过置换实验（1 000次重复）确定连锁群显著性水平阈值。在对体长的区间定位中共检测到12个与体长性状相关的QTLs区间,分布在BL-1-1（SNP0137-SNP1481）、BL-4-1（SNP0092-HLJ797）、BL-5-1（SNP1268-HLJ423）、BL-7-1（HLJ870-SNP0702）、BL-12-1（SNP0922-HLJ639）、BL-16-1（HLJE351-SNP0674）、BL-25-1（SNP0394-SNP0862）、BL-35-1（HLJ668-SNP0832）、BL-43-1（SNP0389-SNP1425）、BL-47-1（HLJ057-HLJ1113）、BL-47-2（HLJ1439-HLJ1418）等11个连锁群上,解释表型变异范围是13.8%~64.9%,其中贡献率大于20%的主效QTLs有8个,是体长性状的主效QTLs区间。
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关键词
镜鲤
体长
数量性状定位
分子辅助育种
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职称材料
西伯利亚鲟（Acipenser baeri）养殖群体遗传结构的AFLP分析
2
作者
刘翠
李文升
+1 位作者
鲁翠云
孙效文
《水产学杂志》
CAS
2011年第1期8-13,共6页
本研究构建了西伯利亚鲟（Acipenser baeri）扩增片段长度多态性（AFLP）分析体系,分析了DNA提取、双酶切反应、连接反应、预扩增反应、选择性扩增反应和银染等步骤。用7对引物对24尾西伯利亚鲟进行了AFLP分析,每对引物扩增的位点数在24...
本研究构建了西伯利亚鲟（Acipenser baeri）扩增片段长度多态性（AFLP）分析体系,分析了DNA提取、双酶切反应、连接反应、预扩增反应、选择性扩增反应和银染等步骤。用7对引物对24尾西伯利亚鲟进行了AFLP分析,每对引物扩增的位点数在24～39之间,共扩增出了234个位点,多态性位点为116个,多态性比例为48.83%,平均Nei氏基因多样性指数H为0.4297,平均Shannon氏指数I为0.1233,个体间平均遗传距离为0.1872,表明西伯利亚鲟养殖群体的遗传多样性程度比较低,同时还构建了西伯利亚鲟的聚类图。
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关键词
西伯利亚鲟
AFLP
反应体系
遗传多样性
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职称材料
题名
镜鲤体长性状的QTL定位分析
被引量：
9
1
作者
张天奇
张晓峰
谭照君
曹柱
王宣朋
李文升
储志远
孙效文
机构
大连海洋大学生命
科学
与技术学院
中国水产科学研究所黑龙江水产研究及农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室
上海海洋大学
水产
与生命技术学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第11期1245-1250,共6页
基金
国家重大基础研究发展规划(973)项目(编号:2010CB126305)资助
文摘
以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交F2群体的68个个体为材料,利用553个分子标记（217个SSR和336个SNP标记）对其进行基因型检测,运用JoinMap4.0软件包对遗传连锁图谱进行构建。利用MapQTL5.0区间作图法（Interval mapping）进行QTL检测,通过置换实验（1 000次重复）确定连锁群显著性水平阈值。在对体长的区间定位中共检测到12个与体长性状相关的QTLs区间,分布在BL-1-1（SNP0137-SNP1481）、BL-4-1（SNP0092-HLJ797）、BL-5-1（SNP1268-HLJ423）、BL-7-1（HLJ870-SNP0702）、BL-12-1（SNP0922-HLJ639）、BL-16-1（HLJE351-SNP0674）、BL-25-1（SNP0394-SNP0862）、BL-35-1（HLJ668-SNP0832）、BL-43-1（SNP0389-SNP1425）、BL-47-1（HLJ057-HLJ1113）、BL-47-2（HLJ1439-HLJ1418）等11个连锁群上,解释表型变异范围是13.8%~64.9%,其中贡献率大于20%的主效QTLs有8个,是体长性状的主效QTLs区间。
关键词
镜鲤
体长
数量性状定位
分子辅助育种
Keywords
mirror carp（Cyprinus carpio L.）
body length
quantitative trait locus mapping
molecular maker-assisted selection
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
西伯利亚鲟（Acipenser baeri）养殖群体遗传结构的AFLP分析
2
作者
刘翠
李文升
鲁翠云
孙效文
机构
哈尔滨师范大学生命
科学
与技术学院
中国水产科学研究所黑龙江水产研究及农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室
上海海洋大学
出处
《水产学杂志》
CAS
2011年第1期8-13,共6页
基金
公益性行业（农业）科研专项课题“牙鲆性别控制与史氏鲟、黄颡鱼性别标记开发”（200903046-07）
文摘
本研究构建了西伯利亚鲟（Acipenser baeri）扩增片段长度多态性（AFLP）分析体系,分析了DNA提取、双酶切反应、连接反应、预扩增反应、选择性扩增反应和银染等步骤。用7对引物对24尾西伯利亚鲟进行了AFLP分析,每对引物扩增的位点数在24～39之间,共扩增出了234个位点,多态性位点为116个,多态性比例为48.83%,平均Nei氏基因多样性指数H为0.4297,平均Shannon氏指数I为0.1233,个体间平均遗传距离为0.1872,表明西伯利亚鲟养殖群体的遗传多样性程度比较低,同时还构建了西伯利亚鲟的聚类图。
关键词
西伯利亚鲟
AFLP
反应体系
遗传多样性
Keywords
Acipenser baeri
AFLP
reaction system
genetic diversity
分类号
Q523 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
镜鲤体长性状的QTL定位分析
张天奇
张晓峰
谭照君
曹柱
王宣朋
李文升
储志远
孙效文
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
西伯利亚鲟（Acipenser baeri）养殖群体遗传结构的AFLP分析
刘翠
李文升
鲁翠云
孙效文
《水产学杂志》
CAS
2011
0
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职称材料
已选择
0
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引证文献
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