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禾本科psbA-trnH基因的序列分析及其在斑点野生稻鉴定中的应用
被引量：
6
1
作者
许瑾
徐涛
+2 位作者
肖正康
朱水芳
张万霞
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期85-92,共8页
通过对稻属(Oryza L.)及其近缘种等禾本科(Gramineae)植物叶绿体psbA-trnH基因进行扩增和测序,分析其系统进化关系及序列差异,并设计鉴定斑点野生稻(O.punctata)的特异分子标记。序列分析的结果表明,栽培稻材料间psbA-trnH基因序列没有...
通过对稻属(Oryza L.)及其近缘种等禾本科(Gramineae)植物叶绿体psbA-trnH基因进行扩增和测序,分析其系统进化关系及序列差异,并设计鉴定斑点野生稻(O.punctata)的特异分子标记。序列分析的结果表明,栽培稻材料间psbA-trnH基因序列没有或很少存在碱基差异,野生稻相对变异丰富,其中靠近3′端下游序列碱基变异较为丰富,5′端相对保守。根据斑点野生稻psbA-trnH基因序列的特异位点设计的引物,扩增的目的片段ptBD118长118bp,退火温度在62℃时特异性最佳。在条码基因差异位点分析的基础上,开发的特异分子标记用于物种的快速鉴定,为珍贵物种的口岸鉴定提供了检测方法。
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关键词
psbA-trnH基因
斑点野生稻
分子标记
物种鉴定
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职称材料
黄瓜花叶病毒M株系全序列测定
被引量：
3
2
作者
谈珺
陈红运
+1 位作者
高必达
朱水芳
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007年第17期5105-5106,5170,共3页
在定向克隆和序列分析试验中,白肋烟(Nicotiana tabacumcv.white Burley)为繁殖寄主,根据美国NCBI核酸数据库中CMV基因组RNA1,RNA2和RNA3基因序列,共设计3对特异性引物。对3对特异性引物进行PCR扩增,分别得到3.3 kb的RNA1、3.0 kb的RNA2...
在定向克隆和序列分析试验中,白肋烟(Nicotiana tabacumcv.white Burley)为繁殖寄主,根据美国NCBI核酸数据库中CMV基因组RNA1,RNA2和RNA3基因序列,共设计3对特异性引物。对3对特异性引物进行PCR扩增,分别得到3.3 kb的RNA1、3.0 kb的RNA2和2.2 kb的RNA3 PCR扩增产物。M-CMV基因组cDNA经过序列测定,3条链的长度分别为:M-CMVRNA1全长3 361 bp,分子量为111 kDa的1a蛋白;RNA2全长3 037 bp,含有两个分子量为96.7 kDa的2a蛋白和分子量为13.1 kDa的2b蛋白;RNA3全长2 215 bp,分别编码分子量为30.5 kDa的3a蛋白和分子量为24 kDa的外壳蛋白(cp)。这是继国内CMV-CD、CMV-CA全序列报道之后的首次M-CMV全序列分析,为以后采用基因突变、置换方法观察寄主的症状变化做了前期工作。
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关键词
黄瓜花叶病毒M株系
核酸
全序列
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职称材料
题名
禾本科psbA-trnH基因的序列分析及其在斑点野生稻鉴定中的应用
被引量：
6
1
作者
许瑾
徐涛
肖正康
朱水芳
张万霞
机构
中国检验检疫科学研究院动植物检疫所
湖南农业大学生物安全科技学院
中国
农业
科学
院作物
科学
研究
所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期85-92,共8页
基金
国家质检总局科技计划项目(2005IK053)
质检公益性行业科研专项(2007GYJ020)
文摘
通过对稻属(Oryza L.)及其近缘种等禾本科(Gramineae)植物叶绿体psbA-trnH基因进行扩增和测序,分析其系统进化关系及序列差异,并设计鉴定斑点野生稻(O.punctata)的特异分子标记。序列分析的结果表明,栽培稻材料间psbA-trnH基因序列没有或很少存在碱基差异,野生稻相对变异丰富,其中靠近3′端下游序列碱基变异较为丰富,5′端相对保守。根据斑点野生稻psbA-trnH基因序列的特异位点设计的引物,扩增的目的片段ptBD118长118bp,退火温度在62℃时特异性最佳。在条码基因差异位点分析的基础上,开发的特异分子标记用于物种的快速鉴定,为珍贵物种的口岸鉴定提供了检测方法。
关键词
psbA-trnH基因
斑点野生稻
分子标记
物种鉴定
Keywords
psbA-trnH gene Oryza punctata Molecular marker Species identification
分类号
S511.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
黄瓜花叶病毒M株系全序列测定
被引量：
3
2
作者
谈珺
陈红运
高必达
朱水芳
机构
湖南农业大学生物安全科技学院
中国检验检疫科学研究院动植物检疫所
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007年第17期5105-5106,5170,共3页
文摘
在定向克隆和序列分析试验中,白肋烟(Nicotiana tabacumcv.white Burley)为繁殖寄主,根据美国NCBI核酸数据库中CMV基因组RNA1,RNA2和RNA3基因序列,共设计3对特异性引物。对3对特异性引物进行PCR扩增,分别得到3.3 kb的RNA1、3.0 kb的RNA2和2.2 kb的RNA3 PCR扩增产物。M-CMV基因组cDNA经过序列测定,3条链的长度分别为:M-CMVRNA1全长3 361 bp,分子量为111 kDa的1a蛋白;RNA2全长3 037 bp,含有两个分子量为96.7 kDa的2a蛋白和分子量为13.1 kDa的2b蛋白;RNA3全长2 215 bp,分别编码分子量为30.5 kDa的3a蛋白和分子量为24 kDa的外壳蛋白(cp)。这是继国内CMV-CD、CMV-CA全序列报道之后的首次M-CMV全序列分析,为以后采用基因突变、置换方法观察寄主的症状变化做了前期工作。
关键词
黄瓜花叶病毒M株系
核酸
全序列
Keywords
Cucumber mosaic virus M strain
Nucleic acid
Full sequence analysis
分类号
S436.421.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
禾本科psbA-trnH基因的序列分析及其在斑点野生稻鉴定中的应用
许瑾
徐涛
肖正康
朱水芳
张万霞
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
黄瓜花叶病毒M株系全序列测定
谈珺
陈红运
高必达
朱水芳
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007
3
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