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单细胞转录组测序和染色质可及性测序技术概述及应用
1
作者
王飞
王军辉
+6 位作者
张耀丹
姚程程
王少丽
夏永秀
李艺柔
张蔷
李少锋
《温带林业研究》
2024年第4期85-88,共4页
细胞异质性是生物组织的普遍特征,单细胞测序技术兴起能解决传统测序不能解决的细胞异质性带来的基因组、转录组、蛋白质组水平差异。非编码水平的染色质动态调控对基因转录调节具有重要作用,染色质可及性测序技术为科研人员提供了全基...
细胞异质性是生物组织的普遍特征,单细胞测序技术兴起能解决传统测序不能解决的细胞异质性带来的基因组、转录组、蛋白质组水平差异。非编码水平的染色质动态调控对基因转录调节具有重要作用,染色质可及性测序技术为科研人员提供了全基因组范围的染色质开放区域信息。单细胞转录组测序(scRNA-seq)、染色质可及性测序(scATAC-seq)技术首先被应用在动物、人体组织研究,近五年scRNA-seq、scATAC-seq技术开始应用在植物研究中。单细胞水平的高通量测序技术为分析植物细胞异质性图谱提供有力手段。染色质可及性测序是分析染色质开放、关闭区域的重要手段。近年来,上述技术在植物中的应用文献报道呈明显的上升趋势。本文深入探讨了这些新兴技术的原理和方法,以及它们的应用和对植物科学研究的贡献,并对单细胞转录组测序(scRNA-seq)、染色质可及性测序(scATAC-seq)及其联合运用在阐明植物细胞异质性和基因调控复杂机制方面进行全面概述。
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关键词
单细胞转录组测序
单细胞染色质可及性测序
细胞异质性
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职称材料
题名
单细胞转录组测序和染色质可及性测序技术概述及应用
1
作者
王飞
王军辉
张耀丹
姚程程
王少丽
夏永秀
李艺柔
张蔷
李少锋
机构
林木
遗传育种全国
重点
实验室
中国林业科学研究院
华北
林业
实验
中心北京九龙山暖温带
国家
森林长期科研基地
中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局林木培育重点实验室国家林木种质资源平台
林木
遗传育种全国
重点
实验室
中国林业科学研究院
清华大学生命
科学
学院生物信息学教育部
重点
实验室
出处
《温带林业研究》
2024年第4期85-88,共4页
基金
中国林业科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(CAFYBB2020QD001)
国家自然科学基金项目(31770705、31400570)
农业生物育种重大专项“西北地区抗虫高产杨树新品种设计与培育”(2022ZD0401503)。
文摘
细胞异质性是生物组织的普遍特征,单细胞测序技术兴起能解决传统测序不能解决的细胞异质性带来的基因组、转录组、蛋白质组水平差异。非编码水平的染色质动态调控对基因转录调节具有重要作用,染色质可及性测序技术为科研人员提供了全基因组范围的染色质开放区域信息。单细胞转录组测序(scRNA-seq)、染色质可及性测序(scATAC-seq)技术首先被应用在动物、人体组织研究,近五年scRNA-seq、scATAC-seq技术开始应用在植物研究中。单细胞水平的高通量测序技术为分析植物细胞异质性图谱提供有力手段。染色质可及性测序是分析染色质开放、关闭区域的重要手段。近年来,上述技术在植物中的应用文献报道呈明显的上升趋势。本文深入探讨了这些新兴技术的原理和方法,以及它们的应用和对植物科学研究的贡献,并对单细胞转录组测序(scRNA-seq)、染色质可及性测序(scATAC-seq)及其联合运用在阐明植物细胞异质性和基因调控复杂机制方面进行全面概述。
关键词
单细胞转录组测序
单细胞染色质可及性测序
细胞异质性
Keywords
single-cell RNA sequencing
assay for transposase-accessible chromatin using sequencing
cellular heterogeneity
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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1
单细胞转录组测序和染色质可及性测序技术概述及应用
王飞
王军辉
张耀丹
姚程程
王少丽
夏永秀
李艺柔
张蔷
李少锋
《温带林业研究》
2024
0
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