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我国部分蓖麻品种遗传资源SSR分析及DNA指纹图谱
被引量：
11
1
作者
薛建峰
谭美莲
+4 位作者
严明芳
汪磊
傅春玲
王力军
严兴初
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期48-54,共7页
为了解蓖麻品种间的遗传多样性、构建指纹图谱,利用171对SSR及EST-SSR引物对30份国内蓖麻品种和1份法国品种进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明蓖麻品种间呈中度多态性,平均每位点有2.267个等位基因数,香农指数、期望杂合度和多态...
为了解蓖麻品种间的遗传多样性、构建指纹图谱,利用171对SSR及EST-SSR引物对30份国内蓖麻品种和1份法国品种进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明蓖麻品种间呈中度多态性,平均每位点有2.267个等位基因数,香农指数、期望杂合度和多态性信息含量(PIC)分别为0.553、0.347和0.289。聚类分析显示在相似系数0.730处将31份蓖麻品种分为7个类群,来源于相同育种单位或相同省区的大部分品种聚在一起。另外,利用10对扩增清晰、多态性好的引物构建了31份蓖麻品种的指纹图谱,可用于品种鉴别。
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关键词
蓖麻
SSR分子标记
指纹图谱
遗传多样性
亲缘关系
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职称材料
甘蓝型油菜分枝数QTL定位及其候选基因预测
被引量：
7
2
作者
张凤启
程晓辉
+5 位作者
刘越英
童超波
董彩华
于景印
黄军艳
刘胜毅
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期15-20,共6页
分枝数是影响油菜产量的重要株型性状之一.为了有助于油菜分枝数的分子标记辅助育种,以甘蓝型油菜品系888-5（多分枝）和M083（少分枝）杂交形成的重组自交系（RIL）群体为材料,通过利用第一张油菜60KSNP芯片对群体进行高通量SNP分型,...
分枝数是影响油菜产量的重要株型性状之一.为了有助于油菜分枝数的分子标记辅助育种,以甘蓝型油菜品系888-5（多分枝）和M083（少分枝）杂交形成的重组自交系（RIL）群体为材料,通过利用第一张油菜60KSNP芯片对群体进行高通量SNP分型,并结合单环境和多环境2种QTL检测方法对RIL群体在4个环境（武汉-2012、武汉-2013、扬州-2012和扬州-2013）下分枝数进行QTL定位.结果表明：共检测出18个分枝数QTL,分布于A2、A6、A7、C1和C4连锁群.其中11个QTL在2个以上环境下可重复检测到;有2个QTL与环境之间存在互作效应.主效QTL2个（qBN2-3和qBNE2-1）,分别在3个、4个环境下重复检测到,可解释的表型变异为13.12% ～20.60%,2.80% ～30.10%.qBNE2-1与环境存在互作效应.另外,通过利用SNP标记侧翼序列和油菜基因组比对作图,从3个QTL（qBN2-1、qBN7-6和qBN7-8,三者可解释的表型变异分别为19.40% ～17.30%、5.70% ～12.21%和7.88% ～10.32%）的基因组区段内（分别为279kb、165kb和562kb）共筛选出4个与分枝数有关的候选基因,它们的拟南芥同源基因（分别为CUC2、PIN3、F23N20.8和PIN4）均参与拟南芥分枝数的分化或形态建成.
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关键词
甘蓝型油菜
SNP标记
分枝数
QTL定位
油菜60KSNP芯片
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职称材料
题名
我国部分蓖麻品种遗传资源SSR分析及DNA指纹图谱
被引量：
11
1
作者
薛建峰
谭美莲
严明芳
汪磊
傅春玲
王力军
严兴初
机构
中国农业科学院油料作物研究所、农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期48-54,共7页
基金
国家自然科学基金(31271765)
中国农业科学院油料作物研究所所长基金(1610172011009)
+1 种基金
国家自然科学基金(31000726)
农业部公益性行业(农业)科研专项(201003057)
文摘
为了解蓖麻品种间的遗传多样性、构建指纹图谱,利用171对SSR及EST-SSR引物对30份国内蓖麻品种和1份法国品种进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明蓖麻品种间呈中度多态性,平均每位点有2.267个等位基因数,香农指数、期望杂合度和多态性信息含量(PIC)分别为0.553、0.347和0.289。聚类分析显示在相似系数0.730处将31份蓖麻品种分为7个类群,来源于相同育种单位或相同省区的大部分品种聚在一起。另外,利用10对扩增清晰、多态性好的引物构建了31份蓖麻品种的指纹图谱,可用于品种鉴别。
关键词
蓖麻
SSR分子标记
指纹图谱
遗传多样性
亲缘关系
Keywords
Ricinus communis L.
SSR molecular marker
Fingerprint
Genetic diversity
Phylogenetic rela-tionship
分类号
S565.603 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
甘蓝型油菜分枝数QTL定位及其候选基因预测
被引量：
7
2
作者
张凤启
程晓辉
刘越英
童超波
董彩华
于景印
黄军艳
刘胜毅
机构
中国农业科学院油料作物研究所、农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室
湖北大学、
生物
资源绿色转化湖北省协同创新中心
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期15-20,共6页
基金
国家973计划(2011CB109305)
国家863计划(2013AA102602)
+1 种基金
国家自然科学基金(31471536、31301039)
湖北农业科技创新中心
文摘
分枝数是影响油菜产量的重要株型性状之一.为了有助于油菜分枝数的分子标记辅助育种,以甘蓝型油菜品系888-5（多分枝）和M083（少分枝）杂交形成的重组自交系（RIL）群体为材料,通过利用第一张油菜60KSNP芯片对群体进行高通量SNP分型,并结合单环境和多环境2种QTL检测方法对RIL群体在4个环境（武汉-2012、武汉-2013、扬州-2012和扬州-2013）下分枝数进行QTL定位.结果表明：共检测出18个分枝数QTL,分布于A2、A6、A7、C1和C4连锁群.其中11个QTL在2个以上环境下可重复检测到;有2个QTL与环境之间存在互作效应.主效QTL2个（qBN2-3和qBNE2-1）,分别在3个、4个环境下重复检测到,可解释的表型变异为13.12% ～20.60%,2.80% ～30.10%.qBNE2-1与环境存在互作效应.另外,通过利用SNP标记侧翼序列和油菜基因组比对作图,从3个QTL（qBN2-1、qBN7-6和qBN7-8,三者可解释的表型变异分别为19.40% ～17.30%、5.70% ～12.21%和7.88% ～10.32%）的基因组区段内（分别为279kb、165kb和562kb）共筛选出4个与分枝数有关的候选基因,它们的拟南芥同源基因（分别为CUC2、PIN3、F23N20.8和PIN4）均参与拟南芥分枝数的分化或形态建成.
关键词
甘蓝型油菜
SNP标记
分枝数
QTL定位
油菜60KSNP芯片
Keywords
Brassica napus
SNP marker
Branch number
QTL mapping
Brassica 60K SNP array
分类号
S565.403 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
我国部分蓖麻品种遗传资源SSR分析及DNA指纹图谱
薛建峰
谭美莲
严明芳
汪磊
傅春玲
王力军
严兴初
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
11
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
甘蓝型油菜分枝数QTL定位及其候选基因预测
张凤启
程晓辉
刘越英
童超波
董彩华
于景印
黄军艳
刘胜毅
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
7
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