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茶树休眠芽与萌动芽抑制消减杂交文库的构建与初步分析
被引量：
14
1
作者
王新超
杨亚军
+2 位作者
陈亮
马春雷
姚明哲
《茶叶科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期129-135,共7页
为了解茶树越冬芽休眠及其解除的分子机理,以休眠芽和萌动芽为材料,构建了茶树休眠芽与萌发芽的正、反向抑制消减杂交文库,并从两个文库各随机挑选96个阳性克隆进行序列测定和生物信息学分析。建库质量分析结果表明,所构建的正、反向消...
为了解茶树越冬芽休眠及其解除的分子机理,以休眠芽和萌动芽为材料,构建了茶树休眠芽与萌发芽的正、反向抑制消减杂交文库,并从两个文库各随机挑选96个阳性克隆进行序列测定和生物信息学分析。建库质量分析结果表明,所构建的正、反向消减文库有效富集了差异基因,消减效率达到要求,插入片段集中于250-750bp之间,文库质量较好。对正、反向文库随机挑选的阳性克隆测序和分析结果表明,正、反向文库在基因表达谱上存在一定的差异,萌动芽文库在亚细胞器形成、转运载体等方面的基因与休眠芽文库有较大差异,而休眠芽文库在抗氧化、翻译调控以及胁迫响应等方面的基因与萌动芽文库有较大差异。这两个文库的建立为进一步了解茶树芽休眠与解除的分子机制奠定了基础。
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关键词
茶树(Camellia
sinensis)
芽休眠
表达序列标签
抑制消减杂交
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职称材料
茶树生长素抑制蛋白基因CsARP1的克隆与表达分析
被引量：
9
2
作者
王新超
马春雷
+2 位作者
杨亚军
姚明哲
金基强
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期910-915,921,共7页
从茶树休眠芽抑制消减杂交文库中分离得到生长素抑制蛋白基因的3'-片段,以休眠芽为材料,利用RACE技术克隆了其cDNA全长,并利用荧光定量PCR研究了该基因在不同休眠阶段芽的相对表达量。结果从茶树休眠芽中获得一个全长为711bp的生长...
从茶树休眠芽抑制消减杂交文库中分离得到生长素抑制蛋白基因的3'-片段,以休眠芽为材料,利用RACE技术克隆了其cDNA全长,并利用荧光定量PCR研究了该基因在不同休眠阶段芽的相对表达量。结果从茶树休眠芽中获得一个全长为711bp的生长素抑制蛋白基因CsARP1(GenBank登录号为HQ225758)。该基因开放阅读框为357bp,编码118个氨基酸,推测的蛋白质分子量为12.82KD,等电点约为9.57。多序列比对结果显示,该基因编码的氨基酸序列与其他植物的ARP蛋白序列相似性达到70%以上,具有生长素抑制基因家族的保守结构域。荧光定量PCR结果表明,CsARP1基因在休眠阶段表达量较高,而在解除休眠(萌发)后表达量较低,说明CsARP1基因可能与茶树芽休眠有关。
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关键词
茶树
生长素抑制蛋白基因CsARP1
RACE
序列分析
实时荧光定量PCR
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职称材料
题名
茶树休眠芽与萌动芽抑制消减杂交文库的构建与初步分析
被引量：
14
1
作者
王新超
杨亚军
陈亮
马春雷
姚明哲
机构
中国农业科学院茶叶研究所茶树资源和改良研究中心/国家茶树改良中心
中国农业科学院
研究
生院
出处
《茶叶科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期129-135,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30872059)
现代农业(茶叶)产业技术体系项目
文摘
为了解茶树越冬芽休眠及其解除的分子机理,以休眠芽和萌动芽为材料,构建了茶树休眠芽与萌发芽的正、反向抑制消减杂交文库,并从两个文库各随机挑选96个阳性克隆进行序列测定和生物信息学分析。建库质量分析结果表明,所构建的正、反向消减文库有效富集了差异基因,消减效率达到要求,插入片段集中于250-750bp之间,文库质量较好。对正、反向文库随机挑选的阳性克隆测序和分析结果表明,正、反向文库在基因表达谱上存在一定的差异,萌动芽文库在亚细胞器形成、转运载体等方面的基因与休眠芽文库有较大差异,而休眠芽文库在抗氧化、翻译调控以及胁迫响应等方面的基因与萌动芽文库有较大差异。这两个文库的建立为进一步了解茶树芽休眠与解除的分子机制奠定了基础。
关键词
茶树(Camellia
sinensis)
芽休眠
表达序列标签
抑制消减杂交
Keywords
tea plant （Camellia sinensis）
bud dormancy
expressed sequence tag （EST）
suppression subtractive hybridization （SSH）
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
Q507 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
茶树生长素抑制蛋白基因CsARP1的克隆与表达分析
被引量：
9
2
作者
王新超
马春雷
杨亚军
姚明哲
金基强
机构
中国农业科学院茶叶研究所茶树资源和改良研究中心/国家茶树改良中心
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期910-915,921,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30872059)
现代农业(茶叶)产业技术体系项目(CARS-23)
文摘
从茶树休眠芽抑制消减杂交文库中分离得到生长素抑制蛋白基因的3'-片段,以休眠芽为材料,利用RACE技术克隆了其cDNA全长,并利用荧光定量PCR研究了该基因在不同休眠阶段芽的相对表达量。结果从茶树休眠芽中获得一个全长为711bp的生长素抑制蛋白基因CsARP1(GenBank登录号为HQ225758)。该基因开放阅读框为357bp,编码118个氨基酸,推测的蛋白质分子量为12.82KD,等电点约为9.57。多序列比对结果显示,该基因编码的氨基酸序列与其他植物的ARP蛋白序列相似性达到70%以上,具有生长素抑制基因家族的保守结构域。荧光定量PCR结果表明,CsARP1基因在休眠阶段表达量较高,而在解除休眠(萌发)后表达量较低,说明CsARP1基因可能与茶树芽休眠有关。
关键词
茶树
生长素抑制蛋白基因CsARP1
RACE
序列分析
实时荧光定量PCR
Keywords
tea plant（Camellia sinensis）
auxin-repressed protein gene（CsARP1）
RACE
sequence analysis
real-time fluorescence quantitative PCR
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
茶树休眠芽与萌动芽抑制消减杂交文库的构建与初步分析
王新超
杨亚军
陈亮
马春雷
姚明哲
《茶叶科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
14
在线阅读
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职称材料
2
茶树生长素抑制蛋白基因CsARP1的克隆与表达分析
王新超
马春雷
杨亚军
姚明哲
金基强
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
9
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职称材料
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