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一株野鸟源H3N8亚型流感病毒分离株的全基因组序列分析
被引量：
3
1
作者
兰玲
王涛
+3 位作者
王晶
程子兵
邓国华
陈化兰
《中国动物检疫》
CAS
2016年第4期77-79,93,共4页
本研究对2014年从新疆额敏县分离到的一株野鸟源H3N8亚型流感病毒A/wild bird/Xinjiang/S3525/2014(H3N8)进行了全基因序列和进化分析。序列分析显示,HA裂解位点序列为^(339)PEKQTR-GLFG^(348),为典型的低致病性禽流感病毒特征,NA基因具...
本研究对2014年从新疆额敏县分离到的一株野鸟源H3N8亚型流感病毒A/wild bird/Xinjiang/S3525/2014(H3N8)进行了全基因序列和进化分析。序列分析显示,HA裂解位点序列为^(339)PEKQTR-GLFG^(348),为典型的低致病性禽流感病毒特征,NA基因具有6个潜在的糖基化位点,与病毒株A/mallard/Czech Republic/14333-1K/2011(H3N8)核苷酸高度同源(97.7%)。该毒株的内部基因来源较复杂,其PB1、NP基因分别与A/ruddy shell duck/Mongolia/921C2/2009(H7N1)和A/wild duck/Korea/MHC39-26/2011(H7N9)的同源性最高,其余内部基因与H2、H3、H6、H7等亚型禽流感病毒分离株同源性最高,呈现明显的异源性。除PB2基因外,其余基因片段均来源于野鸟源禽流感病毒。
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关键词
流感病毒
H3N8亚型
基因组分析
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题名
一株野鸟源H3N8亚型流感病毒分离株的全基因组序列分析
被引量：
3
1
作者
兰玲
王涛
王晶
程子兵
邓国华
陈化兰
机构
新疆
动物
卫生监督所
塔城市
动物
疫控中心
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所/兽医生物技术国家重点实验室/农业部动物流感重点实验室
出处
《中国动物检疫》
CAS
2016年第4期77-79,93,共4页
基金
国家科技攻关项目(KJYJ-2013-01-01)
文摘
本研究对2014年从新疆额敏县分离到的一株野鸟源H3N8亚型流感病毒A/wild bird/Xinjiang/S3525/2014(H3N8)进行了全基因序列和进化分析。序列分析显示,HA裂解位点序列为^(339)PEKQTR-GLFG^(348),为典型的低致病性禽流感病毒特征,NA基因具有6个潜在的糖基化位点,与病毒株A/mallard/Czech Republic/14333-1K/2011(H3N8)核苷酸高度同源(97.7%)。该毒株的内部基因来源较复杂,其PB1、NP基因分别与A/ruddy shell duck/Mongolia/921C2/2009(H7N1)和A/wild duck/Korea/MHC39-26/2011(H7N9)的同源性最高,其余内部基因与H2、H3、H6、H7等亚型禽流感病毒分离株同源性最高,呈现明显的异源性。除PB2基因外,其余基因片段均来源于野鸟源禽流感病毒。
关键词
流感病毒
H3N8亚型
基因组分析
Keywords
influenza virus subtype
H3N8 subtype
genome analysis
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株野鸟源H3N8亚型流感病毒分离株的全基因组序列分析
兰玲
王涛
王晶
程子兵
邓国华
陈化兰
《中国动物检疫》
CAS
2016
3
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