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鸭源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的分离鉴定及其HA和NA基因的生物信息分析
被引量：
2
1
作者
孙恩成
刘春国
+2 位作者
侯喜林
刘明
朴范泽
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2009年第2期62-67,共6页
分离到1株H5N1亚型高致病性禽流感病毒,经序列测定发现HA蛋白裂解位点上插入多个连续的碱性氨基酸(-PQREIRRKKR*G-),从分子上证实是一株高致病性禽流感病毒。核酸序列比较分析结果表明,分离的流感病毒HA基因与A/duck/VietNam/Ncvd1/2002...
分离到1株H5N1亚型高致病性禽流感病毒,经序列测定发现HA蛋白裂解位点上插入多个连续的碱性氨基酸(-PQREIRRKKR*G-),从分子上证实是一株高致病性禽流感病毒。核酸序列比较分析结果表明,分离的流感病毒HA基因与A/duck/VietNam/Ncvd1/2002(H5N1)同源率最高,达到98.8%;NA基因与A/duck/VietNam/Ncvd1/2002(H5N1)和A/chicken/Jiangsu/cz1/2002(H5N1)同源率最高,达到98.7%。氨基酸水平上,HA与A/duck/Viet Nam/Ncvd1/2002(H5N1)同源率最高,可达99.3%;NA与A/chicken/Jiangsu/cz1/2002(H5N1)同源率最高,达98.7%。HA与NA基因的潜在糖基化位点与作者所选参比毒株一致。通过遗传进化树分析结果表明,A/duck/VietNam/Ncvd1/2002(H5N1)可能是该毒株的来源株。
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关键词
禽流感病毒
血凝素基因
神经氨酸酶基因
生物信息分析
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题名
鸭源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的分离鉴定及其HA和NA基因的生物信息分析
被引量：
2
1
作者
孙恩成
刘春国
侯喜林
刘明
朴范泽
机构
黑龙江八一农垦大学动物科技
学院
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室禽流感国家参考实验室
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2009年第2期62-67,共6页
基金
国家“十一五”科技支撑计划资助项目(2006BAD06A05)
黑龙江省自然科学基金项目(ZJN-0702-02)
文摘
分离到1株H5N1亚型高致病性禽流感病毒,经序列测定发现HA蛋白裂解位点上插入多个连续的碱性氨基酸(-PQREIRRKKR*G-),从分子上证实是一株高致病性禽流感病毒。核酸序列比较分析结果表明,分离的流感病毒HA基因与A/duck/VietNam/Ncvd1/2002(H5N1)同源率最高,达到98.8%;NA基因与A/duck/VietNam/Ncvd1/2002(H5N1)和A/chicken/Jiangsu/cz1/2002(H5N1)同源率最高,达到98.7%。氨基酸水平上,HA与A/duck/Viet Nam/Ncvd1/2002(H5N1)同源率最高,可达99.3%;NA与A/chicken/Jiangsu/cz1/2002(H5N1)同源率最高,达98.7%。HA与NA基因的潜在糖基化位点与作者所选参比毒株一致。通过遗传进化树分析结果表明,A/duck/VietNam/Ncvd1/2002(H5N1)可能是该毒株的来源株。
关键词
禽流感病毒
血凝素基因
神经氨酸酶基因
生物信息分析
Keywords
avian influenza virus
HA gene
NA gene
biological information analysis
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸭源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的分离鉴定及其HA和NA基因的生物信息分析
孙恩成
刘春国
侯喜林
刘明
朴范泽
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2009
2
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