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与Graves’Disease发病机制相关的基因研究
被引量:
2
1
作者
赵得发
滕卫平
滕晓春
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2020年第8期935-941,共7页
背景Graves’Disease(GD)是一种常见的自身免疫性疾病,但其发病机制尚不明确。目的通过对公共基因芯片数据的分析,找出与GD发病可能相关的基因。方法在GEO数据库和ArrayExpress数据库中检索“Graves’Disease”,得到GSE71956和E-MEXP-26...
背景Graves’Disease(GD)是一种常见的自身免疫性疾病,但其发病机制尚不明确。目的通过对公共基因芯片数据的分析,找出与GD发病可能相关的基因。方法在GEO数据库和ArrayExpress数据库中检索“Graves’Disease”,得到GSE71956和E-MEXP-2612(截至2019-04-02)。利用R语言的“Limma”包对基因芯片的原始数据进行标准化处理并找出差异基因。差异基因共包括对照CD4细胞与GD患者CD4细胞的对比(C-GD CD4)、对照CD8细胞与GD患者CD8细胞的对比(C-GD CD8)、对照者甲状腺组织与短病程GD患者甲状腺组织的对比(C-S)、对照者甲状腺组织与长病程GD患者甲状腺组织的对比(C-L)、短病程GD患者甲状腺组织与长病程GD患者甲状腺组织的对比(S-L)。再对差异基因进行多重比较及功能注释分析。结果维恩图显示,KLF9、RGS1基因同时存在于C-GD CD4、C-GD CD8与C-L差异基因中。氨基酸和类固醇代谢基因可能与GD的发病相关。FMO2、CALHM6和C7基因同时存在于C-S、C-L、S-L差异基因中。长病程和短病程GD患者甲状腺组织CALHM6基因表达水平高于对照者,长病程GD患者CALHM6基因表达水平高于短病程GD患者;长病程和短病程GD患者甲状腺组织FMO2和C7基因表达水平低于对照者,长病程GD患者FMO2和C7基因表达水平低于短病程GD患者(P<0.05)。结论GD的发病可能与KLF9、RGS1的异常表达及氨基酸和类固醇代谢有关,FMO2、CALHM6、C7基因可能与GD的病程相关。
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关键词
格雷夫斯病
甲状腺
基因芯片
免疫系统
类固醇激素
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题名
与Graves’Disease发病机制相关的基因研究
被引量:
2
1
作者
赵得发
滕卫平
滕晓春
机构
中国医科大学附属第一医院内分泌与代谢病科内分泌研究所辽宁省内分泌疾病重点实验室
出处
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2020年第8期935-941,共7页
基金
国家自然科学基金重点项目(81430018)。
文摘
背景Graves’Disease(GD)是一种常见的自身免疫性疾病,但其发病机制尚不明确。目的通过对公共基因芯片数据的分析,找出与GD发病可能相关的基因。方法在GEO数据库和ArrayExpress数据库中检索“Graves’Disease”,得到GSE71956和E-MEXP-2612(截至2019-04-02)。利用R语言的“Limma”包对基因芯片的原始数据进行标准化处理并找出差异基因。差异基因共包括对照CD4细胞与GD患者CD4细胞的对比(C-GD CD4)、对照CD8细胞与GD患者CD8细胞的对比(C-GD CD8)、对照者甲状腺组织与短病程GD患者甲状腺组织的对比(C-S)、对照者甲状腺组织与长病程GD患者甲状腺组织的对比(C-L)、短病程GD患者甲状腺组织与长病程GD患者甲状腺组织的对比(S-L)。再对差异基因进行多重比较及功能注释分析。结果维恩图显示,KLF9、RGS1基因同时存在于C-GD CD4、C-GD CD8与C-L差异基因中。氨基酸和类固醇代谢基因可能与GD的发病相关。FMO2、CALHM6和C7基因同时存在于C-S、C-L、S-L差异基因中。长病程和短病程GD患者甲状腺组织CALHM6基因表达水平高于对照者,长病程GD患者CALHM6基因表达水平高于短病程GD患者;长病程和短病程GD患者甲状腺组织FMO2和C7基因表达水平低于对照者,长病程GD患者FMO2和C7基因表达水平低于短病程GD患者(P<0.05)。结论GD的发病可能与KLF9、RGS1的异常表达及氨基酸和类固醇代谢有关,FMO2、CALHM6、C7基因可能与GD的病程相关。
关键词
格雷夫斯病
甲状腺
基因芯片
免疫系统
类固醇激素
Keywords
Graves disease
Thyroid gland
Gene microarray
Immune system
Steroid hormone
分类号
R581.1 [医药卫生—内分泌]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
与Graves’Disease发病机制相关的基因研究
赵得发
滕卫平
滕晓春
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2020
2
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