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棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析
1
作者
杨笑敏
王俊娟
+8 位作者
王德龙
陆许可
陈修贵
郭丽雪
王帅
陈超
王晓歌
韩明格
叶武威
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期11-16,共6页
通过构建棉花GhDMT3的VIGS沉默载体并侵染棉花,探究该基因在棉花和高等植物中的功能。采用生物信息学方法对棉花DNA甲基转移酶基因GhDMT3(CotAD_46796)的DNA序列结构特性、该基因编码的蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等方面进...
通过构建棉花GhDMT3的VIGS沉默载体并侵染棉花,探究该基因在棉花和高等植物中的功能。采用生物信息学方法对棉花DNA甲基转移酶基因GhDMT3(CotAD_46796)的DNA序列结构特性、该基因编码的蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等方面进行分析。克隆该基因,并构建pYL156:GhDMT3沉默载体。蛋白质相对分子质量为71 107.02 kD,等电点为4.85,不稳定系数为36.33。不同胁迫处理(冷、干旱)VIGS沉默GhDMT3的棉花幼苗表现出明显的表型差异。qRT-PCR的表达模式分析发现,不同胁迫下p YL156侵染的棉花中不同部位表达量没有变化,用pYL156:GhDMT3侵染过的棉花中GhDMT3转录水平与对照相比明显下降。与未沉默GhDMT3的棉花幼苗相比,沉默GhDMT3的棉花幼苗抗逆性显著增强。
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关键词
陆地棉
GhDMT3
生物信息学分析
VIGS沉默
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职称材料
题名
棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析
1
作者
杨笑敏
王俊娟
王德龙
陆许可
陈修贵
郭丽雪
王帅
陈超
王晓歌
韩明格
叶武威
机构
中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室农业部棉花遗传改良重点开放实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期11-16,共6页
基金
国家重点研发计划(2018YFD0100401)
文摘
通过构建棉花GhDMT3的VIGS沉默载体并侵染棉花,探究该基因在棉花和高等植物中的功能。采用生物信息学方法对棉花DNA甲基转移酶基因GhDMT3(CotAD_46796)的DNA序列结构特性、该基因编码的蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等方面进行分析。克隆该基因,并构建pYL156:GhDMT3沉默载体。蛋白质相对分子质量为71 107.02 kD,等电点为4.85,不稳定系数为36.33。不同胁迫处理(冷、干旱)VIGS沉默GhDMT3的棉花幼苗表现出明显的表型差异。qRT-PCR的表达模式分析发现,不同胁迫下p YL156侵染的棉花中不同部位表达量没有变化,用pYL156:GhDMT3侵染过的棉花中GhDMT3转录水平与对照相比明显下降。与未沉默GhDMT3的棉花幼苗相比,沉默GhDMT3的棉花幼苗抗逆性显著增强。
关键词
陆地棉
GhDMT3
生物信息学分析
VIGS沉默
Keywords
Gossypium hirsutum L.
GhDMT3
bioinformatics analysis
VIGS silencing
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析
杨笑敏
王俊娟
王德龙
陆许可
陈修贵
郭丽雪
王帅
陈超
王晓歌
韩明格
叶武威
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
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