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兔膝关节前交叉韧带和内侧副韧带部分损伤后差异表达的内源性竞争性circRNA-miRNA-mRNA网络与核心基因的筛选与功能分析
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作者 李一帆 于涵 +1 位作者 李彬 温昱 《解剖学杂志》 CAS 2023年第6期484-491,共8页
目的:揭示兔膝关节前交叉韧带(ACL)和内侧副韧带(MCL)部分损伤后内源性竞争性环状RNA(circRNA)与微小RNA(miRNA)及信使RNA(mRNA)的相互作用关系,以探讨阻碍ACL损伤后内源性修复的分子机制。方法:兔正常和部分损伤的ACL及MCL组织H-E染色... 目的:揭示兔膝关节前交叉韧带(ACL)和内侧副韧带(MCL)部分损伤后内源性竞争性环状RNA(circRNA)与微小RNA(miRNA)及信使RNA(mRNA)的相互作用关系,以探讨阻碍ACL损伤后内源性修复的分子机制。方法:兔正常和部分损伤的ACL及MCL组织H-E染色,进行形态学观察。进行全转录组建库测序,并通过差异分析确定差异表达基因。进行功能分析和蛋白质相互作用网络构建,鉴定核心基因,并建立内源性竞争性circRNA-miRNA-mRNA网络。结果:兔正常和部分损伤的ACL及MCL在炎症反应、细胞增殖及胶原沉积等方面均存在显著差异。得到16个核心基因,并构建了6个核心基因的circRNA-miRNA-mRNA网络。结论:兔正常和部分损伤的ACL及MCL差异表达基因的富集分析通路和核心基因的表达趋势存在明显差异,这为进一步研究ACL损伤内源性修复障碍的机制提供了新思路。 展开更多
关键词 前交叉韧带 内侧副韧带 修复 环状RNA 竞争性内源性RNA网络
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兔膝关节前交叉韧带和内侧副韧带损伤后差异表达的内源性竞争性lncRNA和mRNA网络与核心基因的筛选及功能分析
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作者 于涵 李一帆 +1 位作者 李彬 温昱 《解剖学杂志》 CAS 2023年第6期476-483,544,共9页
目的:对比兔膝关节前交叉韧带(ACL)和内侧副韧带(MCL)部分损伤前、后内源性竞争性长链非编码核糖核酸(lncRNA)与信使核糖核酸(mRNA)的差异表达,探索阻碍ACL内源性修复可能的分子机制。方法:对兔部分损伤ACL和MCL后的RNA进行测序,获得差... 目的:对比兔膝关节前交叉韧带(ACL)和内侧副韧带(MCL)部分损伤前、后内源性竞争性长链非编码核糖核酸(lncRNA)与信使核糖核酸(mRNA)的差异表达,探索阻碍ACL内源性修复可能的分子机制。方法:对兔部分损伤ACL和MCL后的RNA进行测序,获得差异表达lncRNA和差异表达mRNA,并用qRT-PCR验证,随后进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)分析,构建ceRNA网络。结果:共获得853个差异表达的lncRNA和994个差异表达的mRNA。GO和KEGG分析结果显示,差异表达的lncRNA在炎症反应、细胞外基质与受体的相互作用和细胞增殖方面差异较大,差异表达的mRNA在细胞因子活化和细胞黏附具有较大差异。ACL与MCL部分损伤后的核心基因差异显著。结论:兔部分损伤ACL与MCL之间的lncRNA及mRNA的表达存在明显差异,为ACL损伤内源性修复障碍机制的分子层面研究提供了更多的理论依据。 展开更多
关键词 膝关节 前交叉韧带 内侧副韧带 长链非编码RNA 生物信息学
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兔部分损伤前交叉与内侧副韧带差异环状RNA的筛选与功能分析 被引量:1
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作者 陈思远 谷慧凝 +3 位作者 韩银河 张明正 李彬 温昱 《解剖学杂志》 CAS 2022年第5期431-438,共8页
目的:交叉对比兔前交叉韧带(ACL)与内侧副韧带(MCL)部分损伤前后环状RNA表达差异,并进行功能分析,探讨ACL内源性修复障碍可能的分子机制。方法:对兔ACL及MCL组织环状RNA建库测序,筛选符合标准的差异环状RNA,并用qRT-PCR验证,对筛选的差... 目的:交叉对比兔前交叉韧带(ACL)与内侧副韧带(MCL)部分损伤前后环状RNA表达差异,并进行功能分析,探讨ACL内源性修复障碍可能的分子机制。方法:对兔ACL及MCL组织环状RNA建库测序,筛选符合标准的差异环状RNA,并用qRT-PCR验证,对筛选的差异环状RNA进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)分析,并构建其ceRNA网络。结果:各组中共筛选出308个差异环状RNA,GO和KEGG分析表明,ACL与MCL损伤后的差异环状RNA在血管生成、炎症反应、细胞增殖与凋亡及mRNA转录与蛋白翻译方面均存在较大差异。ACL与MCL损伤后的ceRNA网络差异显著。结论:环状RNA在ACL与MCL损伤后的差异表达谱中存在明显差异,为进一步研究ACL损伤内源性修复障碍的机制提供了新思路。 展开更多
关键词 环状RNA 前交叉韧带 内侧副韧带 修复
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自噬在兔部分损伤前交叉韧带和内侧副韧带中的差异 被引量:2
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作者 谷慧凝 韩银河 +2 位作者 张明正 李彬 温昱 《解剖学杂志》 CAS 2021年第3期189-193,F0002,共6页
目的:确定兔前交叉韧带和内侧副韧带部分损伤后自噬的存在,并比较损伤后不同时间两者之间自噬的表达差异,探讨其愈合能力差异与自噬的关系。方法:3月龄健康雄性新西兰大白兔18只,随机选取3只作为对照组,其余兔建立前交叉韧带和内侧副韧... 目的:确定兔前交叉韧带和内侧副韧带部分损伤后自噬的存在,并比较损伤后不同时间两者之间自噬的表达差异,探讨其愈合能力差异与自噬的关系。方法:3月龄健康雄性新西兰大白兔18只,随机选取3只作为对照组,其余兔建立前交叉韧带和内侧副韧带部分损伤模型,随机分为5组,各组分别在造模后3 d、1周、2周、4周、6周取材。H-E染色观察损伤部位形态学变化,透射电镜观察损伤部位超微结构变化,免疫印迹检测自噬相关蛋白Beclin 1、LC3Ⅱ/Ⅰ、p62表达水平,RT-PCR检测自噬相关基因Beclin 1、ATG-5 mRNA表达水平。结果:在部分损伤后3 d、1周、2周、4周、6周5个时间点,前交叉韧带和内侧副韧带均未表现出明显的愈合趋势,观察到自噬小体的存在。与对照组相比,自噬相关蛋白Beclin 1、LC3Ⅱ/Ⅰ、p62在前交叉韧带中的高表达更为显著,在内侧副韧带中的表达更早恢复至正常水平,并继续降低;自噬相关基因ATG-5、Beclin 1在前交叉韧带中始终处于高表达状态,峰值出现在1周,内侧副韧带高表达峰值出现在2周,此后逐渐恢复至正常水平。结论:兔前交叉韧带、内侧副韧带部分损伤后自噬相关因子的表达随时间推移,总体呈现先升高后降低的变化趋势,损伤后不同时间点前交叉韧带、内侧副韧带中自噬的表达存在明显差异,推测前交叉韧带损伤后自噬的过度激活可能导致其内源性修复障碍。 展开更多
关键词 自噬 前交叉韧带 内侧副韧带 部分损伤
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