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印度洋深海沉积物可培养放线菌多样性及抗革兰阴性菌活性物质研究 被引量:2
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作者 胡媛媛 蒙建州 +6 位作者 郝立凯 李娇 郝晓萌 段艳波 关艳 甘茂罗 肖春玲 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2018年第4期415-423,共9页
目的从印度洋深海沉积物中分离可培养海洋放线菌,对获得的一株海洋微生物进行抗革兰阴性菌活性物质研究。方法设计11种分离培养基进行海洋放线菌分离,通过16S r RNA基因序列比对分析确定菌株分类;利用多种色谱方法,对菌株IMB16-059产生... 目的从印度洋深海沉积物中分离可培养海洋放线菌,对获得的一株海洋微生物进行抗革兰阴性菌活性物质研究。方法设计11种分离培养基进行海洋放线菌分离,通过16S r RNA基因序列比对分析确定菌株分类;利用多种色谱方法,对菌株IMB16-059产生的活性物质进行分离纯化,通过波谱学和化学方法鉴定其结构。结果根据菌落表型共分离得68株微生物,经16S r RNA分析表明,其中34株属于放线菌门,覆盖5科5属;其余属于厚壁菌门和变形菌门。25株发酵产物显示出抗革兰阴性菌活性。从赤杆菌IMB16-059中分离鉴定了6个化合物,其结构分别确定为L,L-环(脯氨酸-丙氨酸)(1),L,L-环(脯氨酸-酪氨酸(2)),D,L-环(脯氨酸-酪氨酸)(3),邻氨基苯甲酸(4),胸腺嘧啶(5),1H-喹啉-4-酮(6)。化合物1和4显示出抗铜绿假单胞菌活性,在样品浓度为20μg/片时,抑菌圈直径分别为13和20mm。结论印度洋深海沉积物蕴含丰富的微生物类群,其发酵产物显示出较好的抗革兰阴性菌活性,可为新抗生素发现提供重要的菌种资源。 展开更多
关键词 印度洋 放线菌 赤杆菌属 抗菌 天然产物
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4,5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基-19-S-甲基格尔德霉素及其与格尔德霉素生物合成PKS后修饰的关系 被引量:1
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作者 牛沂菲 武临专 +8 位作者 赫卫清 李京艳 刘昕 倪四阳 林灵 王红远 孙桂芝 李书芬 王以光 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期39-44,共6页
目的在吸水链霉菌17997格尔德霉素生物合成PKS后修饰gdmN-变株发酵产物中寻找新格尔德霉素衍生物。方法 gdmN-变株发酵上清液乙酸乙酯提取后,进行硅胶板TLC分析;对一个红色目标化合物进行了HPLC和高分辨质谱分析,并对其进行了1H-和13C-... 目的在吸水链霉菌17997格尔德霉素生物合成PKS后修饰gdmN-变株发酵产物中寻找新格尔德霉素衍生物。方法 gdmN-变株发酵上清液乙酸乙酯提取后,进行硅胶板TLC分析;对一个红色目标化合物进行了HPLC和高分辨质谱分析,并对其进行了1H-和13C-核磁共振(NMR)分析;对红色目标化合物在吸水链霉菌17997格尔德霉素PKS基因阻断变株中进行了生物转化实验。结果在gdmN-变株发酵产物中发现了1个预期的红色目标化合物(4,5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基-19-S-甲基格尔德霉素);该目标化合物可被格尔德霉素生物合成PKS后修饰系统7-O-氨甲酰化,生成4,5-双氢-19-S-甲基格尔德霉素。结论在gdmN-变株中发现了4,5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基-19-S-甲基格尔德霉素;该化合物可被格尔德霉素PKS后修饰系统继续7-O-氨甲酰化,但不能C-4,5氧化。 展开更多
关键词 4 5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基-19-S甲基格尔德霉素 gdmN 格尔德霉素生物合成 PKS后修饰
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吸水链霉菌17997产生氢醌型格尔德霉素及其生物合成中间产物 被引量:1
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作者 贾长虹 刘昕 +6 位作者 赫卫清 林灵 张侃 王红远 孙桂芝 王以光 武临专 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期833-838,共6页
目的了解格尔德霉素生物合成PKS后修饰过程中的一些细节。方法对格尔德霉素产生菌吸水链霉菌17997及其格尔德霉素生物合成聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)后修饰基因阻断变株(gdmP和gdmN)在ISPII平板不同时间的培养物进行乙酸... 目的了解格尔德霉素生物合成PKS后修饰过程中的一些细节。方法对格尔德霉素产生菌吸水链霉菌17997及其格尔德霉素生物合成聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)后修饰基因阻断变株(gdmP和gdmN)在ISPII平板不同时间的培养物进行乙酸乙酯提取,硅胶板TLC和NaOH显色分析,检测GDM及其生物合成中间产物,并利用LC-MS对中间产物进行鉴定。结果吸水链霉菌17997原株、gdmN和gdmP-变株在培养时间72~96h,发现氢醌型格尔德霉素(GQH2)、氢醌型4,5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基格尔德霉素(H,GQH2-dC)和氢醌型4,5-双氢格尔德霉素(H2GQH2)分别为主要组分,相应的醌型化合物为次要组分;之后,这些氢醌型化合物随培养时间延长逐渐消失,相应的醌型化合物成为主要组分。双向硅胶板TLC分析证实GQH2、H2GQH2-dC和IH2GQH2均可在空气中自发氧化为相应的醌型化合物。结论在吸水链霉菌17997的GDM生物合成PKS后修饰过程中,首次提出GQH2自发氧化为GDM可能是氢醌型向醌型转变的位点,同时它也是GDM生物合成最后一步。 展开更多
关键词 格尔德霉素 氢醌型格尔德霉素 生物合成 吸水链霉菌17997
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红霉素和阿奇霉素诱导斑马鱼肝毒性及作用机制研究 被引量:9
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作者 张苗青 张靖溥 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期256-261,共6页
目的利用模式生物斑马鱼模型探索红霉素和阿奇霉素导致肝毒性及作用机制,并比较红霉素和阿奇霉素诱导肝毒性的差异。方法选用肝脏转基因斑马鱼Tg(fapb10:dsRed)作为实验动物,将发育正常的3dpf斑马鱼幼鱼暴露于不同浓度的红霉素和阿奇霉... 目的利用模式生物斑马鱼模型探索红霉素和阿奇霉素导致肝毒性及作用机制,并比较红霉素和阿奇霉素诱导肝毒性的差异。方法选用肝脏转基因斑马鱼Tg(fapb10:dsRed)作为实验动物,将发育正常的3dpf斑马鱼幼鱼暴露于不同浓度的红霉素和阿奇霉素溶液中72h后,统计各组斑马鱼死亡率,计算红霉素和阿奇霉素对斑马鱼的LD50;荧光显微镜下活体观察斑马鱼幼鱼给药后肝脏形态的变化;采用整体油红O染色观察肝脏脂肪含量变化;利用qRT-PCR检测肝脏病理标志基因和凋亡相关基因在转录水平的变化。结果红霉素和阿奇霉素对斑马鱼的LD50分别为3.82mmol/L和3.10mmol/L;活体观察显示红霉素和阿奇霉素均能导致幼鱼肝脏形态和荧光强度变化;整体油红O染色显示红霉素和阿奇霉素均能导致肝细胞脂肪堆积,并呈剂量依赖性;qRT-PCR结果显示红霉素和阿奇霉素均能影响脂肪肝、肝纤维化和细胞凋亡相关基因的表达。结论红霉素和阿奇霉素均能诱导斑马鱼肝毒性,作用机制可能与两者诱导肝细胞变性或凋亡有关,但两者影响的相关基因通路可能有所不同。 展开更多
关键词 红霉素 阿奇霉素 斑马鱼 肝毒性
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广西红树林根际土壤放线菌的原位培养分离及其活性筛选 被引量:14
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作者 姜明国 甘光华 +6 位作者 杨立芳 李西妮 杨桂柳 庹利 孙承航 黄玲 蓝金枝 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期55-64,共10页
为了发掘广西红树林根际土壤的放线菌资源,本文利用原位培养装置,埋于根际土壤中俘获放线菌,30d后取回实验室,采用平板涂布法对4个地点的原位培养样品于15种培养基上进行分离纯化;对分离株基于16SrRNA基因序列进行系统发育分析;进一步... 为了发掘广西红树林根际土壤的放线菌资源,本文利用原位培养装置,埋于根际土壤中俘获放线菌,30d后取回实验室,采用平板涂布法对4个地点的原位培养样品于15种培养基上进行分离纯化;对分离株基于16SrRNA基因序列进行系统发育分析;进一步进行抗菌活性和产酶活性检测。共分离得到113株放线菌。对其中33株放线菌进行测序,结果表明20株属于链霉菌属,11株属于拟诺卡氏菌属,1株属于伦兹氏菌属,1株与拟诺卡氏菌属相似性最高为90%,很可能属于放线菌一个新属。抗菌实验结果显示其中有7株、4株、18株、6株、10株、3株实验菌株分别对大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、普通变形杆菌、乙型溶血性链球菌和肺炎克雷伯氏菌具有抑制作用;有55株、62株、24株、72株的实验菌株分别具有纤维素酶活性、淀粉酶活性、胶原蛋白酶活性、酯酶活性。原位培养可以丰富对广西红树林根际土壤的认识,分离到了新种甚至可能是新属的放线菌,分离得到的部分放线菌菌株具有较高生物活性,为后续工作提供了良好的实验材料。 展开更多
关键词 原位培养 红树林 根际土壤 放线菌 生物活性
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土壤宏基因组文库的构建及格尔德霉素类PKS基因的初步筛选 被引量:5
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作者 林灵 陈菲菲 +2 位作者 王以光 赫卫清 王相晶 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期426-430,共5页
目的构建土壤宏基因组文库并对格尔德霉素类I型聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因进行初步筛选研究。方法直接提取土壤样品中宏基因组DNA,以Fosmid为载体,构建宏基因组文库。根据格尔德霉素的I型PKS基因的保守序列设计引物,使用菌... 目的构建土壤宏基因组文库并对格尔德霉素类I型聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因进行初步筛选研究。方法直接提取土壤样品中宏基因组DNA,以Fosmid为载体,构建宏基因组文库。根据格尔德霉素的I型PKS基因的保守序列设计引物,使用菌落PCR方法直接筛选所获得的宏基因组文库。结果成功构建了土壤宏基因组文库,获得约6800个克隆子,其平均插入片段在25kb以上,覆盖至少170Mb的基因组信息。通过PKS基因筛选,获得了新的PKS基因片段。结论本文报道了土壤宏基因组文库的成功构建,并为利用宏基因组技术寻找新的聚酮类次级代谢产物的生物合成基因,以便于其异源表达或组合生物合成新的聚酮类次级代谢产物奠定基础。 展开更多
关键词 宏基因组文库 PKS 土壤
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海洋细菌中活性化合物的筛选策略(英文) 被引量:1
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作者 陈菲菲 林灵 +4 位作者 王以光 周红霞 陶佩珍 赫卫清 王勇 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期321-330,共10页
目的从700多株海洋沉积物分离得到的细菌中筛选安莎类抗生素和6-脱氧己糖(6DOH)糖基化修饰的次级代谢产物产生菌。方法以3-氨基-5-羟基苯甲酸(AHBA)合酶基因和dTDP-葡萄糖-4,6-脱水酶基因为靶标,分别进行安莎类抗生素和6DOH糖基化修饰... 目的从700多株海洋沉积物分离得到的细菌中筛选安莎类抗生素和6-脱氧己糖(6DOH)糖基化修饰的次级代谢产物产生菌。方法以3-氨基-5-羟基苯甲酸(AHBA)合酶基因和dTDP-葡萄糖-4,6-脱水酶基因为靶标,分别进行安莎类抗生素和6DOH糖基化修饰的次级代谢产物产生菌的分子筛选。对AHBA合酶及dTDP-葡萄糖-4,6-脱水酶基因阳性的菌株发酵液及提取物进行抗菌、抗肿瘤、抗病毒活性分析。采用利福霉素抗性及氢氧化钠显色初步鉴定安莎类化合物;采用α-萘酚硫酸显色初步鉴定6DOH糖基化修饰的化合物。利用16S rRNA序列对部分阳性菌株进行系统发育分析。结果共获得39株AHBA合酶基因阳性和10株dTDP-葡萄糖-4,6-脱水酶基因阳性菌株。阳性菌株中,78%具有不同程度的生物活性。化学初步鉴定结果表明:49%的AHBA合酶基因阳性菌株产生安莎类化合物;50%的dTDP-葡萄糖-4,6-脱水酶基因阳性菌株产生6DOH糖基化修饰的化合物。系统发育分析表明,大多数阳性菌株属于放线菌中的链霉菌属。结论基因探针筛选可作为一种合理、有效的方法从海洋细菌中发现活性代谢产物。 展开更多
关键词 海洋细菌 基因探针筛选 安莎类抗生素 6-脱氧己糖(6DOH)糖基化修饰的化合物 生物活性
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榴菌素产生菌——链霉菌CPCC 200532中fogacin的分离鉴定
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作者 江冰娅 赵薇 +6 位作者 李书芬 孙桂芝 武临专 刘红宇 余利岩 山广志 左利民 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期913-917,共5页
目的对Streptomyces sp.CPCC 200532产生的榴菌素类似物进行分离鉴定。方法 Streptomyces sp.CPCC 200532发酵培养物经乙酸乙酯萃取后,用硅胶板薄层色谱和高效液相色谱对萃取物进行分析;通过质谱和NMR等对榴菌素类似物进行结构鉴定。结... 目的对Streptomyces sp.CPCC 200532产生的榴菌素类似物进行分离鉴定。方法 Streptomyces sp.CPCC 200532发酵培养物经乙酸乙酯萃取后,用硅胶板薄层色谱和高效液相色谱对萃取物进行分析;通过质谱和NMR等对榴菌素类似物进行结构鉴定。结果从Streptomyces sp.CPCC 200532中发现了一个榴菌素类似物,结构与fogacin一致。结论从榴菌素产生菌中首次分离得到化合物fogacin;与榴菌素A相比,fogacin显示微弱的抗枯草芽孢杆菌和白色念珠菌活性。 展开更多
关键词 STREPTOMYCES sp.CPCC 200532 榴菌素 Fogacin
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人类免疫缺陷病毒初始传播病毒的鉴别及其表型特征
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作者 赵建元 丁寄葳 +2 位作者 米泽云 魏涛 岑山 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期419-425,共7页
人类免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)简称艾滋病病毒,在粘膜传播过程中,病毒的遗传多样性是显著减少的。绝大多数的HIV-1粘膜感染由一个或者少数几个病毒建立并最终发展为系统感染,上述病毒称为初始传播病毒(T... 人类免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)简称艾滋病病毒,在粘膜传播过程中,病毒的遗传多样性是显著减少的。绝大多数的HIV-1粘膜感染由一个或者少数几个病毒建立并最终发展为系统感染,上述病毒称为初始传播病毒(Transmitted/founder virus,T/F virus)。通过对初始传播病毒表型特征的研究,可进一步了解病毒在新宿主体内成功复制的关键特性,为艾滋病疫苗的发展、暴露前预防及其他治疗性干预措施提供更好的策略。文章综述了初始传播病毒的发现、进化特征以及感染后初期宿主的免疫反应等,以期为深入研究初始传播病毒的特征提供理论基础。 展开更多
关键词 人类获得性免疫缺损病毒 病毒传播 急性感染期 初始传播病毒
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利用强启动子PermE^*提高4"-异戊酰基转移酶基因在变铅青链霉菌TK24中对螺旋霉素的4"-异戊酰化水平 被引量:8
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作者 杨永红 赫卫清 +4 位作者 李瑞芬 戴剑漉 杨劭 王以光 武临专 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期826-830,共5页
目的提高螺旋霉素生物转化为4"-异戊酰螺旋霉素的水平,为构建以4"-异戊酰螺旋霉素为主要组分的必特螺旋霉素新一代基因工程菌提供指导。方法构建重组质粒pKC1139-e-ist-ist和pKC1139-ist-ist,它们分别含有5'-上游插入红... 目的提高螺旋霉素生物转化为4"-异戊酰螺旋霉素的水平,为构建以4"-异戊酰螺旋霉素为主要组分的必特螺旋霉素新一代基因工程菌提供指导。方法构建重组质粒pKC1139-e-ist-ist和pKC1139-ist-ist,它们分别含有5'-上游插入红霉素抗性基因强启动子PermE*的4"-异戊酰基转移酶基因串连双拷贝,和4"-异戊酰基转移酶基因串连双拷贝;将它们分别导入到变铅青链霉菌TK24中,比较它们对螺旋霉素的4"-异戊酰化能力。结果在加入终浓度为50μg/mL螺旋霉素时,变铅青链霉菌TK24[pKC1139-e-ist-ist]比变铅青链霉菌TK24[pKC1139-ist-ist]对螺旋霉素的4"-异戊酰化水平提高近4倍。结论在变铅青链霉菌TK24中,PermE*可以增强4"-异戊酰基转移酶基因表达,明显提高对螺旋霉素的4"-异戊酰化水平。 展开更多
关键词 螺旋霉素 4"-异戊酰基转移酶基因 变铅青链霉菌TK24 PermE* 生物转化 必特螺旋霉素
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珍贵束丝放线菌固体发酵生产安丝菌素及安丝菌素P-0制备 被引量:3
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作者 南艳妮 白晓光 +3 位作者 孙桂芝 许乐幸 王玉成 武临专 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期241-244,273,共5页
目的获得安丝菌素及安丝菌素P-0纯品。方法珍贵束丝放线菌ATCC 31565经固体发酵培养,培养物乙酸乙酯萃取、硅胶柱层析后得到安丝菌素P-2、P-3和P-4混合物。安丝菌素混合物经化学法脱去C-3酰基侧链,采用制备型HPLC获得安丝菌素P-0纯品。... 目的获得安丝菌素及安丝菌素P-0纯品。方法珍贵束丝放线菌ATCC 31565经固体发酵培养,培养物乙酸乙酯萃取、硅胶柱层析后得到安丝菌素P-2、P-3和P-4混合物。安丝菌素混合物经化学法脱去C-3酰基侧链,采用制备型HPLC获得安丝菌素P-0纯品。结果每升固体发酵培养基可获得安丝菌素P-2、P-3和P-4混合物(98±2)mg(纯度85%)。50mg该安丝菌素样品可获得安丝菌素P-0纯品约31mg(纯度大于99%),产率约82%。结论将安丝菌素固体发酵培养与提取、去酰基化和HPLC纯化相结合,建立了一套安丝菌素P-0纯品的实验室制备工艺。 展开更多
关键词 安丝菌素P-0 珍贵束丝放线菌ATCC31565 固体发酵
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阿奇霉素及其杂质J对斑马鱼毒性的转录组学分析 被引量:2
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作者 陈宁 黄权华 +2 位作者 苏军权 张苗青 张靖溥 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期241-244,共4页
目的 阿奇霉素在酸中的主要降解产物为3’-去克拉定糖阿奇霉素(杂质J)。本研究旨在利用模式动物斑马鱼,比较阿奇霉素及其杂质J体内诱导的毒性反应差异。方法 斑马鱼幼鱼(3 dpf)给予不同浓度的阿奇霉素和杂质J,3 d后,计算并比较两种化合... 目的 阿奇霉素在酸中的主要降解产物为3’-去克拉定糖阿奇霉素(杂质J)。本研究旨在利用模式动物斑马鱼,比较阿奇霉素及其杂质J体内诱导的毒性反应差异。方法 斑马鱼幼鱼(3 dpf)给予不同浓度的阿奇霉素和杂质J,3 d后,计算并比较两种化合物的LD;和LD;利用转录组学分析,比较阿奇霉素和杂质J导致机体表达谱的变化,并寻找显著性差异基因(DEGs);通过基因本体(GO)数据库对显著性差异基因进行功能归类分析,比较两种化合物对体内生物过程影响的可能差异。结果 阿奇霉素和杂质J对斑马鱼的致死作用相似;二者均可导致幼鱼基因表达谱发生明显改变,但在转录水平可调节的DEGs个数不同;阿奇霉素单独调节的DEGs(ctsc、gnpda、gck和tmem127),在显著差异性GO生物过程(变化倍数> 3,P<0.05)中,主要归类于调控与代谢相关和细胞生长相关的生物过程,而杂质J单独调节的DEGs(cxcl8b.1)在显著差异性GO生物过程中,归类于与免疫调控相关的生物过程;qRT-PCR结果显示验证了阿奇霉素单独调节的ctsc、gnpda、gck和tmem127基因以及杂质J单独调节的cxcl8b.1基因的表达变化与RNA-seq测序结果相似。结论 阿奇霉素和杂质J诱导斑马鱼幼鱼毒性反应的作用机制可能有所不同,为进一步探讨阿奇霉素在临床应用中产生不良反应的机制明确了方向。 展开更多
关键词 阿奇霉素 杂质J 斑马鱼 毒性 转录组学分析
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