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55株芽孢杆菌16S rRNA基因序列测定与系统发育学分析
被引量：
9
1
作者
程池
刘光全
+1 位作者
李金霞
姚粟
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期20-24,共5页
采用16S rRNA基因序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CCIC)保藏的55株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)进行复核鉴定。菌株经纯化培养,以改良CTAB法提取总DNA,采用细菌16S rRNA通用引物、TD-PCR方法(touchdown-PCR)进行16S r...
采用16S rRNA基因序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CCIC)保藏的55株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)进行复核鉴定。菌株经纯化培养,以改良CTAB法提取总DNA,采用细菌16S rRNA通用引物、TD-PCR方法(touchdown-PCR)进行16S rRNA基因序列扩增,PCR产物纯化后直接进行序列测定,序列经人工校对后用Clustal X进行比对分析,最后用MEGA3.1软件构建系统发育树。系统发育分析结果表明:55株枯草芽孢杆菌中有52株菌种与原鉴定结果一致,有3株菌种与原鉴定结果存在差异,其中2株鉴定结果为巨大芽孢杆菌(B.megaterium),另1株鉴定结果为地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)。
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关键词
枯草芽孢杆菌
16S
RRNA基因
TD-PCR
序列分析
系统发育树
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职称材料
题名
55株芽孢杆菌16S rRNA基因序列测定与系统发育学分析
被引量：
9
1
作者
程池
刘光全
李金霞
姚粟
机构
中国工业微生物菌种保藏管理中心中国食品发酵工业研究院
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期20-24,共5页
基金
国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA21204)
文摘
采用16S rRNA基因序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CCIC)保藏的55株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)进行复核鉴定。菌株经纯化培养,以改良CTAB法提取总DNA,采用细菌16S rRNA通用引物、TD-PCR方法(touchdown-PCR)进行16S rRNA基因序列扩增,PCR产物纯化后直接进行序列测定,序列经人工校对后用Clustal X进行比对分析,最后用MEGA3.1软件构建系统发育树。系统发育分析结果表明:55株枯草芽孢杆菌中有52株菌种与原鉴定结果一致,有3株菌种与原鉴定结果存在差异,其中2株鉴定结果为巨大芽孢杆菌(B.megaterium),另1株鉴定结果为地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)。
关键词
枯草芽孢杆菌
16S
RRNA基因
TD-PCR
序列分析
系统发育树
Keywords
Bacillus subtilis, 16S rRNA gene, TD-PCR, Gene sequence analysis, Phylegenetic tree
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
55株芽孢杆菌16S rRNA基因序列测定与系统发育学分析
程池
刘光全
李金霞
姚粟
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2006
9
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