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基于宏基因组测序的植物叶表微生物富集及DNA提取方法
被引量：
2
1
作者
张雨函
范熠
+4 位作者
李婷婷
庞爽
刘为
白可喻
张西美
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期256-263,共8页
获得高质量的微生物基因组DNA是进行复杂微生物群落宏基因组学研究的基础和难点。植物叶表是一个微生物多样性丰富的复杂生态系统,这些微生物群落可以调节叶片功能性状,影响植物的适应性。深入了解叶表微生物群落的基本结构和功能原理,...
获得高质量的微生物基因组DNA是进行复杂微生物群落宏基因组学研究的基础和难点。植物叶表是一个微生物多样性丰富的复杂生态系统,这些微生物群落可以调节叶片功能性状,影响植物的适应性。深入了解叶表微生物群落的基本结构和功能原理,有助于在促进植物生长和植物保护方面发挥重要的应用价值。由于叶表严苛的环境,导致富集叶表微生物难度较大,严重限制了高质量叶表微生物基因组DNA的提取。基于现有DNA提取方法,加入表面活性剂Silwet L-77进行前处理,同时循环利用洗脱液,加强叶表微生物的富集,以提高叶表微生物的获取量。结合商业试剂盒方法进行提取得到高纯度、高浓度的基因组DNA。经过质量控制和建库测序验证,DNA质量达到宏基组建库的要求。通过此方法可以提高叶表微生物分离和收集效率的方法,提高叶表微生物DNA提取成功率,为应用高通量测序技术研究叶表微生物组成和其他植物分子生物学研究提供参考。
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关键词
叶表微生物
Silwet
L-77
DNA提取
宏基因组测序
质量控制
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职称材料
题名
基于宏基因组测序的植物叶表微生物富集及DNA提取方法
被引量：
2
1
作者
张雨函
范熠
李婷婷
庞爽
刘为
白可喻
张西美
机构
中国农业科学院
农业
环境与可持续发展
研究所
中国农业科学院农业资源与农业区划研究所国际生物多样性中心东亚办事处
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期256-263,共8页
基金
国家自然科学基金项目(32071547)。
文摘
获得高质量的微生物基因组DNA是进行复杂微生物群落宏基因组学研究的基础和难点。植物叶表是一个微生物多样性丰富的复杂生态系统,这些微生物群落可以调节叶片功能性状,影响植物的适应性。深入了解叶表微生物群落的基本结构和功能原理,有助于在促进植物生长和植物保护方面发挥重要的应用价值。由于叶表严苛的环境,导致富集叶表微生物难度较大,严重限制了高质量叶表微生物基因组DNA的提取。基于现有DNA提取方法,加入表面活性剂Silwet L-77进行前处理,同时循环利用洗脱液,加强叶表微生物的富集,以提高叶表微生物的获取量。结合商业试剂盒方法进行提取得到高纯度、高浓度的基因组DNA。经过质量控制和建库测序验证,DNA质量达到宏基组建库的要求。通过此方法可以提高叶表微生物分离和收集效率的方法,提高叶表微生物DNA提取成功率,为应用高通量测序技术研究叶表微生物组成和其他植物分子生物学研究提供参考。
关键词
叶表微生物
Silwet
L-77
DNA提取
宏基因组测序
质量控制
Keywords
microorganism on leaf surface
Silwet L-77
DNA extraction
metagenome sequencing
quality control
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于宏基因组测序的植物叶表微生物富集及DNA提取方法
张雨函
范熠
李婷婷
庞爽
刘为
白可喻
张西美
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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