目的挖掘尫痹片治疗类风湿关节炎的物质基础与作用机制。方法利用多种数据库挖掘尪痹片组分中的有效成分和对应的潜在作用靶点;通过GeneCards和OMIM数据库检索类风湿关节炎的疾病靶点;采用Cytoscape 3.8.1软件构建有效成分-靶点网络;利...目的挖掘尫痹片治疗类风湿关节炎的物质基础与作用机制。方法利用多种数据库挖掘尪痹片组分中的有效成分和对应的潜在作用靶点;通过GeneCards和OMIM数据库检索类风湿关节炎的疾病靶点;采用Cytoscape 3.8.1软件构建有效成分-靶点网络;利用STRING数据平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络;运用R4.0.1软件的clusterprofiler包进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes,KEGG)富集分析;选取核心有效成分及关键靶点,使用Schr9dinger软件进行分子对接。结果网络药理学预测显示尪痹片中核心有效成分是檞木素、山柰酚、木犀草素、豆甾醇、黄芩素,关键靶点为TNF、AKT1、TP53、IL6、EGFR、JUN、RELA、IL1B、MAPK1、ALB、CCL2;GO分析共获得生物过程(BP)1324种,细胞组成(CC)4种,分子功能(MF)59种;KEGG分析获取相关信号通路138种;分子对接结果显示大部分核心有效成分与关键靶点具有较好的结合活性。结论尪痹片通过其主要成分与多个靶点蛋白作用,通过调控类风湿关节炎发展过程中的多条生物通路发挥治疗作用。展开更多
文摘目的挖掘尫痹片治疗类风湿关节炎的物质基础与作用机制。方法利用多种数据库挖掘尪痹片组分中的有效成分和对应的潜在作用靶点;通过GeneCards和OMIM数据库检索类风湿关节炎的疾病靶点;采用Cytoscape 3.8.1软件构建有效成分-靶点网络;利用STRING数据平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络;运用R4.0.1软件的clusterprofiler包进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes,KEGG)富集分析;选取核心有效成分及关键靶点,使用Schr9dinger软件进行分子对接。结果网络药理学预测显示尪痹片中核心有效成分是檞木素、山柰酚、木犀草素、豆甾醇、黄芩素,关键靶点为TNF、AKT1、TP53、IL6、EGFR、JUN、RELA、IL1B、MAPK1、ALB、CCL2;GO分析共获得生物过程(BP)1324种,细胞组成(CC)4种,分子功能(MF)59种;KEGG分析获取相关信号通路138种;分子对接结果显示大部分核心有效成分与关键靶点具有较好的结合活性。结论尪痹片通过其主要成分与多个靶点蛋白作用,通过调控类风湿关节炎发展过程中的多条生物通路发挥治疗作用。
