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3株鸭肝炎病毒Ⅰ型结构基因VP1的克隆及序列分析
被引量:
10
1
作者
甘一迪
刘家森
+6 位作者
姜骞
郭东春
司昌德
孟庆文
韩凌霞
刘娣
曲连东
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期952-957,共6页
通过RT-PCR方法扩增鸭肝炎病毒DHV-1:161/79/V、YH、HN株的VP1基因的核苷酸序列。系统发育分析表明,3株病毒与已发表的DHV-1结构基因VP1核苷酸和氨基酸的同源性分别为92.7%~96.9%和95.4%~96.6%,与DHV-1变异株核苷酸和氨基酸序列的相似...
通过RT-PCR方法扩增鸭肝炎病毒DHV-1:161/79/V、YH、HN株的VP1基因的核苷酸序列。系统发育分析表明,3株病毒与已发表的DHV-1结构基因VP1核苷酸和氨基酸的同源性分别为92.7%~96.9%和95.4%~96.6%,与DHV-1变异株核苷酸和氨基酸序列的相似性均分别低于75%和88%,表明3株病毒属于DHV-1,与变异株是不同的血清型。强毒DHV-1:161/79/V的VP1蛋白第49和第183位氨基酸为T和H,弱毒DHV-1:YH、HN为S和Q,推测这2处位点的改变可能与病毒的强弱有关 DHV-1和其变异株的VP1蛋白均没有保守的RGD序列 变异株N-DHV:90D、04G在第50和51位比DHV-1多2个氨基酸(Q和D),在第147和185位各缺失1个氨基酸(E和L),而在变异株DHV:AP-03337、AP-04009、AP-04114、AP-04203的第145和146位比DHV-1多了2个氨基酸(G、G) 不同血清型的鸭肝炎病毒在46-64位、95-149位、180-223位抗原指数差别较大,推测这些位点的改变可能影响病毒的生物学特性。
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关键词
鸭肝炎病毒(DHV)
VP1基因
序列分析
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题名
3株鸭肝炎病毒Ⅰ型结构基因VP1的克隆及序列分析
被引量:
10
1
作者
甘一迪
刘家森
姜骞
郭东春
司昌德
孟庆文
韩凌霞
刘娣
曲连东
机构
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/实验动物中心
黑龙江省
农业
科学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期952-957,共6页
基金
黑龙江省科技计划项目(GC06TS102)
文摘
通过RT-PCR方法扩增鸭肝炎病毒DHV-1:161/79/V、YH、HN株的VP1基因的核苷酸序列。系统发育分析表明,3株病毒与已发表的DHV-1结构基因VP1核苷酸和氨基酸的同源性分别为92.7%~96.9%和95.4%~96.6%,与DHV-1变异株核苷酸和氨基酸序列的相似性均分别低于75%和88%,表明3株病毒属于DHV-1,与变异株是不同的血清型。强毒DHV-1:161/79/V的VP1蛋白第49和第183位氨基酸为T和H,弱毒DHV-1:YH、HN为S和Q,推测这2处位点的改变可能与病毒的强弱有关 DHV-1和其变异株的VP1蛋白均没有保守的RGD序列 变异株N-DHV:90D、04G在第50和51位比DHV-1多2个氨基酸(Q和D),在第147和185位各缺失1个氨基酸(E和L),而在变异株DHV:AP-03337、AP-04009、AP-04114、AP-04203的第145和146位比DHV-1多了2个氨基酸(G、G) 不同血清型的鸭肝炎病毒在46-64位、95-149位、180-223位抗原指数差别较大,推测这些位点的改变可能影响病毒的生物学特性。
关键词
鸭肝炎病毒(DHV)
VP1基因
序列分析
Keywords
duck hepatitis virus(DHV)
VP1 gene
sequence analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
3株鸭肝炎病毒Ⅰ型结构基因VP1的克隆及序列分析
甘一迪
刘家森
姜骞
郭东春
司昌德
孟庆文
韩凌霞
刘娣
曲连东
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
10
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