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生物信息学的共词分析研究
被引量:
73
1
作者
张晗
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2003年第5期613-617,共5页
本文应用共词分析的方法对生物信息学的主题词进行聚类,得到其研究的热点内容,然后利用战略坐标进一步定量地分析了各热点的发展阶段.
关键词
生物信息学
共词分析
聚类分析
情报分析
文献计量学
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职称材料
MEDLINE数据库中生物体类主题词相关语义关系的构建与评价
被引量:
2
2
作者
张浩
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2009年第6期878-885,共8页
本研究对MEDLINE中生物体类文献中高频主要主题词进行共词聚类分析,获取主题词之间的关联规则,利用UMLS语义关系进行结构化表达。从MEDLINE中选取《中华医学杂志》上的生物体类文献作为测试集,由专家人工抽取关系,与共词聚类得到的关联...
本研究对MEDLINE中生物体类文献中高频主要主题词进行共词聚类分析,获取主题词之间的关联规则,利用UMLS语义关系进行结构化表达。从MEDLINE中选取《中华医学杂志》上的生物体类文献作为测试集,由专家人工抽取关系,与共词聚类得到的关联规则进行比较。利用共词聚类分析对生物体类主题词关系的挖掘及评价分析,为文本知识发现提供了一种新的尝试。
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关键词
文本挖掘
规则库建立
知识表达
主题词共现聚类分析
规则评价
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职称材料
应用引文共引聚类-内容词分析法对学科发展的研究
被引量:
20
3
作者
侯跃芳
崔雷
吴迪
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2007年第2期309-314,共6页
将引文共引聚类与内容词分析法相结合揭示专题发展,通过引文共引聚类描述妊娠糖尿病专题研究的发展历史,通过高频引文的重要来源文献的内容词分析描述该专题研究现状,同时计算来源文献类内相似度、关联度及类间差异度,验证引文共引...
将引文共引聚类与内容词分析法相结合揭示专题发展,通过引文共引聚类描述妊娠糖尿病专题研究的发展历史,通过高频引文的重要来源文献的内容词分析描述该专题研究现状,同时计算来源文献类内相似度、关联度及类间差异度,验证引文共引聚类的效果。
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关键词
引文共引聚类分析
内容词分析
学科发展
妊娠糖尿病
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职称材料
期刊引文网络影响测度研究
被引量:
9
4
作者
黄亚明
王琳辉
金碧辉
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2008年第2期265-270,共6页
利用Goosle的PageRank原理进行期刊引文分析,提出期刊在引文网络中的影响力测度指标——引文网络影响力序位(Journal Impact Rank in Citation Net,Impact Rank或IR)。通过对118种生物学领域的期刊进行期刊引文网络影响力测度,并...
利用Goosle的PageRank原理进行期刊引文分析,提出期刊在引文网络中的影响力测度指标——引文网络影响力序位(Journal Impact Rank in Citation Net,Impact Rank或IR)。通过对118种生物学领域的期刊进行期刊引文网络影响力测度,并将IR结果与JCR提供的影响因子(Impact Factor,IF)值进行统计学分析以考察二者的相关性和差异性。结果表明,IR值与IF值的相关性较弱,其差异性具有统计学意义。分析其原因,IR考虑了引证期刊的权重和期刊间的相互影响,更适于反映期刊在其相关学科或领域的引文网络中的相对影响力;IF值因其实质上是期刊论文篇均被引频次,其计算不考虑期刊之间的相互联系和引证期刊的权威性,因而更适用于期刊自身的纵向评价;IR与IF从两种不同角度评价期刊影响力,可互为补充。
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关键词
期刊引文网络
PAGERANK
影响力
引文分析
影响因子
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职称材料
基于共词分析的学科结构可视化方法的比较
被引量:
6
5
作者
杨颖
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2011年第10期1115-1120,共6页
目的:基于对医学信息学学科结构的共词分析,比较几种常用可视化方法的特点。方法:套录PubMed数据库从2004~2008年医学信息学核心期刊上发表的文献,生成高频主题词的共词矩阵与词篇矩阵,进行聚类分析、战略坐标分析和社会网络分析...
目的:基于对医学信息学学科结构的共词分析,比较几种常用可视化方法的特点。方法:套录PubMed数据库从2004~2008年医学信息学核心期刊上发表的文献,生成高频主题词的共词矩阵与词篇矩阵,进行聚类分析、战略坐标分析和社会网络分析。结果:各种方法从不同角度揭示该学科研究热点结构与特性。结论:聚类树图展现出某学科领域的主题结构、战略坐标展现出各主题在整个学科结构上的重要性或特性、社会网络图谱展现出各主题内部关系。
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关键词
共词可视化
聚类分析
战略坐标
社会网络分析
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职称材料
基于文本主题相似性的专题文献检索结果的聚类分析
被引量:
4
6
作者
王秀艳
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2011年第5期456-463,共8页
在向文献数据库发送检索提问后,用户检索到的往往是数量众多且线性排列的文献记录,如何进一步分类这些文献记录以方便用户使用是信息检索领域的重要课题之一。本文以一个比较狭小的主题(脊髓损伤)为文献查询提问,探索利用原数据库中...
在向文献数据库发送检索提问后,用户检索到的往往是数量众多且线性排列的文献记录,如何进一步分类这些文献记录以方便用户使用是信息检索领域的重要课题之一。本文以一个比较狭小的主题(脊髓损伤)为文献查询提问,探索利用原数据库中提供的论文主题相似性信息对检索到的文献记录进行聚类的方法,并对每个类别赋予类别标签。本文①利用生物医学权威文献数据库Medline,分别检索PubMed中有关脊髓损伤的部分文献(源文献),实际操作中我们抽取近两年发表的有关脊髓损伤的1906篇文献中前50篇;②利用PubMed中的"相关文献"功能分别检索出源文献的相关文献(共5108篇),筛选出频次较高的相关文献(出现频次大于或等于5次,共31篇);③形成源文献和相关文献的关联矩阵,根据该矩阵对来源文献进行聚类分析;④分别采用人工分析和主题词的向量空间模型算法提取各类的文献内容或类标签,初步评价分类结果的正确性。经过基于相似性的聚类分析,可以将脊髓损伤的源文献分为3个大类,对比人工分析和主题词向量空间模型方法对来源文献的内容提取,二者基本相符。就本文研究涉及的主题而言,利用文献数据库中提供的论文相关性信息对检索结果进行再次分类的方法是可行的。
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关键词
相关文献
文本分类
聚类分析
脊髓损伤
向量空间模型
特征项频率
文档频率
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职称材料
2001-2006年国际情报学研究的引文分析
被引量:
6
7
作者
王孝宁
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2007年第3期399-407,共9页
目的:了解当前国际情报学研究现状,总结研究热点,提供参考信息。方法:采用引文分析方法,对国外6种情报学核心期刊2001~2006年发表的学术论文进行调查分析,并用SPSS对高频被引文献进行同被引聚类分析。根据各个类中的文献内容分...
目的:了解当前国际情报学研究现状,总结研究热点,提供参考信息。方法:采用引文分析方法,对国外6种情报学核心期刊2001~2006年发表的学术论文进行调查分析,并用SPSS对高频被引文献进行同被引聚类分析。根据各个类中的文献内容分析当前研究的热点。结果:检得SSCI数据库中相关文献2320篇,其参考文献出现频次高于30次的论文47篇。高被引论文聚类分析树图分6类。结论:当前情报学研究热点主要集中于六个方面:网络信息资源评价、文献及作者同被引分析、信息组织处理、用户信息检索行为研究、情报学在医学领域的应用及基本理论阐述。
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关键词
情报学
引文分析法
聚类分析
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职称材料
急性白血病相关基因的文本挖掘分析
被引量:
4
8
作者
闫雷
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2008年第2期169-174,共6页
从PubMed检索1966年到2005年9月6日间白血病与基因关系的相关文献3529篇。经编程处理生成主题词词篇矩阵并进行聚类。通过聚类树图可将所提取的主题词,副主题词分成13类,经对比原始文献进行验证,全部29种基因中只与ALL相关的有3种,...
从PubMed检索1966年到2005年9月6日间白血病与基因关系的相关文献3529篇。经编程处理生成主题词词篇矩阵并进行聚类。通过聚类树图可将所提取的主题词,副主题词分成13类,经对比原始文献进行验证,全部29种基因中只与ALL相关的有3种,占10.34%;只与AML相关的有8种,占27.59%。特异的可用于鉴别ALL和AML的基因有11种,占37.93%。通过主题词的共现关系进行聚类可以基本实现发现基因与疾病之间的联系,但该方法所获得的相关基因较少,不利于对疾病与基因关系的全面了解。
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关键词
白血病
基因
文本挖掘
聚类分析
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职称材料
题名
生物信息学的共词分析研究
被引量:
73
1
作者
张晗
崔雷
机构
中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
出处
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2003年第5期613-617,共5页
文摘
本文应用共词分析的方法对生物信息学的主题词进行聚类,得到其研究的热点内容,然后利用战略坐标进一步定量地分析了各热点的发展阶段.
关键词
生物信息学
共词分析
聚类分析
情报分析
文献计量学
分类号
G350 [文化科学—情报学]
Q-3 [生物学]
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职称材料
题名
MEDLINE数据库中生物体类主题词相关语义关系的构建与评价
被引量:
2
2
作者
张浩
崔雷
机构
中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
出处
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2009年第6期878-885,共8页
基金
本研究受国家自然科学基金项目(70473101)“运用文本数据库中元数据进行关联规则知识发现的研究”资助.
文摘
本研究对MEDLINE中生物体类文献中高频主要主题词进行共词聚类分析,获取主题词之间的关联规则,利用UMLS语义关系进行结构化表达。从MEDLINE中选取《中华医学杂志》上的生物体类文献作为测试集,由专家人工抽取关系,与共词聚类得到的关联规则进行比较。利用共词聚类分析对生物体类主题词关系的挖掘及评价分析,为文本知识发现提供了一种新的尝试。
关键词
文本挖掘
规则库建立
知识表达
主题词共现聚类分析
规则评价
Keywords
text mining
rule base construction
knowledge representation
MeSH terms co-occurrence analysis
rules evaluation
分类号
G354.4 [文化科学—情报学]
H146.3 [语言文字—汉语]
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职称材料
题名
应用引文共引聚类-内容词分析法对学科发展的研究
被引量:
20
3
作者
侯跃芳
崔雷
吴迪
机构
中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
出处
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2007年第2期309-314,共6页
文摘
将引文共引聚类与内容词分析法相结合揭示专题发展,通过引文共引聚类描述妊娠糖尿病专题研究的发展历史,通过高频引文的重要来源文献的内容词分析描述该专题研究现状,同时计算来源文献类内相似度、关联度及类间差异度,验证引文共引聚类的效果。
关键词
引文共引聚类分析
内容词分析
学科发展
妊娠糖尿病
Keywords
co-citation cluster analysis, content words analysis, research of a topic, gestational diabetes mellitus
分类号
G350 [文化科学—情报学]
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职称材料
题名
期刊引文网络影响测度研究
被引量:
9
4
作者
黄亚明
王琳辉
金碧辉
机构
中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
中国
科学院国家科学图书馆
复旦
大学
附属肿瘤医院《
中国
癌症杂志》编辑部
出处
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2008年第2期265-270,共6页
文摘
利用Goosle的PageRank原理进行期刊引文分析,提出期刊在引文网络中的影响力测度指标——引文网络影响力序位(Journal Impact Rank in Citation Net,Impact Rank或IR)。通过对118种生物学领域的期刊进行期刊引文网络影响力测度,并将IR结果与JCR提供的影响因子(Impact Factor,IF)值进行统计学分析以考察二者的相关性和差异性。结果表明,IR值与IF值的相关性较弱,其差异性具有统计学意义。分析其原因,IR考虑了引证期刊的权重和期刊间的相互影响,更适于反映期刊在其相关学科或领域的引文网络中的相对影响力;IF值因其实质上是期刊论文篇均被引频次,其计算不考虑期刊之间的相互联系和引证期刊的权威性,因而更适用于期刊自身的纵向评价;IR与IF从两种不同角度评价期刊影响力,可互为补充。
关键词
期刊引文网络
PAGERANK
影响力
引文分析
影响因子
Keywords
journal citation net, PageRank, impact rank, citation analysis, impact factor
分类号
G210.7 [文化科学—新闻学]
G350 [文化科学—情报学]
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职称材料
题名
基于共词分析的学科结构可视化方法的比较
被引量:
6
5
作者
杨颖
崔雷
机构
中国医科大学
图书馆
中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
出处
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2011年第10期1115-1120,共6页
文摘
目的:基于对医学信息学学科结构的共词分析,比较几种常用可视化方法的特点。方法:套录PubMed数据库从2004~2008年医学信息学核心期刊上发表的文献,生成高频主题词的共词矩阵与词篇矩阵,进行聚类分析、战略坐标分析和社会网络分析。结果:各种方法从不同角度揭示该学科研究热点结构与特性。结论:聚类树图展现出某学科领域的主题结构、战略坐标展现出各主题在整个学科结构上的重要性或特性、社会网络图谱展现出各主题内部关系。
关键词
共词可视化
聚类分析
战略坐标
社会网络分析
Keywords
co-word visualization, cluster analysis, strategic diagram, social network analysis
分类号
G350 [文化科学—情报学]
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职称材料
题名
基于文本主题相似性的专题文献检索结果的聚类分析
被引量:
4
6
作者
王秀艳
崔雷
机构
中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
出处
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2011年第5期456-463,共8页
文摘
在向文献数据库发送检索提问后,用户检索到的往往是数量众多且线性排列的文献记录,如何进一步分类这些文献记录以方便用户使用是信息检索领域的重要课题之一。本文以一个比较狭小的主题(脊髓损伤)为文献查询提问,探索利用原数据库中提供的论文主题相似性信息对检索到的文献记录进行聚类的方法,并对每个类别赋予类别标签。本文①利用生物医学权威文献数据库Medline,分别检索PubMed中有关脊髓损伤的部分文献(源文献),实际操作中我们抽取近两年发表的有关脊髓损伤的1906篇文献中前50篇;②利用PubMed中的"相关文献"功能分别检索出源文献的相关文献(共5108篇),筛选出频次较高的相关文献(出现频次大于或等于5次,共31篇);③形成源文献和相关文献的关联矩阵,根据该矩阵对来源文献进行聚类分析;④分别采用人工分析和主题词的向量空间模型算法提取各类的文献内容或类标签,初步评价分类结果的正确性。经过基于相似性的聚类分析,可以将脊髓损伤的源文献分为3个大类,对比人工分析和主题词向量空间模型方法对来源文献的内容提取,二者基本相符。就本文研究涉及的主题而言,利用文献数据库中提供的论文相关性信息对检索结果进行再次分类的方法是可行的。
关键词
相关文献
文本分类
聚类分析
脊髓损伤
向量空间模型
特征项频率
文档频率
Keywords
text categorization
related articles
cluster analysis
spinal cord injuries
vector space model
term frequency
document frequency
分类号
G256 [文化科学—图书馆学]
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职称材料
题名
2001-2006年国际情报学研究的引文分析
被引量:
6
7
作者
王孝宁
崔雷
机构
中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
出处
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2007年第3期399-407,共9页
文摘
目的:了解当前国际情报学研究现状,总结研究热点,提供参考信息。方法:采用引文分析方法,对国外6种情报学核心期刊2001~2006年发表的学术论文进行调查分析,并用SPSS对高频被引文献进行同被引聚类分析。根据各个类中的文献内容分析当前研究的热点。结果:检得SSCI数据库中相关文献2320篇,其参考文献出现频次高于30次的论文47篇。高被引论文聚类分析树图分6类。结论:当前情报学研究热点主要集中于六个方面:网络信息资源评价、文献及作者同被引分析、信息组织处理、用户信息检索行为研究、情报学在医学领域的应用及基本理论阐述。
关键词
情报学
引文分析法
聚类分析
Keywords
information science, citation analysis method, clustering analysis
分类号
G350 [文化科学—情报学]
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职称材料
题名
急性白血病相关基因的文本挖掘分析
被引量:
4
8
作者
闫雷
崔雷
机构
中国医科大学信息管理与信息系统(医学)系
出处
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2008年第2期169-174,共6页
基金
国家自然科学基金项目“运用文本数据库中元数据关联规则进行知识发现的研究”(No.70473101).
文摘
从PubMed检索1966年到2005年9月6日间白血病与基因关系的相关文献3529篇。经编程处理生成主题词词篇矩阵并进行聚类。通过聚类树图可将所提取的主题词,副主题词分成13类,经对比原始文献进行验证,全部29种基因中只与ALL相关的有3种,占10.34%;只与AML相关的有8种,占27.59%。特异的可用于鉴别ALL和AML的基因有11种,占37.93%。通过主题词的共现关系进行聚类可以基本实现发现基因与疾病之间的联系,但该方法所获得的相关基因较少,不利于对疾病与基因关系的全面了解。
关键词
白血病
基因
文本挖掘
聚类分析
Keywords
leukemia, genes, textual mining, cluster analysis
分类号
G254.2 [文化科学—图书馆学]
Q344.13 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
生物信息学的共词分析研究
张晗
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2003
73
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职称材料
2
MEDLINE数据库中生物体类主题词相关语义关系的构建与评价
张浩
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2009
2
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职称材料
3
应用引文共引聚类-内容词分析法对学科发展的研究
侯跃芳
崔雷
吴迪
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2007
20
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职称材料
4
期刊引文网络影响测度研究
黄亚明
王琳辉
金碧辉
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2008
9
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职称材料
5
基于共词分析的学科结构可视化方法的比较
杨颖
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2011
6
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职称材料
6
基于文本主题相似性的专题文献检索结果的聚类分析
王秀艳
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2011
4
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职称材料
7
2001-2006年国际情报学研究的引文分析
王孝宁
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2007
6
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职称材料
8
急性白血病相关基因的文本挖掘分析
闫雷
崔雷
《情报学报》
CSSCI
北大核心
2008
4
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职称材料
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引证文献
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