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水牛FADS2基因的电子克隆及序列分析
被引量：
4
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作者
马小娅
庞春英
+5 位作者
梁莎莎
陆杏蓉
朱鹏
段安琴
梁贤威
邓廷贤
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017年第10期2829-2836,共8页
试验旨在利用电子克隆法对水牛Δ6脂肪酸脱氢酶(Δ6-fatty acid desaturases,FADS2)基因进行克隆和生物信息学分析,为探究FADS2基因对水牛泌乳性能的作用机制奠定基础。以奶牛FADS2基因序列(Gen Bank登录号:NM_001083444.1)为探针设计引...
试验旨在利用电子克隆法对水牛Δ6脂肪酸脱氢酶(Δ6-fatty acid desaturases,FADS2)基因进行克隆和生物信息学分析,为探究FADS2基因对水牛泌乳性能的作用机制奠定基础。以奶牛FADS2基因序列(Gen Bank登录号:NM_001083444.1)为探针设计引物,利用电子克隆法克隆水牛FADS2基因,并通过RT-PCR验证,对FADS2基因的序列特征进行生物信息学分析。测序结果表明,水牛FADS2基因序列全长为36 600 bp,由12个外显子和11个内含子组成,包含一个长1 335 bp的开放阅读框,可编码444个氨基酸。序列同源性分析显示,水牛FADS2基因编码序列与牦牛、黄牛、人、猪、家兔、虎鲸和褐家鼠序列的同源性分别为98.88%、98.88%、89.66%、90.79%、90.85%、92.35%和87.11%。蛋白质预测分析表明,水牛FADS2蛋白分子质量为52.51 ku,理论等电点(p I)为8.75,呈弱碱性,属于亲水性蛋白,无信号肽。系统进化树分析结果表明,FADS2基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性,其中水牛与牦牛、黄牛亲缘关系较近,与褐家鼠亲缘关系较远。水牛FADS2基因的成功克隆为今后阐明水牛泌乳性能的作用机制奠定了基础。
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关键词
水牛
FADS2基因
电子克隆
生物信息学分析
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题名
水牛FADS2基因的电子克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
马小娅
庞春英
梁莎莎
陆杏蓉
朱鹏
段安琴
梁贤威
邓廷贤
机构
中国农业科学院
广西
水牛
研究所
、农业部
(
广西
)
水牛
遗传
繁育
重点
实验室
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017年第10期2829-2836,共8页
基金
广西科技重大专项(桂科AA16450002)
广西科技公关国合项目(桂科合1504001-3)
+1 种基金
广西自然科学基金青年项目(2015GXNSFBA139103)
广西水产畜牧科技推广应用项目(桂渔牧科201633009)
文摘
试验旨在利用电子克隆法对水牛Δ6脂肪酸脱氢酶(Δ6-fatty acid desaturases,FADS2)基因进行克隆和生物信息学分析,为探究FADS2基因对水牛泌乳性能的作用机制奠定基础。以奶牛FADS2基因序列(Gen Bank登录号:NM_001083444.1)为探针设计引物,利用电子克隆法克隆水牛FADS2基因,并通过RT-PCR验证,对FADS2基因的序列特征进行生物信息学分析。测序结果表明,水牛FADS2基因序列全长为36 600 bp,由12个外显子和11个内含子组成,包含一个长1 335 bp的开放阅读框,可编码444个氨基酸。序列同源性分析显示,水牛FADS2基因编码序列与牦牛、黄牛、人、猪、家兔、虎鲸和褐家鼠序列的同源性分别为98.88%、98.88%、89.66%、90.79%、90.85%、92.35%和87.11%。蛋白质预测分析表明,水牛FADS2蛋白分子质量为52.51 ku,理论等电点(p I)为8.75,呈弱碱性,属于亲水性蛋白,无信号肽。系统进化树分析结果表明,FADS2基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性,其中水牛与牦牛、黄牛亲缘关系较近,与褐家鼠亲缘关系较远。水牛FADS2基因的成功克隆为今后阐明水牛泌乳性能的作用机制奠定了基础。
关键词
水牛
FADS2基因
电子克隆
生物信息学分析
Keywords
buffalo
FADS2 gene
in-Silico cloning
bioinformatics analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
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被引量
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1
水牛FADS2基因的电子克隆及序列分析
马小娅
庞春英
梁莎莎
陆杏蓉
朱鹏
段安琴
梁贤威
邓廷贤
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017
4
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