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中国花生核心种质中高油酸材料的分布和遗传多样性
被引量:
19
1
作者
任小平
廖伯寿
+5 位作者
张晓杰
雷永
黄家权
晏立英
陈玉宁
姜慧芳
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期513-518,共6页
利用代表花生基础资源的核心种质分析花生高油酸资源的分布和遗传多样性,结果表明:在花生核心种质中油酸含量高于57%的种质40份,主要分布在密枝亚种(普通型25份和龙生型8份),少数分布在疏枝亚种(珍珠豆型6份和中间型1份);除了10份资源...
利用代表花生基础资源的核心种质分析花生高油酸资源的分布和遗传多样性,结果表明:在花生核心种质中油酸含量高于57%的种质40份,主要分布在密枝亚种(普通型25份和龙生型8份),少数分布在疏枝亚种(珍珠豆型6份和中间型1份);除了10份资源来源于国外(ICR ISAT 7份,美国1份,日本1份和韩国1份),其他种质资源来源于中国12个省市。同时发现高油酸种质中3份资源的粗脂肪在55%左右,分别是Zh.h4094(油酸66.70%,粗脂肪54.99%),Zh.h4029(油酸63.50%,粗脂肪55.58%)和Zh.h4319(油酸59.70%,粗脂肪56.04%);基于植物学和产量性状分析,前5个主成份(PC)可以解释81.17%的变异。聚类分析表明,在阈值为0.1942时,可分为8个组。因此中国花生核心种质中高油酸种质存在丰富的遗传多样性,而且分布较广,高油酸种质的获得为花生高油酸育种提供基础材料。
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关键词
花生
核心种质
高油酸
遗传多样性
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职称材料
水培条件下花生对缺铁的生理反应
被引量:
10
2
作者
任小平
姜慧芳
+2 位作者
黄家权
张晓杰
廖伯寿
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期491-497,共7页
通过对5份花生(中国3份和印度2份)种质资源在水培缺铁条件下各种生理性状的研究,明确花生耐铁的生理或农艺指标,为花生耐缺铁种质资源的筛选和利用提供理论和实践依据。结果表明,缺铁明显影响品种(中花5号、远杂9102和ICG 11855)的生物...
通过对5份花生(中国3份和印度2份)种质资源在水培缺铁条件下各种生理性状的研究,明确花生耐铁的生理或农艺指标,为花生耐缺铁种质资源的筛选和利用提供理论和实践依据。结果表明,缺铁明显影响品种(中花5号、远杂9102和ICG 11855)的生物产量;7d内中花8号、远杂9102和ICG 12672培养液的pH值下降3个单位,而中花5号和ICG11855仅下降2个单位。缺铁处理25d后,中花5号、远杂9102和ICG 11855幼叶的叶绿素含量、SOD、POD和CAT活性下降非常明显,而中花8号和ICG 12672幼叶的叶绿素含量、SOD、POD和CAT活性基本维持不变,这说明缺铁对中花8号和ICG 12672的叶绿素含量降低和细胞膜伤害较小。从膜氧化产物MDA的变化值也印证了缺铁对中花8号和ICG 12672的细胞膜伤害较小。综上所述,认为中花8号和ICG 12672对缺铁不敏感,而中花5号、远杂9102和ICG 11855对铁敏感,同时表明利用水培技术研究花生耐铁是一种简单有效的方法。根据相关分析,选择缺铁处理25 d后的叶绿素含量作为耐缺铁筛选的指标。
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关键词
花生
缺铁
生理性状
水培
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职称材料
青枯菌诱导的花生基因表达谱SSH分析
被引量:
6
3
作者
吕建伟
姜慧芳
+3 位作者
黄家权
彭文舫
陈玉宁
李正强
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1517-1523,共7页
以抗青枯病花生种质‘J4’和‘中花6号’、感青枯病花生品种‘中花12号’为材料,用强产青枯菌毒菌株(Ralstonia solanacearum)对其根系分别接种,采用抑制差减杂交(SSH)技术检测花生根系应答侵染的基因表达谱变化,并对文库中差异基因进行...
以抗青枯病花生种质‘J4’和‘中花6号’、感青枯病花生品种‘中花12号’为材料,用强产青枯菌毒菌株(Ralstonia solanacearum)对其根系分别接种,采用抑制差减杂交(SSH)技术检测花生根系应答侵染的基因表达谱变化,并对文库中差异基因进行Real-time PCR分析。结果表明:经菌液PCR检测对挑选出的1 036阳性克隆片段进行测序及片段整合分析,获得162条花生基因,有功能注释的基因58条,其中44条基因参与了细胞结构(6%)、信号转导(12%)、抗病防御(5%)、转录调控(12%)等生理过程。用Real-time PCR技术对7个基因在‘中花6号’和‘中花12号’中的表达模式分析结果表明,6个基因在青枯菌侵染早期在抗病材料‘中花6号’中呈上调表达,可能与青枯病抗性直接相关。
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关键词
花生
青枯菌
SSH文库
RT-PCR
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职称材料
Ac/Ds系统及其在油菜突变体库构建中的应用策略
被引量:
4
4
作者
洪林
闫晓红
+1 位作者
刘正富
魏文辉
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期738-743,共6页
随着油菜基因组测序工作的完成和后续完善,油菜功能基因组学必将成为研究热点,如何构建高通量的突变体库则是影响其进展的关键。Ac/Ds(Activator/Dissociation)系统是构建插入型突变体库的理想技术,在水稻(Oryza Sativa)、拟南芥(Arabid...
随着油菜基因组测序工作的完成和后续完善,油菜功能基因组学必将成为研究热点,如何构建高通量的突变体库则是影响其进展的关键。Ac/Ds(Activator/Dissociation)系统是构建插入型突变体库的理想技术,在水稻(Oryza Sativa)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)等异源植物中应用较广,但在油菜中尚处于起步阶段。文章介绍了Ac/Ds系统的结构特点、转座机理等基本概况,阐述了利用Ac/Ds系统构建植物突变体库的优势及存在的问题。结合模式植物水稻和拟南芥的研究成果,进一步分析了利用Ac/Ds系统构建油菜突变体库的改进策略,并对其在油菜功能基因组研究中的应用前景进行了展望。
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关键词
油菜
Ac/Ds系统
突变体库
应用策略
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职称材料
高等植物基因克隆的策略
被引量:
2
5
作者
洪林
程昌凤
+2 位作者
魏文辉
陈霞
谭平
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2013年第4期914-920,共7页
基因克隆是进行植物基因功能研究的先决条件。随着拟南芥、水稻、杨树等植物全基因组序列的公布,标志着基因组进入后基因组研究时代是分子生物学发展的必然趋势,同时为进一步克隆植物中控制重要性状的主效基因提供强大的基因组数据支撑...
基因克隆是进行植物基因功能研究的先决条件。随着拟南芥、水稻、杨树等植物全基因组序列的公布,标志着基因组进入后基因组研究时代是分子生物学发展的必然趋势,同时为进一步克隆植物中控制重要性状的主效基因提供强大的基因组数据支撑。目前有较多的基因克隆传统及衍生技术,文章综述了图位克隆、同源克隆、转座子标记法、表达序列标签法、差异表达基因克隆等5种应用比较广泛的基因克隆技术,并就其发展方向和策略作了展望。
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关键词
植物
功能基因
克隆
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职称材料
甘蓝型油菜ADC基因片段的克隆及序列分析
被引量:
1
6
作者
洪林
闫晓红
+2 位作者
李晨
刘正富
魏文辉
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期135-140,共6页
【目的】克隆甘蓝型油菜精氨酸脱羧酶(ADC)基因的cDNA片段,为进一步获得ADC基因全长及研究其的生物学功能奠定基础。【方法】以甘蓝型油菜(Brassica napus L.)品种中双6号的花蕾为材料,设计简并引物,采用同源克隆法扩增ADC基因的cDNA片...
【目的】克隆甘蓝型油菜精氨酸脱羧酶(ADC)基因的cDNA片段,为进一步获得ADC基因全长及研究其的生物学功能奠定基础。【方法】以甘蓝型油菜(Brassica napus L.)品种中双6号的花蕾为材料,设计简并引物,采用同源克隆法扩增ADC基因的cDNA片段。【结果】成功扩增获得8个不同的ADC基因拷贝,按长度将其分为1011、999、981bp3类,8个拷贝核苷酸序列之间的同源性为81%~99%,其推导氨基酸序列之间的同源性为86%~99%。1011bp片段包含3种不同的序列S1~S3,序列间存在9个单核苷酸多态性(SNP)位点。999bp序列包含S4和S5,具有3个SNP位点,两个区段出现连续碱基缺失。981bp序列包含S6~S8,发现14个SNP位点,且第67位核苷酸出现无义突变,4个区段发生碱基缺失。序列S4~S8共同缺失第632~634、642~650位的核苷酸小片段。氨基酸同源比对和系统进化分析结果表明,8个不同ADC基因拷贝与芥菜(Brassica juncea L.)、拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)、盐芥(Thellungiella halophila L.)等物种的ADC基因同源性高,亲缘关系近。【结论】所获得的8个基因拷贝即为来自于甘蓝型油菜ADC基因的片段。
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关键词
甘蓝型油菜
精氨酸脱羧酶(ADC)基因
同源克隆
序列分析
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职称材料
题名
中国花生核心种质中高油酸材料的分布和遗传多样性
被引量:
19
1
作者
任小平
廖伯寿
张晓杰
雷永
黄家权
晏立英
陈玉宁
姜慧芳
机构
中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期513-518,共6页
基金
农作物种质资源保护项目(NB07-2130135-33.34)
植物种质资源平台项目(2005DKA21002-13
+3 种基金
2005DKA21001-20)
国家科技支撑计划(2006BAD13B05-2)
国家自然科学基金项目(30571132)
中国农业科学院所长基金项目(1610172011004)
文摘
利用代表花生基础资源的核心种质分析花生高油酸资源的分布和遗传多样性,结果表明:在花生核心种质中油酸含量高于57%的种质40份,主要分布在密枝亚种(普通型25份和龙生型8份),少数分布在疏枝亚种(珍珠豆型6份和中间型1份);除了10份资源来源于国外(ICR ISAT 7份,美国1份,日本1份和韩国1份),其他种质资源来源于中国12个省市。同时发现高油酸种质中3份资源的粗脂肪在55%左右,分别是Zh.h4094(油酸66.70%,粗脂肪54.99%),Zh.h4029(油酸63.50%,粗脂肪55.58%)和Zh.h4319(油酸59.70%,粗脂肪56.04%);基于植物学和产量性状分析,前5个主成份(PC)可以解释81.17%的变异。聚类分析表明,在阈值为0.1942时,可分为8个组。因此中国花生核心种质中高油酸种质存在丰富的遗传多样性,而且分布较广,高油酸种质的获得为花生高油酸育种提供基础材料。
关键词
花生
核心种质
高油酸
遗传多样性
Keywords
Peanut(Arachis Hypogaea L.)
Core collection
High oleic acid
Genetic diversity
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
水培条件下花生对缺铁的生理反应
被引量:
10
2
作者
任小平
姜慧芳
黄家权
张晓杰
廖伯寿
机构
中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期491-497,共7页
基金
植物种质资源平台项目(2005DKA21002-13)
国家自然科学基金(30571132)
+2 种基金
国家"863"项目(2006AA10A115)
国家科技支撑计划(2006BAD13B05-2)
农作物种质资源保护项目(NB07-2130135-35)
文摘
通过对5份花生(中国3份和印度2份)种质资源在水培缺铁条件下各种生理性状的研究,明确花生耐铁的生理或农艺指标,为花生耐缺铁种质资源的筛选和利用提供理论和实践依据。结果表明,缺铁明显影响品种(中花5号、远杂9102和ICG 11855)的生物产量;7d内中花8号、远杂9102和ICG 12672培养液的pH值下降3个单位,而中花5号和ICG11855仅下降2个单位。缺铁处理25d后,中花5号、远杂9102和ICG 11855幼叶的叶绿素含量、SOD、POD和CAT活性下降非常明显,而中花8号和ICG 12672幼叶的叶绿素含量、SOD、POD和CAT活性基本维持不变,这说明缺铁对中花8号和ICG 12672的叶绿素含量降低和细胞膜伤害较小。从膜氧化产物MDA的变化值也印证了缺铁对中花8号和ICG 12672的细胞膜伤害较小。综上所述,认为中花8号和ICG 12672对缺铁不敏感,而中花5号、远杂9102和ICG 11855对铁敏感,同时表明利用水培技术研究花生耐铁是一种简单有效的方法。根据相关分析,选择缺铁处理25 d后的叶绿素含量作为耐缺铁筛选的指标。
关键词
花生
缺铁
生理性状
水培
Keywords
Panut(Arachis hypogaea L.)
Iron deficiency
Physiological traits
Nutrient solutions
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
青枯菌诱导的花生基因表达谱SSH分析
被引量:
6
3
作者
吕建伟
姜慧芳
黄家权
彭文舫
陈玉宁
李正强
机构
中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室
贵州省农
作物
品种资源
研究所
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1517-1523,共7页
基金
国家公益性科研院所专项资金课题(2007-05)
文摘
以抗青枯病花生种质‘J4’和‘中花6号’、感青枯病花生品种‘中花12号’为材料,用强产青枯菌毒菌株(Ralstonia solanacearum)对其根系分别接种,采用抑制差减杂交(SSH)技术检测花生根系应答侵染的基因表达谱变化,并对文库中差异基因进行Real-time PCR分析。结果表明:经菌液PCR检测对挑选出的1 036阳性克隆片段进行测序及片段整合分析,获得162条花生基因,有功能注释的基因58条,其中44条基因参与了细胞结构(6%)、信号转导(12%)、抗病防御(5%)、转录调控(12%)等生理过程。用Real-time PCR技术对7个基因在‘中花6号’和‘中花12号’中的表达模式分析结果表明,6个基因在青枯菌侵染早期在抗病材料‘中花6号’中呈上调表达,可能与青枯病抗性直接相关。
关键词
花生
青枯菌
SSH文库
RT-PCR
Keywords
peanut
Ralstonia solanacearum
suppression subtractive hybridization(SSH)
real-time PCR
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
Ac/Ds系统及其在油菜突变体库构建中的应用策略
被引量:
4
4
作者
洪林
闫晓红
刘正富
魏文辉
机构
重庆市
农业
科学院
果树
研究所
中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期738-743,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30671312)
国家科技部科技支撑计划项目(2010GB2F100391)
文摘
随着油菜基因组测序工作的完成和后续完善,油菜功能基因组学必将成为研究热点,如何构建高通量的突变体库则是影响其进展的关键。Ac/Ds(Activator/Dissociation)系统是构建插入型突变体库的理想技术,在水稻(Oryza Sativa)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)等异源植物中应用较广,但在油菜中尚处于起步阶段。文章介绍了Ac/Ds系统的结构特点、转座机理等基本概况,阐述了利用Ac/Ds系统构建植物突变体库的优势及存在的问题。结合模式植物水稻和拟南芥的研究成果,进一步分析了利用Ac/Ds系统构建油菜突变体库的改进策略,并对其在油菜功能基因组研究中的应用前景进行了展望。
关键词
油菜
Ac/Ds系统
突变体库
应用策略
Keywords
rape
Ac/Ds system
mutants pool
application strategy
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
高等植物基因克隆的策略
被引量:
2
5
作者
洪林
程昌凤
魏文辉
陈霞
谭平
机构
重庆市
农业
科学院
果树
研究所
中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2013年第4期914-920,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(30671312)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(1610172008004)
文摘
基因克隆是进行植物基因功能研究的先决条件。随着拟南芥、水稻、杨树等植物全基因组序列的公布,标志着基因组进入后基因组研究时代是分子生物学发展的必然趋势,同时为进一步克隆植物中控制重要性状的主效基因提供强大的基因组数据支撑。目前有较多的基因克隆传统及衍生技术,文章综述了图位克隆、同源克隆、转座子标记法、表达序列标签法、差异表达基因克隆等5种应用比较广泛的基因克隆技术,并就其发展方向和策略作了展望。
关键词
植物
功能基因
克隆
Keywords
plant
functional gene
cloning
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
甘蓝型油菜ADC基因片段的克隆及序列分析
被引量:
1
6
作者
洪林
闫晓红
李晨
刘正富
魏文辉
机构
中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室
重庆市
农业
科学院
果树
研究所
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期135-140,共6页
基金
国家自然科学基金面上项目(30671312)
农业部油料作物生物学重点实验室开放课题项目(201004)
文摘
【目的】克隆甘蓝型油菜精氨酸脱羧酶(ADC)基因的cDNA片段,为进一步获得ADC基因全长及研究其的生物学功能奠定基础。【方法】以甘蓝型油菜(Brassica napus L.)品种中双6号的花蕾为材料,设计简并引物,采用同源克隆法扩增ADC基因的cDNA片段。【结果】成功扩增获得8个不同的ADC基因拷贝,按长度将其分为1011、999、981bp3类,8个拷贝核苷酸序列之间的同源性为81%~99%,其推导氨基酸序列之间的同源性为86%~99%。1011bp片段包含3种不同的序列S1~S3,序列间存在9个单核苷酸多态性(SNP)位点。999bp序列包含S4和S5,具有3个SNP位点,两个区段出现连续碱基缺失。981bp序列包含S6~S8,发现14个SNP位点,且第67位核苷酸出现无义突变,4个区段发生碱基缺失。序列S4~S8共同缺失第632~634、642~650位的核苷酸小片段。氨基酸同源比对和系统进化分析结果表明,8个不同ADC基因拷贝与芥菜(Brassica juncea L.)、拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)、盐芥(Thellungiella halophila L.)等物种的ADC基因同源性高,亲缘关系近。【结论】所获得的8个基因拷贝即为来自于甘蓝型油菜ADC基因的片段。
关键词
甘蓝型油菜
精氨酸脱羧酶(ADC)基因
同源克隆
序列分析
Keywords
Brassica napus L.
arginine decarboxylase(ADC) gene
homologous cloning
sequence analysis
分类号
S635 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国花生核心种质中高油酸材料的分布和遗传多样性
任小平
廖伯寿
张晓杰
雷永
黄家权
晏立英
陈玉宁
姜慧芳
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
19
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职称材料
2
水培条件下花生对缺铁的生理反应
任小平
姜慧芳
黄家权
张晓杰
廖伯寿
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
10
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职称材料
3
青枯菌诱导的花生基因表达谱SSH分析
吕建伟
姜慧芳
黄家权
彭文舫
陈玉宁
李正强
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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职称材料
4
Ac/Ds系统及其在油菜突变体库构建中的应用策略
洪林
闫晓红
刘正富
魏文辉
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
4
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职称材料
5
高等植物基因克隆的策略
洪林
程昌凤
魏文辉
陈霞
谭平
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2013
2
在线阅读
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职称材料
6
甘蓝型油菜ADC基因片段的克隆及序列分析
洪林
闫晓红
李晨
刘正富
魏文辉
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
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