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宏基因组测序技术在骆驼布鲁氏菌病诊断上的一例应用
1
作者
张凯慧
胡涛
+12 位作者
张全文
焉鑫
乔煜涵
康德玛
胡薇
苏晓玲
东德布
张培培
李梦迪
王建宏
阿木古楞
马鹏程
孙明军
《中国动物检疫》
2025年第10期103-108,114,共7页
为验证iELISA方法对骆驼大缸奶样品中布鲁氏菌病(简称“布病”)抗体检测结果的可靠性,随机选择来自内蒙古阿拉善右旗的7个布病抗体呈阳性的骆驼大缸奶样品,从中提取核酸,然后进行宏基因组测序,并通过自建的流程和minimap2、kraken2等软...
为验证iELISA方法对骆驼大缸奶样品中布鲁氏菌病(简称“布病”)抗体检测结果的可靠性,随机选择来自内蒙古阿拉善右旗的7个布病抗体呈阳性的骆驼大缸奶样品,从中提取核酸,然后进行宏基因组测序,并通过自建的流程和minimap2、kraken2等软件详细分析测序数据,以获得骆驼是否感染布鲁氏菌的直接证据。结果显示:7个驼奶样品中均存在布鲁氏菌属特异性DNA序列,数量为11~35。通过评估比对成功的DNA序列数量、编辑距离分布,获得了最优的布鲁氏菌种。其中,样品S3、S11和S35的DNA序列与牛种布鲁氏菌的基因组差异度最小,样品S16、S24和S31则与羊种布鲁氏菌的基因组更接近,而样品S33虽然含有布鲁氏菌核酸片段,却无法得到明确的布鲁氏菌种分类结果。结果表明,抗体检测呈阳性的骆驼确实感染了布鲁氏菌,且感染源具有多样性。宏基因组测序分析可以弥补常规qPCR和病原分离鉴定敏感性不高的弊端,在基于骆驼大缸奶的布病抗体检测技术的验证中也起到了重要作用。
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关键词
骆驼
奶
布鲁氏菌
宏基因组测序
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题名
宏基因组测序技术在骆驼布鲁氏菌病诊断上的一例应用
1
作者
张凯慧
胡涛
张全文
焉鑫
乔煜涵
康德玛
胡薇
苏晓玲
东德布
张培培
李梦迪
王建宏
阿木古楞
马鹏程
孙明军
机构
中国
动物卫生与流行病学中心
内蒙古大学生命科学学院
阿拉善右旗动物疫病预防控制中心
中国检验认证集团山东公司
出处
《中国动物检疫》
2025年第10期103-108,114,共7页
基金
阿拉善双峰驼布鲁氏菌病监测技术研究项目(AMKJ2024-05)。
文摘
为验证iELISA方法对骆驼大缸奶样品中布鲁氏菌病(简称“布病”)抗体检测结果的可靠性,随机选择来自内蒙古阿拉善右旗的7个布病抗体呈阳性的骆驼大缸奶样品,从中提取核酸,然后进行宏基因组测序,并通过自建的流程和minimap2、kraken2等软件详细分析测序数据,以获得骆驼是否感染布鲁氏菌的直接证据。结果显示:7个驼奶样品中均存在布鲁氏菌属特异性DNA序列,数量为11~35。通过评估比对成功的DNA序列数量、编辑距离分布,获得了最优的布鲁氏菌种。其中,样品S3、S11和S35的DNA序列与牛种布鲁氏菌的基因组差异度最小,样品S16、S24和S31则与羊种布鲁氏菌的基因组更接近,而样品S33虽然含有布鲁氏菌核酸片段,却无法得到明确的布鲁氏菌种分类结果。结果表明,抗体检测呈阳性的骆驼确实感染了布鲁氏菌,且感染源具有多样性。宏基因组测序分析可以弥补常规qPCR和病原分离鉴定敏感性不高的弊端,在基于骆驼大缸奶的布病抗体检测技术的验证中也起到了重要作用。
关键词
骆驼
奶
布鲁氏菌
宏基因组测序
Keywords
camel
milk
Brucella
metagenomic sequencing
分类号
S851 [农业科学—预防兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
宏基因组测序技术在骆驼布鲁氏菌病诊断上的一例应用
张凯慧
胡涛
张全文
焉鑫
乔煜涵
康德玛
胡薇
苏晓玲
东德布
张培培
李梦迪
王建宏
阿木古楞
马鹏程
孙明军
《中国动物检疫》
2025
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