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题名基于SNP位点鉴定砂仁药材物种
被引量：14
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作者
焦文静
张鹏
廖保生
王丽丽
韩建萍
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机构
中国医学科学院北京协和医学院/药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室
北京化工大学生命科学与技术学院
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出处
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2014年第2期295-300,共6页
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基金
国家自然科学基金委青年基金项目(81001608):基于全叶绿体基因组分析筛选乌头属药用植物DNA条形码序列
负责人:韩建萍
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文摘
目的:为建立基于单核苷酸多态性(SNP)技术鉴别砂仁3个基原(阳春砂Amomum villosum、海南砂Amomum longiligulare、绿壳砂Amomum villosum var.xanthioides)的方法,对这3个种共计60份材料ITS2序列进行分析比较。方法:将实验所得砂仁ITS2序列,应用CodonCode Aligner软件进行序列拼接比对。用MEGA 5.0导出各序列变异位点,并对变异位点进行分析。为验证结果准确性,下载砂仁3个基原GenBank的所有ITS2序列,共计34条,对结果进行验证。结果:砂仁ITS2序列比对后长度为230 bp,3个不同基原在135 bp和199 bp处存在稳定SNP(s)变异位点。结论:本研究开发的两个稳定的SNP(s)位点可以快速准确地鉴定砂仁药材3个基原。
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关键词
砂仁
ITS2
SNP位点
鉴定
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Keywords
Fructus Amomi, ITS2, SNPs, identification
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分类号
R284.1
[医药卫生—中药学]
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