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宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析
被引量:
20
1
作者
陈明辉
张保青
+4 位作者
宋修鹏
陈虎
杨丽涛
李杨瑞
陈保善
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期1119-1126,共8页
宿根矮化病是危害严重的世界性甘蔗主要病害之一,为了探究甘蔗在该病胁迫下的抗病分子机制,本研究以甘蔗品种新台糖22健康植株为材料,利用含有宿根矮化病病原菌的蔗汁诱导其抗性,分别在接种后2、4、6、8和10d取样,构建宿根矮化病...
宿根矮化病是危害严重的世界性甘蔗主要病害之一,为了探究甘蔗在该病胁迫下的抗病分子机制,本研究以甘蔗品种新台糖22健康植株为材料,利用含有宿根矮化病病原菌的蔗汁诱导其抗性,分别在接种后2、4、6、8和10d取样,构建宿根矮化病侵染处理与对照的RNA混合池,利用cDNA-SCoT法进行差异显示研究。结果表明,80条SCoT引物扩增出500多条带,长度在100~1800bp之间。从中筛选出30个差异明显的条带,测序后序列拼接,获得22条高质量的EST序列。生物信息学分析显示,对甘蔗宿根矮化病的差异基因主要涉及能量代谢、防卫反应、信号转导、蛋白质类代谢等方面。进一步基因功能分析显示,油菜素内酯合成蛋白、NBS-LRR类抗性蛋白、茉莉酸诱导蛋白、α-微管蛋白、ABA胁迫成熟蛋白、富含脯氨酸蛋白、翻译起始因子eif-2b α亚族等可能参与了甘蔗宿根矮化病病原菌互作的过程。
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关键词
甘蔗
宿根矮化病
cDNA-SCoT
差异基因
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职称材料
题名
宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析
被引量:
20
1
作者
陈明辉
张保青
宋修鹏
陈虎
杨丽涛
李杨瑞
陈保善
机构
广西
大学/亚热带
农业
生物
资源保护与利用国家
重点
实验室
广西
林业
科学院
中国农业科学院甘蔗研究中心/广西农业科学院甘蔗研究所/广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期1119-1126,共8页
基金
广西自然科学基金重点项目(2012GXNSFDA053011)
广西自然科学基金创新团队项目(2011GXNSFF018002)
+4 种基金
广西自然科学基金重点项目(2012GXNSFDA053)
广西壮族自治区主席科技资金项目(11166-02)
科技部国际合作项目(2008DFA30600,2009DFA30820和2013DFA31600)
广西农业科学院创新团队项目(桂农科2011YT01)
广西科学研究与技术开发计划项目(桂科产1123008-1和桂科能0815011)资助
文摘
宿根矮化病是危害严重的世界性甘蔗主要病害之一,为了探究甘蔗在该病胁迫下的抗病分子机制,本研究以甘蔗品种新台糖22健康植株为材料,利用含有宿根矮化病病原菌的蔗汁诱导其抗性,分别在接种后2、4、6、8和10d取样,构建宿根矮化病侵染处理与对照的RNA混合池,利用cDNA-SCoT法进行差异显示研究。结果表明,80条SCoT引物扩增出500多条带,长度在100~1800bp之间。从中筛选出30个差异明显的条带,测序后序列拼接,获得22条高质量的EST序列。生物信息学分析显示,对甘蔗宿根矮化病的差异基因主要涉及能量代谢、防卫反应、信号转导、蛋白质类代谢等方面。进一步基因功能分析显示,油菜素内酯合成蛋白、NBS-LRR类抗性蛋白、茉莉酸诱导蛋白、α-微管蛋白、ABA胁迫成熟蛋白、富含脯氨酸蛋白、翻译起始因子eif-2b α亚族等可能参与了甘蔗宿根矮化病病原菌互作的过程。
关键词
甘蔗
宿根矮化病
cDNA-SCoT
差异基因
Keywords
Sugarcane
Ratoon stunting disease
cDNA-SCoT
Differential genes
分类号
S435.661 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析
陈明辉
张保青
宋修鹏
陈虎
杨丽涛
李杨瑞
陈保善
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
20
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